Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779_cfb | 2,074,160 | 0 | C | A | 100.0% | 304.0 / NA | 93 | A162E (GCG→GAG) | flu | antigen 43 (Ag43) phase‑variable biofilmformation autotransporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (48/45); total (48/45) |
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> 2:769802/1‑234 (MQ=255) gAGGGGGAGGTAGCCAGAGGAACCGTCATTAATGATAAGGGCTGGCAGGTCGTCAAGCCCGGTACAGTGGCAACGGATACCGTTGTTAATACCGGGGCGGAAGGGGGACCGGATGCAGAAAACGGTGATACCGGGCAGTTTGTTCGCGGGGATGCCGTACGCACAACCATCAATAAAAACGGTCGCCAGATTGTGAGAGCTGAAGGAACGGCAAATACCACTGTGGTTTATGCCGGCGGCGACCAGACTg < 2:1333953/250‑1 (MQ=255) gAGGGGGAGATAGCCACAGGAACCGTCATTAATGATAAGGGCTGGCAGGTCGTCAAGCCCGGTACAGTGGCAACGGATACCGTTGTTAATACCGGGGCGGAAGGGGGACCGGATGCAGAAAACGGTGATACCGGGCAGTTTGTTCGCGGGGATGCCGTACGCACAACCATCAATAAAAACGGTCGCCAGATTGTGAGAGCTGAAGGAACGGCAAATACCACTGTGGTTTATGCCGGCGGCGACCAGACTg > 2:1342562/1‑250 (MQ=255) | ACGGAATGACCATCAGTACCGGGCTGGAGTATGGGCCGGATAACGAGGCCAATACCGGCGGGCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCAGAGAGTGAACCCCGGTGGAAGTGTCTCAGACACGGTTATCAGTGCCGGAGGCGGACAGAGCCTTCAGGGACGGGCTGTGAACACCACGCTGAATGGTGGCGAACAGTGGATGCATGAGGGGGCGATAGCCACAGGAACCGTCATTAATGATAAGGGCTGGCAGGTCGTCAAGCCCGGTACAGTGGCAACGGATACCGTTGTTAATACCGGGGCGGAAGGGGGACCGGATGCAGAAAACGGTGATACCGGGCAGTTTGTTCGCGGGGATGCCGTACGCACAACCATCAATAAAAACGGTCGCCAGATTGTGAGAGCTGAAGGAACGGCAAATACCACTGTGGTTTATGCCGGCGGCGACCAGACTG > NC_007779_cfb/2073917‑2074402 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |