Predicted mutation | ||||||
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MC JC | NC_007779 | 3,974,646 | Δ78 bp | coding (42‑119/825 nt) | gadX → | acid resistance transcriptional activator GadX |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | NC_007779 | 3974646 | 3974723 | 78 | 130 [0] | [0] 131 | gadX | acid resistance transcriptional activator GadX |
New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
TGTCACGAAAAGGGATTATTTGCTTACTATTAATTTCCCTGTGTTCTTAAACACGTTTTTGTATTATAAATCCAGTCATCCTGCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/3974391‑3974645 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TACTATTAATTTCCCTGTGTTCTTAAACACGTTTTTGTATTATAAATCCAGTCATCCTGCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAG > 2:193555/1‑250 TACTATTAATTTCCCTGTGTTCTTAAACACGTTTTTGTATTATAAATCCAGTCATCCTGCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAG < 2:1102983/250‑1 ACTATTAATTTCCCTGTGTTCTTAAACACGTTTTTGTATTATAAATCCAGTCATCCTGCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGT > 1:1085585/1‑250 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> 1:1064058/1‑250 GTTCTTAAACACGTTTTTGTATTATAAATCCAGTCATCCTGCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTA < 1:44930/250‑1 TTAAACACGTTTTTGTATTATAAATCCAGTCATCCTGCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCG < 1:626828/250‑1 AACACGTTTTTGTATTATAAAACCAGTCATCCTGACCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGCCAAATTCGAGTAGATAAGTGTGTTGAAAATTTTGTATTCGTGT < 1:908707/250‑1 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |