New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779_cfb | 4056220 = | NA (NA) | 133 (1.100) | 117/434 | 0.1 | 95.7% | intergenic (‑209/+15) | yrhD/insB | Gene added/IS1 transposase InsAB' |
? | NC_007779_cfb | = 4365911 | 6 (0.050) | coding (702/1539 nt) | cadC | DNA‑binding transcriptional activator |
Only 100 of 279 total aligned reads displayed.
GGTTGGTTTAACGCTTTTGATAAACTCTCCAGTAAATCATTTTGAATCGCCAGCTGATTACCGTTAGTGATGACATAACGTTTATCCAGCATGGTTGAACCATCTGCATTGTCTACCAATTTTATCGACATAAAGCATTGTTGAGCACGGTATTGGCGCTGATTAACAAACGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAGGAAGACGTGTATCAAGACTTGAAAACGCTACCAGTGCTACACAGATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTA > NC_007779_cfb/4365663‑4366160 | ttcatggccatatcaatgattttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGgaga > 1:272416‑M2/241‑250 (MQ=255) ggttggctTAACGCTTTTGATAAACTCTCCAGTAAATCATTTTGAATCGCCAGCTGATTACCGTTAGTGATGACATAACGTTTATCCAGCATGGCTGAACCATCTGCATTGTCTACCAATTTTATCGACATAAAGCATTGTTGAGCACGGTATTGGCGCTGATTAACAAACGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGg < 2:548821‑M2/250‑2 (MQ=255) catggccatatcaatgattttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAg > 1:228801‑M2/239‑250 (MQ=255) tttAACGCTTTTGATAAACTCTCCAGTAAATCATTTTGAATCGCCAGCTGATTACCGTTAGTGATGACATAACGTTTATCCAGCATGGTTGAACCATCTGCATTGTCTACCAATTTTATCGACATAAAGCATTGTTGAGCACGGTATTGGCGCTGATTAACAAACGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatg > 1:18025‑M2/1‑243 (MQ=255) atatcaatgattttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTaa < 1:1029483‑M2/19‑1 (MQ=255) tatcaatgcttttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgacatgttttacggcagtgagagcagcgagagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgaaccaccccgccagtagatggaccggcgggaccactgatagaaacagaaagcactggagcacatcaaaaacaccaccatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCCGGTGGTGAAGGGGTtaaa > 2:137519‑M2/231‑249 (MQ=255) tatcaatgattttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgacagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAg < 1:1261263‑M2/20‑1 (MQ=255) aatgattttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctccaatacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGAt < 2:1394244‑M2/24‑1 (MQ=255) tAAACTCTCCAGTAAATCATTTTGAATCGCCAGCTGATTACCGTTAGTGATGACATAACGTTTATCCAGCATGGTTGAACCATCTGCATTGTCTACCAATTTTATCGACATAAAGCATTGTTGAGCACGGTATTGGCGCTGATTAACAAACGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattg > 2:389105‑M2/1‑229 (MQ=255) tctcCAGTAAATCATTTTGAATCGCCAGCTGATTACCGTTAGTGATGACATAACGTTTATCCAGCATGGTTGAACCATCTGCATTGTCTACCAATTTTATCGACATAAAGCATTGTTGAGCACGGTATTGGCGCTGATTAACAAACGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagt < 1:1345384‑M2/250‑27 (MQ=255) tgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAAt < 1:476291‑M2/37‑1 (MQ=255) tgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAAt < 2:340980‑M2/37‑1 (MQ=255) accgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCAccc > 2:1136313‑M2/209‑250 (MQ=255) agcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGgt < 1:16184‑M2/14‑1 (MQ=255) aGCTGATTACCGTTAGTGATGACATAACGTTTATCCAGCATGGTTGAACCATCTGCATTGTCTACCAATTTTATCGACATAAAGCATTGTTGAGCACGGTATTGGCGCTGATTAACAAACGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcncgaan < 2:799934‑M2/250‑53 (MQ=255) tgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACg > 1:769982‑M2/181‑250 (MQ=255) gaCATAACGTTTATCCAGCATGGTTGAACCATCTGCATTGTCTACCAATTTTATCGACATAAAGCATTGTTGAGCACGGTATTGGCGCTGATTAACAAACGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccac < 1:238551‑M2/250‑73 (MQ=255) cATAACGTTTATCCAGCATGGTTGAACCATCTGCATTGTCTACCAATTTTATCGACATAAAGCATTGTTGAGCACGGTATTGGCGCTGATTAACAAACGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttc > 2:1031871‑M2/1‑176 (MQ=255) tacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGaa < 2:1088754‑M2/75‑1 (MQ=255) tacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGaa > 1:1088754‑M2/165‑239 (MQ=255) acggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacggctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTa < 1:1177633‑M2/87‑1 (MQ=255) aCGTTTATCCAGCATGGTTGAACCATCTGCATTGTCTACCAATTTTATCGACATAAAGCATTGTTGAGCACGGTATTGGCGCTGATTAACAAACGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattt < 1:1318574‑M2/250‑79 (MQ=255) cAGCATGGTTGAACCATCTGCATTGTCTACCAATTTTATCGACATAAAGCATTGTTGAGCACGGTATTGGCGCTGATTAACAAACGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgca < 1:60300‑M2/228‑66 (MQ=255) agatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCa > 2:1256681‑M2/148‑250 (MQ=255) gatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCat > 2:198126‑M2/147‑250 (MQ=255) aCCATCTGCATTGTCTACCAATTTTATCGACATAAAGCATTGTTGAGCACGGTATTGGCGCTGATTAACAAACGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatg > 1:1065113‑M2/1‑151 (MQ=255) gCATTGTCTACCAATTTTATCGACATAAAGCATTGTTGAGCACGGTATTGGCGCTGATTAACAAACGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcggc > 2:16392‑M2/1‑144 (MQ=255) ccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAatat < 1:798648‑M2/118‑1 (MQ=255) cggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATc < 1:1297499‑M2/119‑1 (MQ=255) ggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATcg < 2:143019‑M2/120‑1 (MQ=255) cTACCAATNTTATCGACATAAAGCATTGTTGAGCACGGTATTGGCGCTGATTAACAAACGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgcca > 2:675950‑M2/1‑137 (MQ=255) tttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTg > 2:683744‑M2/122‑250 (MQ=255) ttATCGACATAAAGCATTGTTGAGCACGGTATTGGCGCTGATTAACAAACGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgacagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcc > 2:597843‑M2/1‑128 (MQ=255) gcctaaacgcacccccccgtcagtagctgaacagtatggacagctgatagaaaaggaagacactgtagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagtaagcagcatctccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGACACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACAGGAAACTACAGCTGTTACAGCTTTTATTTTCCAGATTAATGTCAATATCGCGTGGattgttc < 2:118028‑M2/132‑4 (MQ=255) aTCGACATAAAGCATTGTTGAGCACGGTATTGGCGCTGATTAACAAACGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatg > 1:565822‑M2/1‑126 (MQ=255) aTAAAGCATTGTTGAGCACGGTATTGGCGCTGATTAACAAACGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattc < 2:1073843‑M2/250‑131 (MQ=255) cATTGTTGAGCACGGTATTGGCGCTGATTAACAAACGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggtta > 1:971853‑M2/1‑114 (MQ=255) cATTGTTGAGCACGGTATTGGCGCTGATTAACAAACGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggtta < 2:561434‑M2/250‑137 (MQ=255) ccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCgatct < 1:198126‑M2/146‑3 (MQ=255) ccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGc < 1:503378‑M2/148‑1 (MQ=255) gtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGCTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAAtcg < 1:448474‑M2/39‑2 (MQ=255) cagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTcc < 2:1037067‑M2/79‑1 (MQ=255) gtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAg > 1:4235‑M2/97‑250 (MQ=255) gCACGGTATTGGCGCTGATTAACAAACGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtccca < 2:284211‑M2/209‑105 (MQ=255) ggTATTGGCGCTGATTAACAAACGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattc > 1:902320‑M2/1‑101 (MQ=255) ctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAGGAAg < 1:683744‑M2/158‑1 (MQ=255) aggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAGGAAGACgt < 2:628378‑M2/162‑1 (MQ=255) gcgcTGATTAACAAACGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtg < 2:1296502‑M2/204‑111 (MQ=255) ggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTGCCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAGGAAGACGTGTATCaa < 1:553048‑M2/169‑1 (MQ=255) tAACAAACGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttatcgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgct > 1:62394‑M2/1‑86 (MQ=255) agctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATcg > 1:1033909‑M2/78‑197 (MQ=255) aaCGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgat < 2:1123469‑M2/157‑77 (MQ=255) aaCGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgat > 1:1123469‑M2/1‑81 (MQ=255) agaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAGGAAGACGTGTATCAAGACTTGAAAAc < 2:4235‑M2/180‑1 (MQ=255) gCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctga < 1:432043‑M2/248‑171 (MQ=255) gATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgc < 1:383991‑M2/250‑179 (MQ=255) gccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATcg > 1:636365‑M2/61‑180 (MQ=255) ccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAGGAAGACGTGTATCAAGACtt < 2:725049‑M2/174‑1 (MQ=255) actggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCaa < 1:1375831‑M2/134‑1 (MQ=255) tttACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtc < 2:234317‑M2/165‑102 (MQ=255) tACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttccct < 2:427037‑M2/250‑189 (MQ=255) cGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcggcttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggtta > 1:918542‑M2/1‑59 (MQ=255) cGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttca > 2:1347344‑M2/1‑59 (MQ=255) cGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggtta < 2:918542‑M2/195‑137 (MQ=255) acctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAGGAAGACGTGTATCAAGACTTGAAAACGCTACCAGTGCTACACAGATa < 2:767425‑M2/201‑1 (MQ=255) aaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAGGAAGACGTGTATCAAGACTTGAAAACGCTACCAGTGCTacac > 1:653663‑M2/43‑238 (MQ=255) aaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAGGAAGACGTGTATCAAGACTTGAAAACGCTACCAGTGCTacac < 2:653663‑M2/196‑1 (MQ=255) aacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAGGAAGACGTGTATCAAGACTTGaaaa < 2:848244‑M2/179‑1 (MQ=255) aacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGAGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAGGAAGACGTGTATCAAGACTTGaaaa > 1:848244‑M2/42‑220 (MQ=255) caccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACTATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAAt > 1:345431‑M2/40‑176 (MQ=255) tcatcaATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatac > 1:92556‑M2/1‑45 (MQ=255) acactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAGGAAGACGTGTATCAAGACTTGAAAACGCTACCAGTGCTACACAGATACCTa < 2:935751‑M2/205‑1 (MQ=255) acactaaatcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAGGAAGACGTGTATCAAGACTTGAAAACGCTACCAGTGCTACACAGATACCTa > 1:935751‑M2/31‑235 (MQ=255) aTGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtata > 1:1118245‑M2/1‑39 (MQ=255) tgtAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagc < 2:926615‑M2/250‑216 (MQ=255) tgtAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttccctt > 1:1211521‑M2/1‑35 (MQ=255) atcagtaagttggcatcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAGGAAGACGTGTATCAAGACTTGAAAACGCTACCAGTGCTACACAGATACCTAACGACAACATGAAAAAAaacaa > 2:1217548‑M2/24‑248 (MQ=255) atcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCata < 2:461550‑M2/105‑1 (MQ=255) atcagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCa < 2:1326857‑M2/133‑1 (MQ=255) aGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgct < 2:1367693‑M2/196‑165 (MQ=255) aGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgct > 1:1367693‑M2/1‑32 (MQ=255) cagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAGGAAg < 2:515782‑M2/158‑1 (MQ=255) cagtaagttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAGGAAg > 1:515782‑M2/22‑179 (MQ=255) aTTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttccct > 2:1106039‑M2/1‑27 (MQ=255) ttttGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagattatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagct > 2:439459‑M2/1‑26 (MQ=255) tttGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggat > 2:1285106‑M2/1‑25 (MQ=255) tttGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggat < 1:1285106‑M2/224‑200 (MQ=255) ttGTCATGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttccc > 2:502820‑M2/1‑24 (MQ=255) gttggcagcatcaccAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAGGAAGACGTGTATCAAGACTTGAAAACGCTACCAGTGCTACACAGATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATa < 2:221549‑M2/229‑1 (MQ=255) aTGCACCATAAAGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtataccgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatat > 2:366376‑M2/1‑19 (MQ=255) aaaGGTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcggggttcatacagcggccagccatccgtcatccaaatcaccccgtc < 2:261265‑M2/250‑241 (MQ=255) ggTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcagg < 2:859922‑M2/200‑194 (MQ=255) ggTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcagg > 1:859922‑M2/1‑7 (MQ=255) gTGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgta > 1:732399‑M2/1‑6 (MQ=255) tGGAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgcggcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccacgtcaaagg < 1:298885‑M2/250‑246 (MQ=255) tGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCCGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAGGAAGACGTGTATCAAGACTTGAAAACGCTACCAGTGCTACACAGATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCt < 1:720182/250‑1 (MQ=255) gAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccacgtcaaagggt > 1:141308‑M2/1‑3 (MQ=255) agaAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAGGAAGACGTGTATCAAGACTTGAAAACGCTACCAGTGCTACACAGATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATa < 1:124212/222‑1 (MQ=255) agaAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAGGAAGACGTGTATCAAGACTTGAAAACGCTACCAGTGCTACACAGATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCtttt < 1:1357917/250‑1 (MQ=255) gggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccacctattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccacgtcaaagggtga > 1:545754‑M2/1‑1 (MQ=255) | GGTTGGTTTAACGCTTTTGATAAACTCTCCAGTAAATCATTTTGAATCGCCAGCTGATTACCGTTAGTGATGACATAACGTTTATCCAGCATGGTTGAACCATCTGCATTGTCTACCAATTTTATCGACATAAAGCATTGTTGAGCACGGTATTGGCGCTGATTAACAAACGCAATAGATAATGTTTTACCGGAACTGCTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAGGAAGACGTGTATCAAGACTTGAAAACGCTACCAGTGCTACACAGATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTA > NC_007779_cfb/4365663‑4366160 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |