| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 1,979,957 | 0 | G | T | 98.8% | 643.4 / ‑2.3 | 167 | intergenic (‑46/+398) | flhD/Y75_RS09980 | flagellar transcriptional regulator FlhD/IS5‑like element IS5 family transposase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (84/81); minor base C (1/1); total (85/82) | |||||||||||
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Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
GGAAGTGACAAACCAGTTGATTGGTTTCTGCCAGCTTAACCATTTGCGGAAGAGTCAGTGCCGCTAACGTTGTCGCCATTTCTTCATTTATGCCGAGACGAAACATAGCGGACGCTTTGTCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGTTTCAGCAACTCGGAGGTATGCATTATTCCCACCCAGAATAACCAACTTTATTTTTATGCGGTTTCACCGCACCCCGTGATGTCGCCGGGAAGCCCCGGTAAAAAATAATTAGCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTA > NC_007779/1979710‑1980203 | aaGTGACAAACCAGTTGATTGGTTTCTGCCAGCTTAACCATTTGCGGAAGAGTCAGTGCCGCTAACGTTGTCGCCATTTCTTCATTTATGCCGAGACGAAACATAGCGGACGCTTTGTCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGTTTCAGCAACTCGGAGGTATGCATTATTCCCACCCAGAATAACCAACTTTATTTTTATGCGGTTtcacctcacc < 1:104690/250‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |