| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 498909 | 101 (0.840) | 6 (0.050) | 6/272 | 16.0 | 6.0% | intergenic (‑215/+23) | ybaL/fsr | inner membrane putative NAD(P)‑binding transporter/putative fosmidomycin efflux system protein |
| ? | CP009273 | = 498914 | 93 (0.840) | intergenic (‑220/+18) | ybaL/fsr | inner membrane putative NAD(P)‑binding transporter/putative fosmidomycin efflux system protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
TTATGACAATTTCATTGATGATGTTCATGAATAATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGACTAACTCGATGCTGGTGTGATCGGCGATAAGCCCCAGAACTGCCGC > CP009273/498762‑499054 | ttATGACAATTTCATTGATGATGTTCATGAATAATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGt < 2:1385281/149‑1 (MQ=255) aTGAGAATTTCATTTATGATGGTCATGAATAACTATTGAATGTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGttt < 1:365223/149‑1 (MQ=255) aTGACAATTTCATTGATGATGTTCATGAATAATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGttt < 2:887054/149‑1 (MQ=255) gACAATTTCATTGATGATGTTCATGAATAATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAggcaaa > 2:903182/1‑144 (MQ=255) gACAATTTCATTGATGATGTTCATGAATAATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑c > 2:1066624/1‑149 (MQ=255) gACAATTTCATTGATGATGTTCATGAATAATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTGATGGTGACTGCAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑c > 2:612634/1‑149 (MQ=255) gACAATTTCATTAATAATGTTCATGAATTATTATTTAATTTTGCAGACAAATGTAATTATTTGAAAAAAAATCAAGGATCGGAAATCAGAAGGCGTTTTAACATAGGAAAGGCCTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAGGTTTG‑c > 2:913253/1‑149 (MQ=255) aCAATTTCATTGATGATGTTCATGAATAATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑cc > 2:1883020/1‑149 (MQ=255) tCATTGATGATGTTCATGAATAATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAggcaaactttggc < 1:1766465/149‑13 (MQ=255) cactgatgaGGTTCATGAATAATTATTGAATTCTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCt < 1:1631036/146‑1 (MQ=255) cATTGATGATGTTCATGAATAATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAggcaaactttggct < 2:276382/149‑14 (MQ=255) aTTGATGATGTTCATGAATAATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTg < 2:934435/149‑1 (MQ=255) aTTGATGATGTTCATGAATAATTATTGAATTGTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTg < 1:1861649/149‑1 (MQ=255) ttGATGATGTTCATGAATAATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGc > 1:337490/1‑149 (MQ=255) atgatgTTCATGAATAATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAAt > 2:1916920/1‑149 (MQ=255) aggaaggtCAGGAATAAGGATAGAATGCTGCAGAAAAACGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGGAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAAt < 2:1631353/142‑1 (MQ=255) tgatgTTCATGAATAATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGGCAGGACCGTAAAACAGAAGGCGGTTTAAGAGAGGAAATGCTGATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCCAAGTGTG‑CCTTTTGCTGCAATg > 1:378549/1‑149 (MQ=255) ttCCTGAATAATTATTGAATTTTGCTGAAAAATGGAATTACTTGCGAATGTGTCGCGGGGCGGAAACCTGAAGGCGGTTTAACCGAGGCAACGCTCTTGGTGACGGTAAAACCGTGGAGTCAAAGTTTG‑CTTTTGGCTGCAATGaaagc < 2:268377/149‑3 (MQ=255) tCATGAATAATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGGCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAAGCa > 2:1691853/1‑149 (MQ=255) tCATGAATAATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCa > 1:239237/1‑149 (MQ=255) aTGAATAATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGGTCGGGAAACAGAAGGCGGTTTAACAGGGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCATTGGCTGCAATGAAATAAGt > 1:604053/1‑149 (MQ=255) gAATGATTATTAAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGCCt > 2:181280/1‑149 (MQ=255) gAATAATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAGAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTcc > 1:1712001/1‑148 (MQ=255) aataatTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGCCtt > 2:15949/1‑149 (MQ=255) ataatTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCttt < 1:1657834/149‑1 (MQ=255) ttagtGAATTGTCAAGAAAAATGGCATCAGCTGCAAAAAAGGCCCGCGCCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGACTAAAGGCTTATGGTGACTGTAAATCGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGc < 1:33335/149‑1 (MQ=255) tattGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGcc < 2:1176107/149‑1 (MQ=255) attGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCCCGCACCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCg < 2:811660/149‑1 (MQ=255) ttGAATTTTGCAGAAAAACGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCgg > 1:1151106/1‑149 (MQ=255) aaTTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCACAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTa > 1:1247381/1‑149 (MQ=255) ttttGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATc > 1:1663497/1‑149 (MQ=255) tttGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATca < 1:1254838/149‑1 (MQ=255) tttGCACAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACGGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATca < 1:976945/149‑1 (MQ=255) tGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAGAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCACTGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATcagg < 1:1204979/149‑1 (MQ=255) aGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATcaggcag > 2:566024/1‑149 (MQ=255) aGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATcaggcag > 1:1517235/1‑149 (MQ=255) aaaaaTGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCGGGTTATCAGGCAGGa > 2:1133255/1‑149 (MQ=255) aaaTGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CGTTTGGCTGCAATGAAGCCCGTCTTTATGCAGGTTATCAGGCAGGAat > 2:942678/1‑149 (MQ=255) aaaTGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAat < 1:1357799/149‑1 (MQ=255) aaTTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTc < 2:248578/149‑1 (MQ=255) aTTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCa < 1:1390950/149‑1 (MQ=255) ttAGCTGAAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATCCATACCGTTTTGATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCaa < 1:964949/149‑1 (MQ=255) gCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACAt > 1:1138022/1‑149 (MQ=255) tGCAAAAAAAGCAAGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAAGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATcc > 1:1406282/1‑149 (MQ=255) aaaaaaaGCACGGATCGGAAAACAGACGGCGGGTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CATTTGGCTGCACTGAAATCAGTCCTTATGCCGGGTATCTGGCAGGAATAGGGTCAACCACCCCa > 2:1789081/1‑149 (MQ=255) aaaaaaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCa > 1:609130/1‑149 (MQ=255) aaaaaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATTAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCaa < 1:1353988/149‑1 (MQ=255) aaaaaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTGAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCaa < 2:839806/149‑1 (MQ=255) aaaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATa > 2:1649680/1‑149 (MQ=255) aaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGt < 2:1822422/149‑1 (MQ=255) gCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTgg < 1:574054/149‑1 (MQ=255) gCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGATGCAATTAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTgg < 1:1531471/149‑1 (MQ=255) aCGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGGAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCa < 1:230545/149‑1 (MQ=255) tCGGAAAACATAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATTAGCATTTACGCCGGTTACCAGGCAGGAATATGGTTAACTTCCCCAATAGTGGCAGGaaa < 2:1445822/149‑1 (MQ=255) tCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAACCTGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGaaa < 1:469230/149‑1 (MQ=255) tCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTCTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATCCCGGTTATCAGGCGTCAATATGGTCAACATCCCCTATAGTGGCAGGaaa < 1:1449059/149‑1 (MQ=255) gAAAATAGACGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGTTTACTCTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGca < 2:943103/149‑1 (MQ=255) gAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGca > 1:1498962/1‑149 (MQ=255) aaaaCAGGAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTT‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTCTCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGcac < 2:1466900/149‑1 (MQ=255) aaaaCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATACCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGcac > 1:176658/1‑149 (MQ=255) aaaCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGACTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTAGCAGGCAGGAATATGGTCAACAGCCCCAATAGTGGCAGGAAAGaacg > 1:794292/1‑148 (MQ=255) cAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGAt > 1:1718336/1‑149 (MQ=255) gAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGAttt < 2:1247381/149‑1 (MQ=255) gAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGAttt > 2:1119325/1‑149 (MQ=255) aaGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATG‑AACTAGTATTTGTTCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGAtttt < 1:376650/149‑1 (MQ=255) ggCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCTGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTtat < 1:802161/149‑1 (MQ=255) ggCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTtat < 1:1066624/149‑1 (MQ=255) gCGTTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGTCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTtata < 2:1198463/149‑1 (MQ=255) gCGGTTTAACCGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTtata < 2:780238/149‑1 (MQ=255) cGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CGTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAg > 2:1280235/1‑149 (MQ=255) gtagaaCAGAGCAAACGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAATTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCACGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGAc < 2:378549/145‑1 (MQ=255) tttAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAGATCAGGCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCGATAGTGGCCGGAAAGCACAGCTTTGATAGACt > 2:1106819/1‑149 (MQ=255) ttAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTCTATAGGCTa > 2:697896/1‑149 (MQ=255) aaCAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGACTAAc < 1:208426/149‑1 (MQ=255) aCAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGACTAACt > 1:769530/1‑149 (MQ=255) cAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGACTACCTc > 1:1494532/1‑149 (MQ=255) agagGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGACTAACTCg > 2:783122/1‑149 (MQ=255) agagGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGACTAACTCg > 2:313167/1‑149 (MQ=255) agagGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGAGCAGATTTTATAGACTaattgg > 1:250539/1‑145 (MQ=255) gAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGACTAACTCGATGc > 1:935931/1‑149 (MQ=255) gAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGCTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGAGTCAGGAAAGCACAGACTTTATAGACTAACTccctcc > 2:452909/1‑144 (MQ=255) aaGGCTTGGGGTGACTGTAAACCCATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGACTAACTCGATGCTg < 2:971243/149‑1 (MQ=255) aaGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGACTAACTCGATGCTg > 1:571749/1‑149 (MQ=255) aGGCTTATGGTGACTGTAAAACGAGGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGACTAACTCGATGCTgg < 2:1958474/149‑1 (MQ=255) gCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGACTAACTCGATGCTGgtg < 1:1595850/149‑1 (MQ=255) ttATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGACGAACTCGATGCggggttg > 2:930182/1‑145 (MQ=255) gTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGACTAACTCGATGCTGGTGTGATCgg > 1:671591/1‑149 (MQ=255) gTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATAAGGCAGGAATATGCACACTAGCCCCAAGAGTGGCAGGAGAAGAAAGATTTTATAGACTAACCCGAtacggaggtgctcgg > 1:460467/1‑135 (MQ=255) aCTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGACTAACTCGATGCTGGGGTGATCGGCgc > 1:1884967/1‑148 (MQ=255) tAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGACTAACTCGATGCTGGTGTGATCGGCGATAAg > 2:1160792/1‑149 (MQ=255) aaaCGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCCGACTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGCTCAACCTCCCCAATAGCGGAAGGAAAGCACCGATTTAATAGACTCACTCGACGCAGGTGTGGGCGGCGAtctccc > 2:56329/1‑144 (MQ=255) aaCGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGACTAACTCGATGCTGGTGTGATCGGCGATAAGccc < 1:783122/149‑1 (MQ=255) cGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGACTAACTCGATGCTGGTGTGATCGGCGATAAGCCCCa < 2:565243/149‑1 (MQ=255) cGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGACTAACTCGATGCTGGTGTGATCGGCGATAAGCCCCa < 2:337490/149‑1 (MQ=255) gCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATATTATAGACTAACTCGATGCTGGTGTGATCGGCCATAAGCCCCGGAAc > 2:105893/1‑149 (MQ=255) aGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGACTAACTCGATGCTGGTGTGATCGGCGATAAGCCCCAGAACTg < 2:769530/149‑1 (MQ=255) gCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGACTAACTCGATGCTGGTGTGATCGGCGATAAGCCCCAGAACTGc < 1:969916/149‑1 (MQ=255) ccAAAGGCTG‑CCTTTGGCTGCAATGGAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCACGAAAGCACAGATTTTATAGACTAACACGATGCTGGTGTGATCGGCGATAAGCCCCGGATCTgaa < 2:1221338/149‑3 (MQ=255) cAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGACTAACTCGATGCTGGTGTGATCGGCGATAAGCCCCAGAACTGCCg > 1:825130/1‑149 (MQ=255) aaaGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAACCAGTTTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAAGAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGACTAACTCGATGCTGGTGTGATCGGCGATAAGCCCCAGAACTGCCGc < 2:1581446/149‑1 (MQ=255) | TTATGACAATTTCATTGATGATGTTCATGAATAATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTG‑CCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATCCCCAATAGTGGCAGGAAAGCACAGATTTTATAGACTAACTCGATGCTGGTGTGATCGGCGATAAGCCCCAGAACTGCCGC > CP009273/498762‑499054 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |