| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 4310363 = | NA (NA) | 209 (1.090) | 134/496 | 0.8 | 90.1% | intergenic (‑287/‑32) | yjcS/Y75_RS21310 | alkyl sulfatase YjcS/IS5‑like element IS5 family transposase |
| ? | NC_007779 | 4485284 = | 23 (0.120) | coding (875/1197 nt) | Y75_RS22200 | DUF898 domain‑containing protein | |||||
Only 100 of 427 total aligned reads displayed.
ATACCAGTTTCGGTATACATCGTTTCAAGGTGAAATTAGATACTACGTATTGTATAAAATATGCCATTCTCGCATTTTTAGCTTTATTGCCTTTTCTCGCTGTTGCTGGTTATATTATCTTCGATCAAATATTAAATGCGTATGATAGTTCTGTATATGCAAATGATGACATTGAGAATTTACAGCAATTTATGGAAATGCAACGTAAAATGATAATCGCGCAGTTAATCTATTATTTTGGGATTGCTGTTAGCACAAGTTATTTAACGGTGTCTTTGCGAAACCATTTTATGAGCAACCTGTCACTGAATGATGGGCGTATTCGTTTTCGCTTAACTTTAACGTACCACGGTATGCTTTATCGCATGTGTGCGTTGGTGGTGATATCCGGGATTACGGGCGGTCTGGCTTATCCACTGCTGAAAATATGGATGATTGACTGGCAGGCAAAAAATACGTATTTGCTGGGCGATTTGGATGACCTTCCTTTAATCAATAA > NC_007779/4485035‑4485533 | gcatggtttccagcggataaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttcct > 2:508879‑M2/250‑250 (MQ=255)gcatggtttccagcggataaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttcct > 1:411136‑M2/250‑250 (MQ=255)gcatggtttccagcggataaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttcct > 2:341613‑M2/250‑250 (MQ=255)gcatggtttccagcggataaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatggttttccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttcct > 1:282758‑M2/250‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |