| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779_cfb | 4056220 = | NA (NA) | 142 (1.170) | 118/434 | 0.1 | 95.3% | intergenic (‑209/+15) | yrhD/insB | Gene added/IS1 transposase InsAB' |
| ? | NC_007779_cfb | 4357350 = | 7 (0.060) | coding (89/297 nt) | yjdK | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 291 total aligned reads displayed.
GGGTAGGGGGATGCACAAAGAATGGGCAGAGAGCGCGTTTTTTTGTCCCAAGTCATCCCCTTTACTGAGCAAAAAAAAGAATATCTCCTATATGAGAATCATCAATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCTTTTGATTATCCATCATCTTATTCCTCAGTGTTCTTAAGATTAAGATCATTGATGTATGATATGAATTTCTCCTCTATCGTGGCTGATGAATATGGGATACCACGACAATTGAATGAAAACTCCTTCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTAT > NC_007779_cfb/4357101‑4357595 | tcaccctttgacgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattacct < 1:1003635‑M2/1‑1 (MQ=255) ggTAGGGGGATGCACAAAGAATGGGCAGAGAGCGCGTTTTTTTGTCCCAAGTCATCCCCTTTACTGAGCAAAAAAAAGAATATCTCCTATATGAGAATCATCAATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCTTTTGATTATCCATCATCTTATTCCTCAGTGTTCTTAAGATTAAGATCATTg < 2:667789/250‑1 (MQ=255) gggATGCACAAAGAATGGGCAGAGAGCGCGTTTTTTTGTCCCAAGTCATCCCCTTTACTGAGCAAAAAAAAGAATATCTCCTATATGAGAATCATCAATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCTTTTGATTATCCATCATCTTATTCCTCAGTGTTCTTAAGATTAAGATCATTGATGtat < 1:109125/250‑1 (MQ=255) gggATGCACAAAGAATGGGCAGAGAGCGCGTTTTTTTGTCCCAAGTCATCCCCTTTACTGAGCAAAAAAAAGAATATCTCCTATATGAGAATCATCAATCGGGGTTAATAAGTTTTGCGTCCCCAGAGCGTTTAATATTGATAGGAGTCATATTATGGAAGGTAAAAACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCTTTTGATTATCCATCATCTTATTCCTCAGTGTTCTTAAGATTAAGATCATTGATGtat < 1:552853/250‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |