Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_007779 | 909,411 | G→A | P102P (CCC→CCT) | ltaE ← | low‑specificity L‑threonine aldolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 909,411 | 0 | G | A | 87.8% | 505.6 / 53.9 | 181 | P102P (CCC→CCT) | ltaE | low‑specificity L‑threonine aldolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (10/12); new base A (81/77); total (92/89) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.54e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.30e-01 |
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
TGATCTCTTTCAGTTCGCAGCCGTAAGCCACCACGGCATTAAAGATGCGCGCACCGTCAACATGCAGCGCCAGATTGCGCTCGCGGGTAAATTCCCATGCTTCTTTCAGGTATTCCCGCGGCAACACTTTGCCGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGC‑GGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATCGCCACTTTATCCAGCGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATGGGTTGCGGTTGAATACTGCCCAGCACCGCCGCGCCACCGGCTTCAAACAGATAGTTATGCGCGGCCTGACCGACAATATACTCTTCGCCGCGTTCGCAGTGACTGAGCAGAGCGACCAGGTTGGCCTGAGTGCCGGTAGGCAGAAAAATGGCGGCTTCTTTACCGGAAAGCTCTGCTGCGTAGTCCTGCAGAGCATTAACGGTAGGGTCGTCTCCGTAAACGTCGTCCCCAACCGGGGCGGCCATC > NC_007779/909164‑909657 | tGATCTCTTTCAGTTCGCAGCCGTAAGCCACCACGGCATTAAAGATGCGCGCACCGTCAACATGCAGCGCCAGATTGTGCTCGCGGGTAAATTCCCATGCTTCTTTCAGGTATTCCCGCGGCAACACTTTGCCGTTGTGGGTGTTTTCCAGACTGAGTAATTTGGTGC‑GGGCGAAATGGATATCGTCGGGTTTGATTTTCATCGCCACTTTATCCAGTGGTAGCGTGCCGTCGGCAGCCGCGTCTATagg > 1:1791192/1‑250 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |