New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
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2:981808/250‑1 AAAATCCATTATTCGTCGTCGCCAATCTCATCATCAATGTTGACGTCCATGCCAGCGACAAGTTTCTTTCCTTGTTGAATGTTGAATGTTGAATGTTGAATGTTGAATGGACGAGTTTTTTGCGGGTTGTTCTGGATATCTGCATCCAGAAAACGCAAAAATGCATTCATAGTATGATCCTCCTGTTCATCTCCCAGTCGGCACATAAATACTTGCCCACCAGGCAGAATTTCGTAATGAATGCTGTCCT < 1:464896/250‑1 AATCCATTATTCGTCGTCGCCAATCTCATCATCAATGTTGACGTCCATGCCAGCGACAAGTTTCTTTCCTTGTTGAATGTTGAATGTTGAATGTTGAATGTTGAATGGACGAGTTTTTTGCGGGTTGTTCTGGATATCTGCATCCAGAAAACGCAAAAATGCATTCATAGTATGATCCTCCTGTTCATCTCCCAGTCGGCACATAAATACTTGCCCACCAGGCAGAATTTCGTAATGAATGCTGTCCTGG < 1:691388/250‑1 TCCATTATTCGTCGTCGCCAATCTCATCATCAATGTTGACGTCCATGCCAGCGACAAGTTTCTTTCCTTGTTGAATGTTGAATGTTGAATGTTGAATGTTGAATGGACGAGTTTTTTGCGGGTTGTTCTGGATATCTGCATCCAGAAAACGCAAAAATGCATTCATAGTATGATCCTCCTGTTCATCTCCCAGTCGGCACATAAATACTTGCCCACCAGGCAGAATTTCGTAATGAATGCTGTCCTGGCC < 1:115664/250‑1 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TGAATGTTGAATGTTGAATGTTGAATGGACGAGTTTTTTGCGGGTTGTTCTGGATATCTGCATCCAGAAAACGCAAAAATGCATTCATAGTATGATCCTCCTGTTCATCTCCCAGTCGGCACATAAATACTTGCCCACCAGGCAGAATTTCGTAATGAATGCTGTCCTGGCCTGGCTTCAGTTTTAAGGCCTCACGCACTGGCGCGGGGATAGTTGTTTGTCCGCGTATCGTGACCTTTGATTCAGTGGT < 2:1031699/250‑1 TGTTGAATGTTGAATGTTGAATGGACGAGTTTTTTGCGGGTTGTTCTGGATATCTGCATCCAGAAAACGCAAAAATGCATTCATAGTATGATCCTCCTGTTCATCTACCAGTCGGCACATAAATACTTGCCCACCAGGCAGAATTTCGTAATGAATGCTGTCCTGGCCTGGCTTCAGTTTTAAGGCCTCACGCACTGGCGCGGGGATAGTTGTTTGTCCGCGTATCGTGACCTTTGATTCAGTGGTCAGT < 2:1433635/250‑1 TGAATGTTGAATGTTGAATGGACGAGTTTTTTGCGGGTTGTTCTGGATATCTGCATCCAGAAAACGCAAAAATGCATTCATAGTATGATCCTCCTGTTCATCTCCCAGTCGGCACATAAATACTTGCCCACCAGGCAGAATTTCGTAATGAATGCTGTCCTGGCCTGGCTTCAGTTTTAAGGCCTCACGCACTGGCGCGGGGCTAGTTGTTTGTCCGCGTATCGTGACCTTTGATTCAGTGGTCAGTACA > 2:400335/1‑250 ||||| 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTTGAATGTTGAATGGACGAGTTTTTTGCGGGTTGTTCTGGATATCTGCATCCAGAAAACGCAAAAATGCATTCATAGTATGATCCTCCTGTTCATCTCCCAGTCGGCACATAAATACTTGCCCACCAGGCAGAATTTCGTAATGAATGCTGTCCTGGCCTGGCTTCAGTTTTAAGGCCTCACGCACTGGCGCGGGGATAGTTGTTTGTCCGCGTATCGTGACCTTTGATTCAGTGGTCAGTACAGC < NC_007779/3277128‑3276881 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |