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TTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCGGTCGCCAGTA < 1:1020664/250‑1 TTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCGGTCGCCAGTA < 1:550825/250‑1 ACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCGGTCGCCAGTAGCA > 2:373425/1‑250 ACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCGGTCGCCAGTAGCA < 1:1004927/250‑1 ACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCGGTCGCCAGTAGCA < 1:1005843/250‑1 ACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCGGTCGCCAGTAGCA > 2:273899/1‑250 CATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCGGTCGCCAGTAGCAG < 1:889998/250‑1 TTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCGGTCGCCAGTAGCAGATT > 1:926263/1‑250 TATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCGGTCGCCAGTAGCAGATTGT > 2:221844/1‑250 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCGGTCGCCAGTAGCAGATTGTCGGGTTGCGC > NC_007779/3744272‑3744517 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |