| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,621,636 | A→G | 5.0% | L221P (CTG→CCG) | yfgF ← | cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase, anaerobic |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,621,636 | 0 | A | G | 5.0% | 226.9 / 2.6 | 80 | L221P (CTG→CCG) | yfgF | cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase, anaerobic |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (23/52); new base G (2/2); total (26/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.87e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.28e-01 | |||||||||||
CCAGAGCAGCGAAATCAGCTTATAACCATAGCGCATCGCTCCCCACATCATCAGGGGCAGCAATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGTAGCACAGCGGGACACCGATCAGATTACCCACCAGTA > CP009273/2621488‑2621783 | ccAGAGCAGCTAAATCATCTTATAACCATAGCGCATCGCTCACCACATCAACAGGGGCAGCAATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCa < 1:165591/149‑1 (MQ=255) cagcGAAATCAGCTTATAACCATAGCGCATCGCTCCCCACATCATCAGGGGCAGCAATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGcc > 1:121472/1‑149 (MQ=255) cGAAATCAGCTTATAACCATAGCGCATCGCTCCCCACATCATCAGGGGCAGCAATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTa > 2:897462/1‑143 (MQ=255) aaaTCAGCTTATAACCATAGCGCATCGCTCCCCACATCATCAGGGGCAGCAATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAgc > 1:1113278/1‑149 (MQ=255) aaaTCAGCTTATAACCATAGCGCATCGCTCCCCACATCATCAGGGGCAGCAATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAgc > 1:472177/1‑149 (MQ=255) aTCAGCTTATAACCATAGCGCATCGCTCCCCACATCATCAGGGGCAGCAATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCa < 2:1110728/143‑1 (MQ=255) aTCAGCTTATAACCATAGCGCATCGCTCCCCACATCATCAGCGGCCGGAAGAAGGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAgcgc < 1:1269789/149‑1 (MQ=255) aTCAGCTTATAACCATAGCGCAGCGCTCCCCACATCATCAGGGGCAGCAATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAgcgc < 1:492032/149‑1 (MQ=255) cAGCTTATAACCATAGCGCATCGCTCCCCACATCATCAGGGGCAGCAATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGa < 1:901490/149‑1 (MQ=255) ttATAACCATAGCGCATCGCTCCCCACATCATCAGGGGCAGCAATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAActc > 1:404693/1‑149 (MQ=255) ttATAACCATAGCGCATCGCTCCCAACATCATCAGGGGCAGCAATAATGACAAGGTATAATTGGAGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATACAAGTAGCAAGAGAGCGAAcgc > 1:966636/1‑147 (MQ=255) aaCCATAGCGCATCGCTCCCCACATCATCAGGGGCAGCAATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCtttt < 1:458908/149‑1 (MQ=255) ccATAGCGCATCGCTCCCCACATCATCAGGGGCAGCAATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTGTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCtttttt < 1:74714/149‑1 (MQ=255) cctAGCGCATCGCTCCCCACATCATCAGGGGCAGCGATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTg < 1:724323/147‑1 (MQ=255) cATAGCGCATCGCTCCCCACATCATCAGGGGCAGCAATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTg < 1:1165852/149‑1 (MQ=255) gcATCGCTCCCCACATCATCAGGGGCAGCAATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCCGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACt > 1:600922/1‑149 (MQ=255) cTCCCCACATCATCAGGGGCAGCAATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCa < 1:264992/149‑1 (MQ=255) catcatCAGGGGCAGCAATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCGGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACct > 1:56130/1‑149 (MQ=255) catcatCAGGGGCAGCAATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCGGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACct > 1:56043/1‑149 (MQ=255) atcatcAGGGGCAGCAATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACctg > 1:1031799/1‑149 (MQ=255) tcatcaGGGGCAGCAATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAAATCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACctgc > 1:212739/1‑149 (MQ=255) aGGGGCAGCAATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACctg < 2:632096/143‑1 (MQ=255) aGGGGCAGCAATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACctg < 2:767960/143‑1 (MQ=255) cagcaATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGtt > 2:657768/1‑143 (MQ=255) agcaATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTg < 1:355194/149‑1 (MQ=255) agcaATAAGGACAAGGTATAATTGGGGTTAAAAATTTTGCTTTTTTCACTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTg < 1:914018/149‑1 (MQ=255) caaataatGACAAGGTATAATTGGTGCAAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGc < 1:22630/147‑1 (MQ=255) taatGAGAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAAtt < 2:875180/143‑1 (MQ=255) atGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGaataa < 1:798125/149‑1 (MQ=255) aatgTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTGCCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCt < 1:358285/146‑1 (MQ=255) gtataatagaaaaaaaaaaTTGTGCTTTTTACATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAataata < 2:191507/129‑1 (MQ=255) gTATAATTGGTGCTAAAAACTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAataata < 2:925944/143‑1 (MQ=255) tataATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGt < 1:921300/149‑1 (MQ=255) cTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATgg > 1:356059/1‑149 (MQ=255) 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ttttttCATTTAACGGCATGCATAACAGAAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCCTCAACCTGCTGTTTTAAGTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTAcc > 1:1161934/1‑149 (MQ=255) tttCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATGATCCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACt < 2:743262/143‑1 (MQ=255) tttCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTGAAAAAAATGGATTGCGCACt > 2:587291/1‑143 (MQ=255) ttCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGTCTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTATTTGCGATTAATAGCTACGTATATAAAATGGATTTCGCACTa > 2:447033/1‑143 (MQ=255) ttCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGaa > 1:989540/1‑149 (MQ=255) cATTTAACGGCATGCATGACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATCAAATGGATTTCGCACTACCCGAatg < 1:654255/149‑1 (MQ=255) cATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAatg < 1:545399/149‑1 (MQ=255) tttAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAatgat < 1:513282/149‑1 (MQ=255) tAACGGCAGGCACAACAGTAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGaa < 2:794891/143‑1 (MQ=255) aaCGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGaa < 1:621153/149‑1 (MQ=255) cGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCAAAACGCCTTTATTGTATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGt < 1:958998/149‑1 (MQ=255) gatggatAACAGCAATAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATCGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAAtgatga < 2:54987/142‑1 (MQ=255) tgcatAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGAGTTCGCACTACCCGAATGATGAAGTAGcgc > 1:574712/1‑147 (MQ=255) gcatAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGt < 2:765089/143‑1 (MQ=255) atAACAGCAACAATAAAGCACCTAAAGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGTAGCACAGc > 1:655053/1‑149 (MQ=255) tAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGTAGCACAGCg < 1:244867/149‑1 (MQ=255) gCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGTAGCACAGc < 2:136893/143‑1 (MQ=255) caacaaTAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTCTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGTAGCACAGCGGGacac < 1:1297406/149‑1 (MQ=255) caagtaaGCAACTAATGCCAGTGGCCAGAGCGCGACCTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTTCGAATAATAGCTACGTAAATCAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGTAGCACAGCGGGACACCGa < 1:259150/144‑1 (MQ=255) caaTAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGTAGCACAGCGGGa < 2:435229/143‑1 (MQ=255) caaTAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGTAGCACAGCGGGa < 2:1001004/143‑1 (MQ=255) aaTAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGCTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGCATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAACGATGAAGTAGCACAGCGGGACACCGAt < 1:695570/149‑1 (MQ=255) aTAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGAAGCACAGCGGGaca > 2:261838/1‑143 (MQ=255) aTAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGACATCAACCTGCAGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGTAGCACAGCAGGacc > 2:89165/1‑142 (MQ=255) tAAAGCACTTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCGACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGTAGCACAGCGGGacac < 2:137934/143‑1 (MQ=255) aaaGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGTAGCACAGCGGGACACCGATCAg < 1:1256265/149‑1 (MQ=255) tggCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTATTTGCGAATAATAGGTACGTGAATAAAAGGGATTTGGCAGTAGCGGGATGTTGGAGTGGCACGGGGGGAGACCg > 2:522824/3‑143 (MQ=255) cACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGTGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATTATGAAGTAGCACAGCGGGACACCGATCAGATTa < 1:1120035/149‑1 (MQ=255) tAATGCCAGTAGCCAGAGGGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGTAGCACAGCGGGACACCGATCAGATTACcca < 1:1109230/149‑1 (MQ=255) tAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGTAGCACAGCGGGACACCGATCAGAt < 2:30500/143‑1 (MQ=255) gaaTGCCAGTAGCCAGGGCGCGAGCTCTTTTTTGGTGACTGTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGTAGCACAGCGGGACACCGATCAGAt < 2:456781/142‑1 (MQ=255) aaTGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGTAGCACAGCGGGACACCGATCAGATTACccac < 1:762079/149‑1 (MQ=255) aTGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGTAGCACAGCGGGACACCGATCAGATTACccacc < 1:494322/149‑1 (MQ=255) aTGCCAGTAACCCGATCGCGAACTCGTTTTTGTGGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGTAGCACAGCGGGACACCGATCAGATTa > 2:1140023/1‑143 (MQ=255) tGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGTAGCACAGCGGGACACCGATCAGATTACccacca < 1:715742/149‑1 (MQ=255) ccAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGTAGCACAGCGGGACACCGATCAGATTAccc < 2:379875/143‑1 (MQ=255) cAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGAGGAAGTAGCACAGCGGGACACCGATCCGATTACCCACCAGTa > 1:1198390/1‑149 (MQ=255) agtagtCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGTAGCACAGCGGGACACCGATCAGATTACccac < 2:1050721/143‑1 (MQ=255) | CCAGAGCAGCGAAATCAGCTTATAACCATAGCGCATCGCTCCCCACATCATCAGGGGCAGCAATAATGACAAGGTATAATTGGTGCTAAAAATTGTGCTTTTTTCATTTAACGGCATGCATAACAGCAACAATAAAGCACCTAATGCCAGTAGCCAGAGCGCGAACTCTTTTTTGGTGACTTTGGCATCAACCTGCTGTTTTAATTGCGAATAATAGCTACGTAAATAAAATGGATTTCGCACTACCCGAATGATGAAGTAGCACAGCGGGACACCGATCAGATTACCCACCAGTA > CP009273/2621488‑2621783 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |