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Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
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CTTTATCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTG < 2:526371/250‑1 CTTTATCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTG < 1:1222837/250‑1 TTTATCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGC > 2:510588/1‑250 TTATCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGGCGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCG > 2:1333019/1‑250 TCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCAT < 1:40528/250‑1 GCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATT < 1:1252486/250‑1 CTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTACGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTG > 1:1293482/1‑250 TGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGA > 1:1351126/1‑250 GGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCC > 1:823821/1‑250 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GCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTT < 2:1044653/250‑1 GGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGATGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTAC < 1:1311734/250‑1 GCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCT < 2:120164/250‑1 CCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTG < 2:843945/250‑1 CCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCAT < 1:502952/219‑1 CCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCAT > 2:502952/1‑219 CCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGAGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTG < 2:936894/250‑1 TAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAG < 1:182129/250‑1 CGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTT > 1:381930/1‑250 GTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTAT < 1:910260/250‑1 TCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATT > 1:1046949/1‑250 CTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTT < 2:246952/250‑1 GGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCA < 1:1435048/250‑1 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ATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATT > 2:575366/1‑250 GACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTC > 1:493298/1‑250 CCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCAT < 2:250387/250‑1 CCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCAT > 2:468565/1‑250 CGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATG > 1:978300/1‑250 TTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTC > 2:801653/1‑250 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AGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTGCGGTC < 1:755163/250‑1 AGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTGCGGTCTAA < 1:913604/250‑1 GTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTGCGGTCTAACACGA > 1:1023421/1‑250 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCTCATCACTTATGCCCGCACTCCCTTCCCCGAGTGCGGGTGTTTGCGCATAATTGACCCCTGTGCCTGAACTTACCACCTGGGTGAGTTCAGGTTTATTTCACTTCTTCCGTGACATTTTCATGTTCTTGCGGTCTAACACGAAGTGTTT > NC_007779/3958157‑3958405 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |