New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 89166 = | 3 (0.020) | 151 (0.980) | 116/496 | 0.6 | 98.0% | intergenic (+134/‑468) | cra/mraZ | catabolite repressor/activator/division/cell wall cluster transcriptional repressor MraZ |
? | NC_007779 | = 274373 | NA (NA) | intergenic (‑32/‑176) | Y75_RS01335/mmuP | IS5‑like element IS5 family transposase/S‑methylmethionine permease |
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
AATGACTCACTATTTTCCACAGCAAATATAAAGTGTCAGTTTGCGACGCGAGCGGCATTTTAGGACATATCTTCCCCGGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCGCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTTAAATCGGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTTCAGCTGGTGAGTTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/89410‑89166 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAATTCAGCAGTAAGCGCCGTCAGACCAGAAAAGAGATTTTCTTGTCCCGCATGGAGCAGATTCTGCCATGGCAAAACATGGTGGAAGTCATCGAGCCGTTTTACCCCAAGGCTGGTAATGGCCGGCGACCTTATCCGCTGGAAAC < NC_007779/274373‑274130 ACTCACTATTTTCCACAGCAAATATAAAGTGTCAGTTTGCGACGCGAGCGGCATTTTAGGACATATCTTCCCCGGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCGCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTTAAATCGGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTTCAGCTGGTGAGTTAAGGAAGGTGC < 1:1442426/250‑1 ACTCACTATTTTCCACAGCAAATATAAAGTGTCAGTTTGCGACGCGAGCGGCATTTTAGGACATATCTTCCCCGGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCGCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTTAAATCGGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTTCAGCTGGTGAGTTAAGGAAGGTGC > 1:614604/1‑250 ACTCACTATTTTCCACAGCAAATATAAAGTGTCAGTTTGCGACGCGAGCGGCATTTTAGGACATATCTTCCCCGGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCGCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTTAAATCGGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTTCAGCTGGTGAGTTAAGGAAGGTGC < 2:318524/250‑1 ACTATTTTCCACAGCAAATATAAAGTGTCAGTTTGCGACGCGAGCGGCATTTTAGGACATATCTTCCCCGGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCGCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTTAAATCGGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTTCAGCTGGTGAGTTAAGGAAGGTGCGAAC < 1:787061/250‑1 TTTTCCACAGCAAATATAAAGTGTCAGTTTGCGACGCGAGCGGCATTTTAGGACATATCTTCCCCGGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCGCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTTAAATCGGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTTCAGCTGGTGAGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGT > 1:261717/1‑250 tgTCCACAGCAAATATAAAGTGTCAGTTTGCGACGCGAGCGGCATTTTAGGACATATCTTCCCCGGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCGCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTTAAATCGGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTTCAGCTGGTGAGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTC < 2:480692/248‑1 CACAGCAAATATAAAGTGTCAGTTTGCGACGCGAGCGGCATTTTAGGACATATCTTCCCCGGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCGCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTTAAATCGGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTTCAGCTGGTGAGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTG > 2:683430/1‑250 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ATAAAGTGTCAGTTTGCGACGCGAGCGGCATTTTAGGACATATCTTCCCCGGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCGCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTT‑AATCGGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTTCAGCTGGTGAGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCA > 1:914379/1‑250 ATAAAGTGTCAGATTGCGACGCGAGCGGCATTTTAGGACATATCTTCCCCGGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCGCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTTACATCAGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTTCAGCTGGTGAGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGGTC < 2:392468/250‑1 TAAAGTGTCAGTTTGCGACGCGAGCGGCATTTTAGGACATATCTTCCCCGGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCGCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTTAAATCGGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTTCAGCTGGTGAGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCA > 1:68540/1‑250 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AGTTTGCGACGCGAGCGGCATTTTAGGACATATCTTCCCCGGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCGCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTTAAATCGGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTTCAGCTGGTGAGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCA > 2:794857/1‑250 TTTGCGACGCGAGCGGCATTTTAGGACATATCTTCCCCGGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCGCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTTAAATCGGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTTCAGCTGGTGAGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATC > 1:662474/1‑250 TTTGCGACGCGAGCGGCATTTTAGGACATATCTTCCCCGGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCGCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTTAAATCGGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTTCAGCTGGTGAGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATC > 1:425621/1‑250 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TAGGACATATCTTCCCCGGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCGCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTTAAATCGGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTTCAGCTGGTGAGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTC < 2:631257/250‑1 TAGGACATATCTTCCCCGGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCGCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTTAAATCGGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTTCAGCTGGTGAGTTAAGGAAGGTGC > 1:504896/1‑194 TAGGACATATCTTCCCCGGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCGCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTTAAATCGGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTTCAGCTGGTGAGTTAAGGAAGGTGC < 2:504896/194‑1 GGACATATCTTCCCCGGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCGCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTTAAATCGGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTTCAGCTGGTGAGTTAAGGAAGGTTCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCAT < 1:310499/250‑1 GGACATATCTTCCCCGGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCGCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTTAAATCGGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTTCAGCTGGTGAGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCAT < 1:527241/250‑1 ATCTTCCCCGGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCTCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTTAAATCGGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTTCAGCTGGTGAGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAG > 2:857596/1‑250 TTCCCCGGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCGCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTTAAATCGGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTACAGCTGGTGAGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATC < 1:368126/218‑1 TCCCCGGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCGCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTTAAATCGGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTTCAGCTGGTGAGGTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCAT > 2:664086/1‑250 CCCCGGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCGCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTTAAATCGGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTTCAGCTGGTGAGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATC > 2:506378/1‑250 GGTTAACAGTCCTTGTTACGTCTGTGTGGCGCTTGATGCCAGCGGGTTTGCGCAAAAGCAAAGAAAAGTGTTTGTTAAATCGGCAATTCATCGCCGCATGTAACAAAATAATGCAAAAACGCGCTGTCGATATCACTTAATTATTGTGAATTTCAGCTGGTGAGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACT > 1:866529/1‑250 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAATTCAGCAGTAAGCGCCGTCAGACCAGAAAAGAGATTTTCTTGTCCCGCATGGAGCAGATTCTGCCATGGCAAAACATGGTGGAAGTCATCGAGCCGTTTTACCCCAAGGCTGGTAATGGCCGGCGACCTTATCCGCTGGAAAC < NC_007779/274373‑274130 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |