New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_007779 | = 4311557 | NA (NA) | 147 (1.130) | 117/496 | 0.2 | 98.0% | pseudogene (921/921 nt) | alsK | allose kinase |
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Only 100 of 314 total aligned reads displayed.
CCAGTTTCGGTATACATCGTTTCAAGGTGAAATTAGATACTACGTATTGTATAAAATATGCCATTCTCGCATTTTTAGCTTTATTGCCTTTTCTCGCTGTTGCTGGTTATATTATCTTCGATCAAATATTAAATGCGTATGATAGTTCTGTATATGCAAATGATGACATTGAGAATTTACAGCAATTTATGGAAATGCAACGTAAAATGATAATCGCGCAGTTAATCTATTATTTTGGGATTGCTGTTAGCACAAGTTATTTAACGGTGTCTTTGCGAAACCATTTTATGAGCAACCTGTCACTGAATGATGGGCGTATTCGTTTTCGCTTAACTTTAACGTACCACGGTATGCTTTATCGCATGTGTGCGTTGGTGGTGATATCCGGGATTACGGGCGGTCTGGCTTATCCACTGCTGAAAATATGGATGATTGACTGGCAGGCAAAAAATACGTATTTGCTGGGCGATTTGGATGACCTTCCTTTAATCAATAAAGA > NC_007779/4485038‑4485536 | tggtttccagcggataaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAg < 1:927895‑M2/4‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |