New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_007779 | = 4311557 | NA (NA) | 218 (1.140) | 157/496 | 0.2 | 90.8% | pseudogene (921/921 nt) | alsK | allose kinase |
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Only 100 of 414 total aligned reads displayed.
CCAGTTTCGGTATACATCGTTTCAAGGTGAAATTAGATACTACGTATTGTATAAAATATGCCATTCTCGCATTTTTAGCTTTATTGCCTTTTCTCGCTGTTGCTGGTTATATTATCTTCGATCAAATATTAAATGCGTATGATAGTTCTGTATATGCAAATGATGACATTGAGAATTTACAGCAATTTATGGAAATGCAACGTAAAATGATAATCGCGCAGTTAATCTATTATTTTGGGATTGCTGTTAGCACAAGTTATTTAACGGTGTCTTTGCGAAACCATTTTATGAGCAACCTGTCACTGAATGATGGGCGTATTCGTTTTCGCTTAACTTTAACGTACCACGGTATGCTTTATCGCATGTGTGCGTTGGTGGTGATATCCGGGATTACGGGCGGTCTGGCTTATCCACTGCTGAAAATATGGATGATTGACTGGCAGGCAAAAAATACGTATTTGCTGGGCGATTTGGATGACCTTCCTTTAATCAATAAAGA > NC_007779/4485038‑4485536 | tggtttccagcggataaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggaaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAg > 2:698010‑M2/247‑250 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |