Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_007779 | 3,948,766 | G→A | R320H (CGT→CAT) | bcsB → | cellulose biosynthesis cyclic di‑GMP‑binding regulatory protein BcsB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 3,948,766 | 0 | G | A | 99.6% | 848.9 / ‑4.7 | 220 | R320H (CGT→CAT) | bcsB | cellulose biosynthesis cyclic di‑GMP‑binding regulatory protein BcsB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (104/115); total (104/116) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.82e-01 |
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
GCGCCGGATGTTGGGCTGCAACAAGCCTCTGCCATTGTCGCCTCGTGGTTTGGTTCGCGTTCTGGCTGGCGTGGGCAGAACTTCCCGGTACTCTATAACCAACTGCCGGATCGCAATGCCATTGTCTTTGCAACCAACGACAAACGGCCGGACTTCCTGCGCGATCATCCGGCGGTAAAAGCCCCGGTGATTGAGATGATTAACCATCCGCAGAATCCTTACGTCAAACTGCTGGTGGTGTTTGGTCGTGACGACAAAGACCTGTTGCAGGCAGCGAAAGGTATCGCTCAGGGTAACATTCTGTTCCGTGGTGAAAGCGTGGTAGTGAATGAAGTGAAACCGCTGCTACCGCGTAAGCCGTACGATGCGCCGAACTGGGTACGTACCGATCGTCCGGTCACATTTGGCGAACTGAAAACCTATGAAGAACAGTTACAATCCAGCGGTCTTGAGCCAGCAGCGATTAACGTTTCGCTAAACCTGCCGCCGGATCT > NC_007779/3948519‑3949012 | gcCGGATGTTGGGCTGCAACAAGCCTCTGCCATTGTCGCCTCGTGGTTTGGTTCGCGTTCTGGCTGGCGTGGGCAGAACTTCCCGGTACTCTATAACCAACTGCCGGATCGCAATGCCATTGTCTTTGCAACCAACGACAAACGGCCGGACTTCCTGCGCGATCATCCGGCGGTAAAAGCCCCGGTGATTGAGATGATTAACCCTCCGCAGAATCCTTACGTCAAACTGCTGGGGGTGGTTGGTCATgac > 2:1765584/1‑250 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |