Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_007779 | 1,213,665 | (C)8→9 | intergenic (‑85/+452) | iraM ← / ← Y75_RS24825 | anti‑adapter protein IraM/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 1,213,657 | 1 | . | C | 91.1% | 383.4 / 30.3 | 113 | intergenic (‑77/+460) | iraM/Y75_RS24825 | anti‑adapter protein IraM/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/6); new base C (50/53); total (54/59) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.45e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.86e-01 |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
ATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTAT‑ATTA‑CCCCC‑C‑CCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGTTTAGCTATAATGTTATACATTCAAATGACTGAACATCCTGTAATTAAAACATAGCCTTTATGCTACTTTGTGCCAATTTGCTAAACATTATGGTTGCCTTTTTATATA > NC_007779/1213412‑1213901 | atTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTTATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTAT‑ATTA‑cccc > 1:407314/1‑250 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |