New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_007779 | 3751790 = | 0 (0.000) | intergenic (+151/+116) | Y75_RS18600/tnaC | IS5‑like element IS5 family transposase/tryptophanase leader peptide |
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
GGGTTGCTGAAAAACGATAACCAACTGGCGATGTTATTCACGCTGGCCAACCTGTTTCGGGCGGACCAAATGATACGTCAGTGGGAGAGATCTCACTAAAAACTGGGGATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGCACTTATCCTCGCAAGACACGAGGCTACATTATTACACTCAGAGTTTTTGTCTAT > NC_007779/3751541‑3752039 | cgataaaaacatcttcgctatccagcaggaacgggttcataccggatttaataattgcctcttcacgataagcgcgagtggtacgttttactggctcaataacacgaatgcggaacggttcagggagatgtttaaagttttccattacataatccttcatttattttaattacagtgatccctgtgaatattacatctgctataccgattaattcgccagatatatatgcaagcaccatcatttactaaa < 1:844994‑M2/1‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |