| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_007779 | 310,704 | (T)8→7 | intergenic (‑192/‑632) | ecpR ← / → Y75_RS01525 | ECP biosynthesis operon DNA‑binding transcriptional regulator EcpR/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 310,697 | 0 | T | . | 97.0% | 590.9 / 13.8 | 131 | intergenic (‑185/‑639) | ecpR/Y75_RS01525 | ECP biosynthesis operon DNA‑binding transcriptional regulator EcpR/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/2); new base . (56/71); total (58/73) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 | |||||||||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |