| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_007779 | 3,974,646 | Δ78 bp | coding (42‑119/825 nt) | gadX → | acid resistance transcriptional activator GadX |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_007779 | 3974724 = | 0 (0.000) | coding (120/825 nt) | gadX | acid resistance transcriptional activator GadX | |||||
Only 100 of 191 total aligned reads displayed.
ATGTCACGAAAAGGGATTATTTGCTTACTATTAATTTCCCTGTGTTCTTAAACACGTTTTTGTATTATAAATCCAGTCATCCTGCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/3974390‑3974645‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atgcaagCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAATGCTACGTAAAAGAGCATTAATCTTTGCGTTGTT > NC_007779/3974724‑3974969 GTCACGAAAAGGGATTATTTGCTTACTATTAATTTCCCTGTGTTCTTAAACACGTTTTTGTATTATAAATCCAGTCATCCTGCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATG > 1:373862/1‑250 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ACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGC < 2:246051/250‑1 ACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGC > 1:505825/1‑250 ACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAG > 1:643294/1‑223 ACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAG < 2:643294/223‑1 TAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACT > 1:1077739/1‑250 AATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTA > 2:505567/1‑250 ATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCG > 2:295989/1‑250 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ACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAATGCTA < 1:708557/250‑1 TACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAATGCTACG > 2:404707/1‑250 TGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAATGCTACGTAAA < 2:894472/250‑1 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NC_007779/3974390‑3974645‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atgcaagCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAATGCTACGTAAAAGAGCATTAATCTTTGCGTTGTT > NC_007779/3974724‑3974969 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |