| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 274373 | NA (NA) | 108 (0.920) | 94/496 | 0.5 | 97.3% | intergenic (‑32/‑176) | Y75_RS01335/mmuP | IS5‑like element IS5 family transposase/S‑methylmethionine permease |
| ? | NC_007779 | = 736808 | 3 (0.030) | intergenic (+167/‑59) | Y75_RS03640/Y75_RS03645 | hypothetical protein/ISAs1 family transposase | |||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
AAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/274143‑274373‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAGAGATTTTATTTCTCTTCACTACGAATTAGTTCATGCTGTATCTTTATTAAACATTCGTAAGACTCATTTTTGTTCGGGAGATGTG < NC_007779/736808‑736562 AAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATC > 2:188542/1‑250 AGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCATATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCT > 1:586633/1‑250 TCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAA < 2:967662/250‑1 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TAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTAT > 2:351372/1‑250 AAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGTGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATT > 1:881754/1‑250 ACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCTGGACAAGAAAAGCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAG < 2:425356/250‑1 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GACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAG > 1:665643/1‑250 GACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAG > 1:1119589/1‑250 TTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAG < 1:1058294/250‑1 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AATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATT > 2:376068/1‑250 AATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATT > 2:679265/1‑250 TTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTG < 2:688236/250‑1 TTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTG < 1:456113/250‑1 CACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTT < 2:874172/250‑1 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTC > 1:861668/1‑250 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGGTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACTCCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTC < 2:618513/250‑1 CGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCA > 1:935345/1‑250 GCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGG > 1:861655/1‑250 AAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAG > 1:762352/1‑250 AAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAGAGATT > 1:757986/1‑250 AAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAGAGATT > 1:227598/1‑250 ATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAGAGATTTTATTT < 2:575706/250‑1 ACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAGAGATTTTATTTCTC < 2:807137/250‑1 CTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAGAGATTTTATTTCTCT < 2:1068809/250‑1 TCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAGAGATTTTATTTCTCTT > 2:986402/1‑250 TCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAGAGATTTTATTTCTCTT > 2:1043461/1‑250 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAGAGATTTTATTTCTCTTCA < 1:980108/250‑1 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TTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAGAGATTTTATTTCTCTTCACTACGAATTAGTT < 1:842065/250‑1 CTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAGAGATTTTATTTCTCTTCACTACGAATTAGTTCATGCTGT > 2:259109/1‑250 ACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAGAGATTTTATTTCTCTTCACTACGAATTAGTTCATGCTGTATCTTTATT > 2:1076860/1‑250 ACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAGAGATTTTATTTCTCTTCACTACGAATTAGTTCATGCTGTATCTTTATT > 1:772194/1‑250 ACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAGAGATTTTATTTCTCTTCACTACGAATTAGTTCATGCTGTATCTTTATTAAAC > 1:1059618/1‑250 ACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAGAGATTTTATTTCTCTTCACTACGAATTAGTTCATGCTGTATCTTTATTAAAC < 2:313455/250‑1 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CTTGTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAGAGATTTTATTTCTCTTCACTACGAATTAGTTCATGCTGTATCTTTATTAAACATTCGTAAGACTCATTTTTG < 1:993411/250‑1 GTTCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAGAGATTTTATTTCTCTTCACTACGAATTAGTTCATGCTGTATCTTTATTAAACATTCGTAAGACTCATTTTTGTTC < 2:935345/250‑1 TCGCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAGAGATTTTATTTCTCTTCACTACGAATTAGTTCATGCTGTATCTTTATTAAACATTCGTAAGACTCATTTTTGTTCGG > 1:394065/1‑250 GCACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAGAGATTTTATTTCTCTTCACTACGAATTAGTTCATGCTGTATCTTTATTAAACATTC < 2:794976/227‑1 CACCTTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAGAGATTTTATTTCTCTTCACTACGAATTAGTTCATGCTGTATCTTTATTAAACATTCGTAAGACTCATTTTTGTTCGGGAG > 2:965736/1‑250 TTCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAGAGATTTTATTTCTCTTCACTACGAATTAGTTCATGCTGTATCTTTATTAAACATTCGTAAGACTCATTTTTGTTCGGGAGATGT < 1:271778/250‑1 TCCTTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAGAGATTTTATTTCTCTTCACTACGAATTAGTTCATGCTGTATCTTTATTAAACATTCGTAAGACTCATTTTTGTTCGGGAGATGTG > 1:646711/1‑250 AAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/274143‑274373‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGACAATAAGTAGTATCTCAATTGTTGAACTTAAAATTCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGCAAATGGAACGCAAAATAAACACCTATTCCATGAGTTATATAATTTTTCACAATGATTAATTTGTTTTCTCAGGAAGAGATTTTATTTCTCTTCACTACGAATTAGTTCATGCTGTATCTTTATTAAACATTCGTAAGACTCATTTTTGTTCGGGAGATGTG < NC_007779/736808‑736562 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |