Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_007779 | 1,093,686 | T→C | V130A (GTA→GCA) | Y75_RS05355 → | GGDEF domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 1,093,686 | 0 | T | C | 98.7% | 592.0 / NA | 149 | V130A (GTA→GCA) | Y75_RS05355 | GGDEF domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (71/76); minor base A (0/2); total (71/78) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
GCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTGTACTTAGTTTGGCTTTTCTGAGTTGTTTGATTTACTTTGTTATAACCGTCATTATCATTCAGCAAATTATTGAGGAGCGTTTGACAAGCAGTGTTGTCCAAAATGACATTGCAATCTATTATTTGTTTCGTCAGATGAGTTTGTGCATATTAATATTTCTGGTATTGGTGAATAAAGTTAGTGAAAACACAAAACAGCGCAATTTATTTTCCAAAAAAATGACTTTGTGCATAAGTTTGTTTTTTGTTTTTGGGGGGCCGATAGTTGCTCACATACTTTCTAGTCATTATGAGAGCTACAATTTACACATTGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCATATGTTACCATAATGATTTTCATGTGGTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTAT > NC_007779/1093442‑1093931 | gCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTGTACTTAGTTTGGCTTTTCTGAGTTGTTTGATTTACTTTGTTATAACCGTCATTATCATTCAGCAAATTATTGAGGAGCGTTTGACAAGCAGTGTTGTCCAAAATGACATTGCAATCTATTATTTGTTTCGTCAGATGAGTTTGTGCATATTAATATTTCTGGCATTgg > 1:545115/1‑250 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |