| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_007779 | 3,974,646 | Δ78 bp | coding (42‑119/825 nt) | gadX → | acid resistance transcriptional activator GadX |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 3974645 | 20 (0.100) | 166 (0.890) | 137/482 | 0.6 | 90.6% | coding (41/825 nt) | gadX | acid resistance transcriptional activator GadX |
| ? | NC_007779 | 3974724 = | 15 (0.080) | coding (120/825 nt) | gadX | acid resistance transcriptional activator GadX | |||||
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
ATGTCACGAAAAGGGATTATTTGCTTACTATTAATTTCCCTGTGTTCTTAAACACGTTTTTGTATTATAAATCCAGTCATCCTGCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/3974390‑3974645‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atgcaagCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAATGCTACGTAAAAGAGCATTAATCTTTGCGTTGTTA > NC_007779/3974724‑3974970 ATGTCACGAAAAGGGAATATTTGCTTACTATTAATTTCCCTGTGTTCTTAAACACGTTTTTGTATTATAAATCCAGTCATCCTGCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGTGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTATTATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGCGAATTGTCTAATTGCGTA > 2:1443435/1‑250 TGTCACGAAAAGGGATTATTTGCTTACTATTAATTTCCCTGTGTTCTTAAACACGTTTTTGTATTATAAATCCAGTCATCCTGCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTAT > 2:1630380/1‑250 CACGAAAAGGGATTATTTGCTTACTATTAATTTCCCTGTGTTCTTAAACACGTTTTTGTATTATAAATCCAGTCATCCTGCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCA < 1:1385230/250‑1 GAAAAGGGATTATTTGCTTACTATTAATTTCCCTGTGTTCTTAAACACGTTTTTGTATTATAAATCCAGTCATCCTGCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGC > 1:1621681/1‑250 AAAGGGATTATTTGCTTACTATTAATTTCCCTGTGTTCTTAAACACGTTTTTGTATTATAAATCCAGTCATCCTGCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCA > 2:393742/1‑250 AAGGGATTATTTGCTTACTATTAATTTCCCTGTGTTCTTAAACACGTTTTTGTATTATAAATCCAGTCATCCTGCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAA > 2:200987/1‑250 GGATTATTTGCTTACTATTAATTTCCCTGTGTTCTTAAACACGTTTTTGTATTATAAATCCAGTCATCCTGCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATT > 1:463633/1‑250 GATTATTTGCTTACTATTAATTTCCCTGTGTTCTTAAACACGTTTTTGTATTATAAATCCAGTCATCCTGCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTC > 1:460159/1‑250 TTCCCTGTGTTCTTAAACACGTTTTTGTATTATAAATCCAGTCATCCTTCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAA < 2:330459/250‑1 TCCCTGTGTTCTTAAACACGTTTTTGTATTATAAATCCAGTCATCCTGCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAA < 1:668160/250‑1 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TAAATCCAGTCATCCTGCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCA < 2:1675617/250‑1 TAAATCCAGTCATCCTGCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCA < 2:766295/250‑1 CCAGTCATCCTGCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATT > 1:172711/1‑250 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CAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCA < 2:1422029/250‑1 CAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCA > 1:678907/1‑250 ATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATATAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATC > 2:401486/1‑250 tAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCAC > 2:1657626/2‑250 CAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCAC > 2:494255/1‑250 TGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAG < 1:1794645/250‑1 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AGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGAT > 2:1260254/1‑250 GGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGGAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTG < 2:1136193/250‑1 CGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTT > 2:741844/1‑250 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GTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAAC < 1:1576258/250‑1 TAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACT < 1:1630380/250‑1 TATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTTAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAACAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCATGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATC > 2:268005/1‑250 GTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCA > 2:645088/1‑250 ATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAAT > 1:1006077/1‑250 TGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATA > 2:547039/1‑250 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ATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAG > 1:293372/1‑250 AATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAAT > 1:1459689/1‑250 TCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAATGC < 1:6112/250‑1 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ATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAATGCTACGTAA > 2:585027/1‑250 ATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAATGCTACGTAA < 2:725857/250‑1 TGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAATGCTACGTAAA < 1:822721/250‑1 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NC_007779/3974390‑3974645‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atgcaagCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGTCAAGGGACACGCTTTCATTATTTCTCCCGATGCTCAAGGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCACATAAAAAAGTTTCTTCATTACTCGTTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAATGCTACGTAAAAGAGCATTAATCTTTGCGTTGTTA > NC_007779/3974724‑3974970 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |