| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_007779_cfb | = 4504190 | NA (NA) | intergenic (+10/‑89) | insD_3/yjgW | IS2 insertion element transposase InsAB'/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 284 total aligned reads displayed.
AAAAAACGGCTGAATTTTGCGATAACCCCCACATTTTCTGCGATTTAGCGCCAATCTGAATCGTTAACACGTGACATAGTTTCAGATTTGGACTATTCCTTGGGGTGCTCTTGACAGCTATTTTTGATATGATTTGAGATTCAACTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAGTAATAAACAGGTAAGCAGTAAACAAGAGTATTCTCGCAATAGTGCAAAGAGTAGTTCACTTCCTGATTTGCGAAAATACCCTTCCGGAACACCAAGGAAAAAGGCGTTTCTCCGGACCGTAATGCCTTACATTACCAGCCAAAATGCGGCCATTACTG > NC_007779_cfb/3903035‑3903526 | tggctggctgaaacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctccgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccttaagacatcaatcatctgatctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagagggcgagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGgtgt > 2:351378‑M2/226‑250 (MQ=255) tGCGATAACCCCCACATTTTCTGCGATTTAGCGCCAATCTGAATCGTTAACACGTGACATAGTTTCAGATTTGGACTATTCCTTGGGGTGCTCTTGACAGCTATTTTTGATATGATTTGAGATTCAACTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccag < 1:132259‑M1/250‑23 (MQ=255) ccACATTTTCTGCGATTTAGCGCCAATCTGAATCGTTAACACGTGACATAGTTTCAGATTTGGACTATTCCTTGGGGTGCTCTTGACAGCTATTTTTGATATGATTTGAGATTCAACTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttat < 1:1005019‑M1/250‑34 (MQ=255) cGATTTAGCGCCAATCTGAATCGTTAACACGTGACATAGTTTCAGATTTGGACTATTCCTTGGGGTGCTCTTGACAGCTATTTTTGATATGATTTGAGATTCAACTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccat > 1:1574586‑M1/1‑205 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |