| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779_cfb | = 3750590 | 0 (0.000) | 129 (1.090) | 106/426 | 0.2 | 100% | intergenic (‑104/‑69) | tnaA/insH_14 | tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase,PLP‑dependent/IS5 element protein |
| ? | NC_007779_cfb | 3751790 = | 0 (0.000) | intergenic (+151/+116) | insH_14/tnaC | IS5 element protein/tryptophanase leader peptide | |||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
AAACGATAACCAACTGGCGATGTTATTCACGCTGGCCAACCTGTTTCGGGCGGACCAAATGATACGTCAGTGGGAGAGATCTCACTAAAAACTGGGGATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGCACTTATCCTCGCAAGACACGAGGCTACATTATTACACTCAGAGTTTTTGTCT > NC_007779_cfb/3751552‑3752037 | tcttcgctatccagcaggaacgggttcataccggatttaataattgcctcttcacgataagcgcgagtggtacgttttactggctcaataacacgaatgcggaacggttcagggagatgtttaaagttttccattacataatccttcatttattttaattacagtgatccctgtgaatattacatctgctataccgattaattcgccagatatatatgcaagcaccatcatttactaaAACAAGtaaata < 1:540334‑M2/12‑1 (MQ=255) gggttcataccggatttaataattgcctcttcacgataagcgcgagtggtacgttttactggctcaataacacgaatgcggaacggttcagggagatgtttaaagttttccattacataatccttcatttattttaattacagtgatccctgtgaatattacatctgctataccgattaattcgccagatatatatgcaagcaccatcatttactaaAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCaa > 1:251683‑M2/218‑250 (MQ=255) cggatttaataattgcctcttcacgataagcgcgagtggtacgttttactggctcaataacacgaatgcggaacggttcagggagatgtttaaagttttccattacataatccttcatttattttaattacagtgatccctgtgaatattacatctgctataccgattaattcgccagatatatatgcaagcaccatcatttactaaAACAAGTAAATAAACGAGCGATGACCTTTGCAAAAGNNANAAt > 2:958642‑M2/208‑250 (MQ=255) ggatgtaataattgcctcttcacgataagcgcgagtggtacgttttactggctcaataacacgaatgcggaacggttcagggagatgtttaaagttttccattacataatccttcatttattttaattacagtgatccctgtgaatattacatctgctataccgattaattcgccagatatatatgcaagcaccatcatttactaaAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAAtt < 2:321605‑M2/44‑1 (MQ=255) taataattgcctcttcacgataagcgcgagtggtacgttttactggatcaataacacgaatgcggaacggttcagtgagatgtttaaagttttccattacataatccttcatttattttaattacagtgatccctgtgaatattacatctgctataccgattaattcgccagatatatatgcaagcaccatcatttactaaAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCa < 2:813001‑M2/32‑1 (MQ=255) ataattgcctcttcacgataagcgcgagtggtacgttttactggctcaataacacgaatgcggaacggttcggggagatgtttaaagttttccattacataatccttcatttattttaattacagtgatccctgtgaatattacatctgctataccgattaattcgccagatatatatgcaagcaccatcatttactaaAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGatat > 2:62628‑M2/200‑250 (MQ=255) taactgccccttaacgataagcgctagtggtacgtattactggctcaataacacgaatgcggaacggttcagggagatgtttaaagttttccattacatagtccttcatttattttaattacagtggtacctgtgaatattacaactgctataccgagtaattcgccagatatagatgcaagcagcatcatttactaaAACAAGTAAAGAAACGAGAGATGACCTGTGCAAAAGGCAAAATTAAGAtgta < 2:9324‑M2/52‑1 (MQ=255) 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< 1:1307167‑M2/88‑1 (MQ=255) tactggctcaataacacgaatgcggaacggttcagggagatgtttaaagttttccattacataatccttcatttattttaattacagtgatccctgtgaatattacatctgctataccgattaattcgccagatatatatgcaagcaccatcatttactaaAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTgg > 1:98078‑M2/162‑250 (MQ=255) actggctcaataacacgaatgcggaacggttcagggagatgtttaaagttttccattacataatccttcatttattttaattacagtgatccctgtgaatattacatctgctataccgattaattcgccagatatatatgcaagcaccatcatttactaaAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGc < 1:958642‑M2/90‑1 (MQ=255) tggctcaataacacgaatgcggaacggttcagggagatgtttaaggttttccattacataatccttcatttattttaattacagtgatccctgtgaatattacatctgctataccgattaattcgccagatatatatgcaagcaccatcatttactaaAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGctc > 1:420257‑M2/159‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |