| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_007779 | 3751790 = | 0 (0.000) | intergenic (+151/+116) | Y75_RS18600/tnaC | IS5‑like element IS5 family transposase/tryptophanase leader peptide | |||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
GGGTTGCTGAAAAACGATAACCAACTGGCGATGTTATTCACGCTGGCCAACCTGTTTCGGGCGGACCAAATGATACGTCAGTGGGAGAGATCTCACTAAAAACTGGGGATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAAACAAGTAAATAAACGAGAGATGACCTTTGCAAAAGGCAAAATTAAGATATAGCAAACAAATAGATCACATTGAATCTAATCGGTTTGGCTCTGGTGATGGCTACAGAAGGGCAAATCAAGGGCGGTGATCGACAATTTTGTTGTCAATATTGAACCATTTTGAGGTCACACATATATGTAAGATATTCATAATGCACTTATCCTCGCAAGACACGAGGCTACATTATTACACTCAGAGTTTTTGTCT > NC_007779/3751541‑3752037 | cgataaaaacatcttcgctatccagcaggaacgggttcataccggatttaataattgcctcttcacgataagcgcgagtggtacgttttactggctcaataacacgaatgcggaacggttcagggagatgtttaaagttttccattacataatccttcatttattttaattacagtgatccctgtgaatattacatctgctataccgattaattcgccagatatatatgcaagcaccatcatttactaaa < 2:170776‑M2/1‑1 (MQ=255) taaaaacatcttcgctatccagcaggaacgggttcataccggatttaataattgcctcttcacgataagcgcgagtggtacgttttactggctcaataacacgaatgcggaacggttcagggagatgtttaaagttttccattacataatccttcatttattttaattacagtgatccctgtgaatattacatctgctataccgattaattcgccagatatatatgcaagcaccatcatttactaaAACa < 2:130039‑M2/4‑1 (MQ=255) acatcttcgctatccagcaggaacgggttcataccggatttaataattgcctcttcacgataagcgcgagtggtacgttttactggctcaataacacgaatgcggaacggttcagggagatgtttaaagttttccattacataatccttcatttattttaattacagtgatccctgtgaatattacatctgctataccgattaattcgccagatatatatgcaagcaccatcatttactaaAACAAGtaa > 2:457991‑M2/242‑250 (MQ=255) cttcgctatccagcaggaacgggttcataccggatttaataattgcctcttcacgataagcgcgagtggtacgttttactggctcaataacacgaatgcggaacggttcagggagatgtttaaagttttccattacataatccttcatttattttaattacagtgatccctgtgaatattacatctgctataccgattaattcgccagatatatatgcaagcaccatcatttactaaAACAAGtaaataa < 1:949685‑M2/13‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |