Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | NC_007779 | 2,288,259 | (TTATCGCCT)2→3 | coding (550/1761 nt) | pbgA → | cardiolipin transport protein PbgA |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_007779 | = 2288240 | 0 (0.000) | 90 (0.790) +TTTATCGCC |
85/440 | 0.4 | 100% | coding (531/1761 nt) | pbgA | cardiolipin transport protein PbgA |
? | NC_007779 | 2288241 = | 0 (0.000) | coding (532/1761 nt) | pbgA | cardiolipin transport protein PbgA |
CGGCGGGAATGACGCTATTACTGATCGATAGCGAAGTCTTTACTCGTTTCCATCTCCATCTTAATCCCATCGTCTGGCAACTGGTTATCAACCCAGACGAAAATGAGATGGCGCGCGACTGGCAGCTGATGTTCATCAGCGTGCCGGTTATTTTATTGCTTGAACTGGTGTTTGCGACGTGGAGCTGGCAAAAGCTGCGCAGCCTGACGCGTCGTCGACGCTTCGCGCGCCCGCTGGCCGCATTCTTATTTATCGCCTTTATCGCCTCGCATGTGGTGTATATCTGGGCCGATGCCAACTTCTATCGCCCGATCACCATGCAGCGCGCTAACCTGCCGCTTTCGTACCCGATGACGGCGCGACGTTTTCTTGAGAAGCATGGTCTGCTTGATGCGCAGGAGTATCAACGCCGTCTTATTGAGCAAGGTAATCCAGACGCCGTTTCCGTTCAGTATCCGTTAAGCGAACTGCGCTATCGCGATATGGGCACCGGGCAGA > NC_007779/2287993‑2288490 | tgacgctattactgatcgatagcgaagtctttactcgtttccatctccatcttaatcccatcgtctggcaactggttatcaacccagacgaaaatgagatggcgcgcgactggcagctgatgttcatcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgcctt < 1:191721‑M2/2‑1 (MQ=255) cgctattactgatcgatagcgaagtctttactcgtttccatctccatcttaatcccatcgtctggcaactggttatcaacccagacgaaaatgagatggcgcgcgactggcagctgatgttcatcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgcctttat > 2:1024311‑M2/246‑250 (MQ=255) ctattactgatcgatagcgaagtctttactcgtttccatctccatcttacgcccatcgtctggcaactggttatcaacccagacgaaaatgagatggcgcgcgactggcagctgatgttcatcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgcctttatcg < 2:790017‑M2/7‑1 (MQ=255) attactgatcgatagcgaagtctttactcgtttccatctccatcttaatcccatcgtctggcaactggttatcaacccagacgaaaatgagatggcgcgcgactggcagctgatgttcatcagcgtgccggttattttattgcttgaactggtgtttgcgacgtggagctggcaaaagctgcgcagcctgacgcgtcgtcgacgcttcgcgcgcccgctggccgcattcttatttatcgcctttatcgcc > 1:560485‑M2/242‑250 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |