| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_007779 | = 3129996 | NA (NA) | 170 (1.100) | 132/496 | 0.2 | 96.0% | intergenic (+146/+1) | Y75_RS15530/Y75_RS15535 | IS5‑like element IS5 family transposase/lipopolysaccharide biosynthesis protein |
| ? | NC_007779 | 3189138 = | 7 (0.050) | coding (602/750 nt) | Y75_RS15855 | molecular chaperone | |||||
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
AAGGGGTTGCTGAAAAACGATAACCAACTGGCGATGTTATTCACGCTGGCCAACCTGTTTCGGGCGGACCAAATGATACGTCAGTGGGAGAGATCTCACTAAAAACTGGGGATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 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CATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAGCTATGCAAATACGCAGTTTAAAAATGTTCCGTCAACTTTTCAGGTGGGTTATATCAATGACTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGTAATATTTCTGTAGCCAACCGAGATCAATAATATGCGCTACTT < 2:691539/250‑1 CATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAGCTATGCAAATACGCAGTTTAAAAATGTTCCGTCAACTTTTCAGGTGGGTTATATCAATGACTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGTAATATTTCTGTAGCCAACCGAGATCAATAATATGCGCTACTT > 2:846767/1‑250 ATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAGCTATGCAAATACGCAGTTTAAAAATGTTCCGTCAACTTTTCAGGTGGGTTATATCAATGACTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGTAATATTTCTGTAGCCAACCGAGATCAATAATATGCGCTACTTG < 1:546555/250‑1 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ATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAGCTATGCAAATACGCAGTTTAAAAATGTTCCGTCAACTTTTCAGGTGGGTTATATCAATGACTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGTAATATTTCTGTAGCCAACCGAGATCAATAATATGCGCTACTTGTTAATTGTTATTACTT < 1:22840/250‑1 TGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAGCTATGCAAATACGCAGTTTAAAAATGTTCCGTCAACTTTTCAGGTGGGTTATATCAATGACTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGTAATATTTCTGTAGCCAACCGAGATCAATAATATGCGCTACTTGTTAATTGTTATTACTTTTTTTATGGGTTT < 2:1456345/250‑1 TGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAGCTATGCAAATACGCAGTTTAAAAATGTTCCGTCAACTTTTCAGGTGGGTTATATCAATGACTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGTAATATTTCTGTAGCCAACCGAGATCAATAATATGCGCTACTTGTTAATTGTTATTACTTTTTTTATGGGTTT > 1:180797/1‑250 AAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAGCTATGCAAATACGCAGTTTAAAAATGTTCCGTCAACTTTTCAGGTGGGTTATATCAATGACTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGTAATATTTCTGTAGCCAACCGAGATCAATAATATGCGCTACTTGTTAATTGTTATTACTTTTTTTATGGGTTTTA < 1:1064294/250‑1 AAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAGCTATGCAAATACGCAGTTTAAAAATGTTCCGTCAACTTTTCAGGTGGGTTATATCAATGACTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGTAATATTTCTGTAGCCAACCGAGATCAATAATATGCGCTACTTGTTAATTGTTATTACTTTTTTTATGGGTTTTAGTT < 2:1153973/250‑1 ATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAGCTATGCAAATACGCAGTTTAAAAATGTTCCGTCAACTTTTCAGGTGGGTTATATCAATGACTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGTAATATTTCTGTAGCCAACCGAGATCAATAATATGCGCTACTTGTTAATTGTTATTACTTTTTTTATGGGTTTTAGTTCA > 2:675113/1‑250 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TGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCGCCGCTTATTCGCGCCTTCCTTAGCTATGCAAATACGCAGTTTAAAAATGGTCCGTCAACTTTTCAGGTGGGTTATATCAATGACTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGTAATATTTCTGTAGCCAACCGAGATCAATGATATGCGCTACTTGTTAATTGTTATTACTTTTTTTATGGGTTTTAGTTCATTACCTGCAT < 1:1223002/250‑1 AGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAGCTATGCAAATACGCAGTTTAAAAATGTTCCGTCAACTTTTCAGGTGGGTTATATCAATGACTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGTAATATTTCTGTAGCCAACCGAGATCAATAATATGCGCTACTTGTTAATTGTTATTACTTTTTTTATGGGTTTTAGTTCATTACCTGCATGG > 2:1131611/1‑250 AGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAGCTATGCAAATACGCAGTTTAAAAATGTTCCGTCAACTTTTCAGGTGGGTTATATCAATGACTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGTAATATTTCTGTAGCCAACCGAGATCAACAATATGCGCTACTTGTTAATTGTTATTACTTTTTTTATGGGTTTTAGTTCATTACCTGCATGG > 1:820497/1‑250 gaCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAGCTATGCAAATACGCAGTTTAAAAATGTTCCGTCAACTTTTCAGGTGGGTTATATCAATGACTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGTAATATTTCTGTAGCTAACCGAGATCAATAATATGCGCTACTTGTTAATTGTTATTACTTTTTTTATGGGTTTTAGTTCATTACCTGCATGGG > 2:63258/3‑250 TCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAGCTATGCAAATACGCAGTTTAAAAATGTTCCGTCAACTTTTCAGGTGGGTTATATCAATGACTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGTAATATTTCTGTAGCCAACCGAGATCAATAATATGCGCTACTTGTTAATTGTTATTACTTTTTTTATGGGTTTTAGTTCATTACCTGCATGGGC > 1:930597/1‑250 GAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAGCTATGCAAATACGCAGTTTAAAAATGTTCCGTCAACTTTTCAGGTGGGTTATATCAATGACTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGTAATATTTCTGTAGCCAACCGAGATCAATAATATGCGCTACTTGTTAATTGTTATTACTTTTTTTATGGGTTTTAGTTCATTACCTGCATGGGCAATGGACTGCT > 1:489525/1‑250 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NC_007779/3129749‑3129996‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGCTATGCAAATACGCAGTTTAAAAATGTTCCGTCAACTTTTCAGGTGGGTTATATCAATGACTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGTAATATTTCTGTAGCCAACCGAGATCAATAATATGCGCTACTTGTTAATTGTTATTACTTTTTTTATGGGTTTTAGTTCATTACCTGCATGGGCAATGGACTGCTATGCTGAACATGAAGGTGGA > NC_007779/3189138‑3189380 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |