| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
CGCGCAAAAAACGGCTGAATTTTGCGATAACCCCCACATTTTCTGCGATTTAGCGCCAATCTGAATCGTTAACACGTGACATAGTTTCAGATTTGGACTATTCCTTGGGGTGCTCTTGACAGCTATTTTTGATATGATTTGAGATTCAACTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAGTAATAAACAGGTAAGCAGTAAACAAGAGTATTCTCGCAATAGTGCAAAGAGTAGTTCACTTCCTGATTTGCGAAAATACCCTTCCGGAACACCAAGGAAAAAGGCGTTTCTCCGGACCGTAATGCCTTACATTACCAGCCAAAATGCGGCCATTACTGCG > NC_007779/3903030‑3903528 | cttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCtt < 2:697789‑M2/6‑1 (MQ=255) acgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATg < 2:579435‑M2/9‑1 (MQ=255) aaaaaaCGGCTGAATTTTGCGATAACCCCCACATTTTCTGCGATTTAGCGCCAATCTGAATCGTTAACACGTGACATAGTTTCAGATTTGGACTATTCCTTGGGGTGCTCTTGACAGCTATTTTTGATATGATTTGAGATTCAACTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatt > 2:69372‑M1/1‑245 (MQ=255) aaaaaCGGCTGAATTTTGCGATAACCCCCACATTTTCTGCGATTTAGCGCCAATCTGAATCGTTAACACGTGACATAGTTTCAGATTTGGACTATTCCTTGGGGTGCTCTTGACAGCTATTTTTGATATGATTTGAGATTCAACTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggattt > 1:407396‑M1/1‑244 (MQ=255) aaaCGGCTGAATTTTGCGATAACCCCCACATTTTCTGCGATTTAGCGCCAATCTGAATCGTTAACACGTGACATAGTTTCAGATTTGGACTATTCCTTGGGGTGCTCTTGACAGCTATTTTTGATATGATTTGAGATTCAACTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgc > 1:677305‑M1/1‑242 (MQ=255) aaaCGGCTGAATTTTGCGATAACCCCCACATTTTCTGCGATTTAGCGCCAATCTGAATCGTTAACACGTGACATAGTTTCAGATTTGGACTATTCCTTGGGGTGCTCTTGACAGCTATTTTTGATATGATTTGAGATTCAACTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgc < 1:643661‑M1/250‑9 (MQ=255) gagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTactc < 2:315027‑M2/15‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |