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ATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAAAGCCGCTCCAGATCGTGTGCATATAATTCAGCAGCTACCGATTGATAGATCTTCCAGTCAATAAAATTGCCATCAGGGTAGACTCGTTGAAATGCGGTTAAGTCGGGGAAAAAACGCATGGTGTTGTTGCCGATGCGGTTATTTATTTTCTCTATGATGGCATGAAGATGTTTTTTTCTTTGC > 1:1286141/1‑250 AATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAAAGCCGCTCCAGATCGTGTGCATATAATTCAGCAGCTACCGATTGATAGATCTTCCAGTCAATAAAATTGCCATCAGGGTAGACTCGTTGAAATGCGGTTAAGTCGGGGAAAAAACGCATGGTGTTGTTGCCGATGCGGTTATTTATTTTCTCTATGATGGCATGAAGATGTTTTTTTCTTTGCTGACGCA < 2:34569/250‑1 GACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAAAGCCGCTCCAGATCGTGTGCATATAATTCAGCAGCTACCGATTGATAGATCTTCCAGTCAATAAAATTGCCATCAGGGTAGACTCGTTGAAATGCGGTTAAGTCGGGGAAAAAACGCATGGTGTTGTTGCCGATGCGGTTATTTATTTTCTCTATGATGGCATGAAGATGTTTTTTTCTTTGCTGACGCATAGCCAAC < 1:255570/250‑1 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TCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAAAGCCGCTCCAGATCGTGTGCATATAATTCAGCAGCTACCGATTGATAGATCTTCCAGTCAATAAAATTGCCATCAGGGTAGACTCGTTGAAATGCGGTTAAGTCGGGGAAAAAACGCATGGTGTTGTTGCCGATGCGGTTATTTATTTTCTCTATGATGGCATGAAGATGTTTTTTTCTTTGATGACGCATAGCCAACAGTTGCT > 2:842592/1‑250 CAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAAAGCCGCTCCAGATCGTGTGCATATAATTCAGCAGCTACCGATTGATAGATCTTCCAGTCAATAAAATTGCCATCAGGGTAGACTCGTTGAAATGCGGTTAAGTCGGGGAAAAAACGCATGGTGTTGTTGCCGATGCGGTTATTTATTTTCTCTATGATGGCATGAAGATGTTTTTTTCTTTGCTGACGCATAGCCAACAGTTGCTC < 1:704042/250‑1 GCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAAAGCCGCTCCAGATCGTGTGCATATAATTCAGCAGCTACCGATTGATAGATCTTCCAGTCAATAAAATTGCCATCAGGGTAGACTCGTTGAAATGCGGTTAAGTCGGGGAAAAAACGCATGGTGTTGTTGCCGATGCGGTTATTTATTTTCTCTATGATGGCATGAAGATGTTTTTTTCTTTGCTGACGCATAGCCAACAGTTGCTCGA > 1:427332/1‑250 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NC_007779/1398723‑1398952‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAACAAAGCCGCTCCAGATCGTGTGCATATAATTCAGCAGCTACCGATTGATAGATCTTCCAGTCAATAAAATTGCCATCAGGGTAGACTCGTTGAAATGCGGTTAAGTCGGGGAAAAAACGCATGGTGTTGTTGCCGATGCGGTTATTTATTTTCTCTATGATGGCATGAAGATGTTTTTTTCTTTGCTGACGCATAGCCAACAGTTGCTCGACTACACGATCAGGAATGGCACACTTGCCATTTTC < NC_007779/1772685‑1772437 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |