New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_007779_cfb | 4410279 = | 132 (0.950) | 5 (0.040) | 5/420 | 16.6 | 3.8% | coding (913/1299 nt) | purA | adenylosuccinate synthetase |
? | NC_007779_cfb | = 4410275 | 128 (0.960) | coding (909/1299 nt) | purA | adenylosuccinate synthetase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
GTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAACACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTGCCGTTCGTCGTGCGGTACAGCTGAACTCCCTGTCTGGCTTCTGCCTGACTAAACTGGACGTTCTGGATGGCCTGAAAGAGGTTAAACTCTGCGTGGCTTACCGTATGCCGGATGGTCGCGAAGTGACTACCACTCCGCTGGCAGCTGACGACTGGAAAGGTGTAGAGCCGATTTACGAAACCATGCCGGGCTGGTCTGAATCCACCTT > NC_007779_cfb/4410026‑4410517 | gTTTGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGTTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAACACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACgggg < 2:159430/250‑1 (MQ=255) ttGAAGGTGCGCAGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAACACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTTTGCAAGAAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGcg < 1:1092595/250‑1 (MQ=255) aGGGTACGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAACACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGcgtc < 1:1024086/240‑1 (MQ=255) cGCTGCTGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAACACCACTGCTGGTGGCGCGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCggctg > 1:722059/1‑250 (MQ=255) gctgctGGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAACACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCggctgg < 2:354566/250‑1 (MQ=255) ctgctgGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAACACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCggctggc > 1:737627/1‑250 (MQ=255) tgctgGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAACACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGCTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGCTTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCggctggct > 2:454613/1‑250 (MQ=255) gctgGATATCGACCACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAACACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGATCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGgctggctg < 1:276344/250‑1 (MQ=255) ccACGGTACTTATCCGTACGTAACTTCTTCCAACACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTGcc < 2:24812/250‑1 (MQ=255) ttATCCGTACGTAACTTCTTCCAACACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTGCCGTTcgtcgt < 2:142032/250‑1 (MQ=255) tCCGTACGTAACTTCTTCCAACACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTGCCGTTCGTCGTGCg < 1:443095/250‑1 (MQ=255) cgtacgtaACTTCTTCCAACACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTGCCGTTCGTCGTGCGGt > 1:131864/1‑250 (MQ=255) ttcttcCAACACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAGGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGc < 2:1344487/191‑1 (MQ=255) tcCAACACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTGCCGTTCTTCGTGCGGTACAGCTGAACTccc < 2:1023174/250‑1 (MQ=255) ccAACACCACTGCTGGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTGCCGTTCGTCGTGCGGTACAGCTGAACTCCCt < 1:85947/250‑1 (MQ=255) acgtctgctgATGGCGGGGCGCTCCATTCCTGCCTTAGCCCGCGTTATGTTGATTTCGTTATGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTGCCGACCGAACTGTTTGATGAGGCTGGCGAGTTCCTCTCCAAGCAGTGTAACGAATTCGGCGCAGCTACGGGGCGTCGTCCTCGTACCGGCTGGCTCGACCCCGTTGCCGTTCGTCGTGCGGTACAGCTGAACTCCCTGTCTg < 2:539422/246‑1 (MQ=255) acTGCTGGCGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTGCCGTTCGTCGTGCGGTACAGCTGAACTCCCTGTCTGGCt > 2:619038/1‑250 (MQ=255) ctgctgGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACAGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTGCCGTTCGTCGTGCGGTACAGCTGAACTCCCTGTCTGGCtt > 1:405265/1‑250 (MQ=255) ctgctgGTGGCGTGGCGACCGGTTACGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGc > 2:689910/1‑177 (MQ=255) tgctgGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTAcc > 1:96734/1‑190 (MQ=255) tgctgGTGGCGTGGCGACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTAcc < 2:96734/190‑1 (MQ=255) cgtggcgACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTGCCGTTCGTCGTGCGGTACAGCTGAACTCCCTGTCTGGCTTCTGCCTGACt < 1:363895/250‑1 (MQ=255) tggcgACCGGTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTGCCGTTCGTCGTGCGGTACAGCTGAACTCCCTGTCTGGCTTCTGCCTGACTaa < 1:1520006/250‑1 (MQ=255) gTTCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTGCCGTTCGTCGTGCGGTACAGCTGAACTcc > 2:284338/1‑218 (MQ=255) tCCGGCCTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTGCCGTTCGTCGTGCGGTACAGCTGAACTCCCTGTCTGGCTTCTGCCTGACTAAACTGGACGTTc < 1:1308739/250‑1 (MQ=255) ccTGGGCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTAGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTGCCGTTCGTCGTGCGGTACAGCTGAACTCCCTGTCTGGCTTCTGCCTGACTAAACTGGACGTTCTGGAt < 2:463593/250‑1 (MQ=255) gCCCGCGTTGTGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCCAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTGCCGTTCGTCGTGCGGTACAGCTGAACTCCCTGTCTGGCTTCTGCCTGACTAAACTGGACGTTCTGGATGGCCt < 2:672440/250‑1 (MQ=255) gCCCGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTGCCGTTCGTCGTGCGGTACAGCTGAACTCCCTGTCTGGCTTCTGCCTGACTAAACTGGACGTTCTGGATGGCCt < 2:737627/250‑1 (MQ=255) cccGCGTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTGACTCCACTTGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCTCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCATGCAGGGCAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGAAGCCGTTCGTCGTTCGGTACACTTGAACTCACTGTCTGGCTTCTGCCTGACTAAACTGGACGTTCTGGagngactn > 2:936427/1‑243 (MQ=255) gcgTTATGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTGCCGTTCGTCGTGCGGTACAGCTGAACTCCCTGTCTGGCTTCTGCCTGACTAAACTGGACGTTCTGGATGGCCTGaaa < 1:1515855/250‑1 (MQ=255) tcttGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGG‑‑‑CGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTGCCGTTCGTCGTGCGGTACAGCTGAACTCCCTGTCTGGCTTCTGCCTGACTAAACTGGACGTTCTGGATGGCCTGAAAGAGGtt < 1:1144072/247‑1 (MQ=255) tGTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTGCCGTTCGTCGTGc < 1:1248229/180‑1 (MQ=255) gTTGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTGCCGTTCGTCGTGCGGTACAGCTGAACTCCCTGTCTGGCTTCTGCCTGACTAAACTGGACGTTCTGGATGGCCTGAAAGAGGTTa < 1:454613/250‑1 (MQ=255) ttGATTACGTTCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTGCCGTTCGTCGTGCGGTACAGCTGAACTCCCTGTCTGGCTTCTGCCTGACTAAACTGGACGt < 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tCTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTg > 1:683025/1‑155 (MQ=255) cTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTGCCGTTCGTCGTGCGGTACAGCTGAACTCCCTGTCt < 1:161598/189‑1 (MQ=255) cTGGGTATCCTCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGTTCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGTTGCCGTTCGTCGTGCGGTACAGCTGAACTCCCTGTCTGGCTTCTGCCTGACTAAACTGGACGTTCTGGATGGCCTGAAAGAGGTTAAACTCTGCGTgg < 1:619038/250‑1 (MQ=255) tCAAAGCTTACTCCACTCGTGTAGGTGCAGGTCCGATCCCGACCGAACTGTTTGATGAAACTGGCGAGTTCCTCTGCAAGCAGGGTAACGAATTCGGCGCAACTACGGGGCGTCGTCGTCGTACCGGCTGGCTGGACACCGATGCCGTTCGTCGTGCGGTACAGCTGAACTCCCTGTCTGGCTTCTGCCTGACTAAACTGGACGTTCTGGATGGCCTGAATGAGGTTAAACTCTGCGTGGCTTACCGTAt > 2:193396/1‑250 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |