| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_007779 | 1,093,686 | T→C | V130A (GTA→GCA) | Y75_RS05355 → | GGDEF domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 1,093,686 | 0 | T | C | 99.2% | 493.9 / NA | 124 | V130A (GTA→GCA) | Y75_RS05355 | GGDEF domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (68/55); minor base A (0/1); total (68/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.52e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTGTACTTAGTTTGGCTTTTCTGAGTTGTTTGATTTACTTTGTTATAACCGTCATTATCATTCAGCAAATTATTGAGGAGCGTTTGACAAGCAGTGTTGTCCAAAATGACATTGCAATCTATTATTTGTTTCGTCAGATGAGTTTGTGCATATTAATATTTCTGGTATTGGTGAATAAAGTTAGTGAAAACACAAAACAGCGCAATTTATTTTCCAAAAAAATGACTTTGTGCATAAGTTTGTTTTTTGTTTTTGGGGGGCCGATAGTTGCTCACATACTTTCTAGTCATTATGAGAGCTACAATTTACACATTGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCATATGTTACCATAATGATTTTCATGTGGTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTAT > NC_007779/1093444‑1093931 | tttATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTGTACTTAGTTTGGCTTTTCTGAGTTGTTTGATTTACTTTGTTATAACCGTCATTATCATTCAGCAAATTATTGAGGAGCGTTTGACAAGCAGTGTTGTCCAAAATGACATTGCAATCTATTATTTGTTTCGTCAGATGAGTTTGTGCATATTAATATTTCTGGCATTGGTg > 1:793926/1‑250 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |