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Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
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GTAACGGGTAGTGGCTTTATCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCA‑TTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCG < 1:802944/250‑1 TAACGGGTAGTGGCTTTATCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCA‑TTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGA > 1:939909/1‑250 CGGGTAGTGGCTTTATCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCA‑TTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTG > 1:1791379/1‑250 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GACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTC > 1:713150/1‑250 GACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTC > 1:1154814/1‑250 CTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTT > 2:1123528/1‑250 CTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTT < 1:1696333/250‑1 TTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTGCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTGCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCT < 1:1716652/250‑1 TATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTT > 2:44399/1‑250 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TCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTGCGGTCTAACAC < 1:560328/250‑1 GTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTGCGGTCTAACACGA < 2:1888831/250‑1 GTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTGCGGTCTAACACGA > 1:2029607/1‑250 CGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTGCGGTCTAACACGAAGT < 1:1477968/250‑1 GCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTGCGGTCTAACACGAAGTG < 1:873472/250‑1 TGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTGCGGTCTAACACGAAGTGTT > 1:2009348/1‑250 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTGCGGTCTAACACGAAGTGTTT > NC_007779/3958157‑3958405 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |