| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 1,979,957 | 0 | G | T | 99.2% | 480.8 / NA | 127 | intergenic (‑46/+398) | flhD/Y75_RS09980 | flagellar transcriptional regulator FlhD/IS5‑like element IS5 family transposase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (58/68); total (58/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |