| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779_cfb | = 3744263 | NA (NA) | 155 (1.110) | 119/438 | 0.2 | 95.7% | intergenic (‑91/+30) | insC/yidZ | IS2 element protein/DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | NC_007779_cfb | 3903274 = | 7 (0.050) | coding (37/825 nt) | bax | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 299 total aligned reads displayed.
GATCTCGCGCAAAAAACGGCTGAATTTTGCGATAACCCCCACATTTTCTGCGATTTAGCGCCAATCTGAATCGTTAACACGTGACATAGTTTCAGATTTGGACTATTCCTTGGGGTGCTCTTGACAGCTATTTTTGATATGATTTGAGATTCAACTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAGTAATAAACAGGTAAGCAGTAAACAAGAGTATTCTCGCAATAGTGCAAAGAGTAGTTCACTTCCTGATTTGCGAAAATACCCTTCCGGAACACCAAGGAAAAAGGCGTTTCTCCGGACCGTAATGCCTTACATTACCAGCCAAAATGCGGCCATT > NC_007779_cfb/3903025‑3903522 | tattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaa > 2:1458047‑M2/250‑250 (MQ=255)tattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaa < 1:1426757‑M2/1‑1 (MQ=255) tcGCGCAAAAAACGGCTGAATCTTGCGATAACCCCCACATTTTCTGCGATTTAGCGCCAATCTGAATCGTTAACACGTGACATAGTTTCAGATTTGGACTATTCCTTGGGGTGCTCTTGACAGCTATTTTTGATATGATTTGAGATTCAACTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCt > 2:1110002/1‑250 (MQ=255) aaaaaaCGGCTGAATTTTGCGATAACCCCCACATTTTCTGCGATTTAGCGCCAATCTGAATCGTTAACACGTGACATAGTTTCAGATTTGGACTATTCCTTGGGGTGCTCTTGACAGCTATTTTTGATATGATTTGAGATTCAACTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatt > 1:444050‑M1/1‑245 (MQ=255) ctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGtttt < 2:772535‑M2/28‑1 (MQ=255) ccACATTTTCTGCGATTTAGCGCCAATCTGAATCGTTAACACGTGACATAGTTTCAGATTTGGACTATTCCTTGGGGTGCTCTTGACAGCTATTTTTGATATGATTTGAGATTCAACTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttat < 1:1005019‑M1/250‑34 (MQ=255) acaTTTTCTGCGATTTAGCGCCAATCTGAATCGTTAACACGTGACATAGTTTCAGATTTGGACTATTCCTTGGGGTGCTCTTGACAGCTATTTTTGATATGATTTGAGATTCAACTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgt > 1:1506679‑M1/1‑215 (MQ=255) 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aacaattgcgatcttttcctctgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTa > 2:1582384‑M2/158‑241 (MQ=255) gACTATTCCGTGGGGTGCTCTTGACAGCTATTTTTGATATGATTTGAGATTCAACTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAAACCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgca < 2:973613‑M1/250‑96 (MQ=255) cgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTAATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAGtaataa < 1:244563‑M2/101‑1 (MQ=255) 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gggTGCTCTTGACAGCTATTTTTGATATGATTTGAGATTCAACTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgc < 2:1018271‑M1/250‑108 (MQ=255) tgtggtacgccgtctgcgtttctccagccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGttt < 1:813684‑M2/27‑1 (MQ=255) tggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACGCAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAGTAATAAACAGGTAAGCAGTaa < 2:542882‑M2/116‑1 (MQ=255) ggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCg < 1:720172‑M2/45‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |