| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2509092 | NA (NA) | 99 (0.910) | 75/282 | 0.4 | 90.2% | intergenic (+170/+30) | insL1/yfeA | IS186 transposase/putative diguanylate cyclase |
| ? | CP009273 | 3052006 = | 11 (0.100) | intergenic (‑237/+19) | serA/rpiA | D‑3‑phosphoglycerate dehydrogenase/ribose 5‑phosphate isomerase, constitutive | |||||
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
TTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGCCAGGAATCGCATTTATGGCGTTTTCCATCGCTATCGGGTCA > CP009273/3051859‑3052154 | tggtcatctggagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgg < 1:1671337‑M2/2‑1 (MQ=255) tcattcggagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAg < 1:1343497‑M2/5‑1 (MQ=255) cGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAg < 1:359311/149‑1 (MQ=255) gcgATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACggggg > 2:1118607/1‑143 (MQ=255) ctggagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgtggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatggg > 2:768998‑M2/141‑143 (MQ=255) cgATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGa < 2:1637029/143‑1 (MQ=255) gATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGTGGGAg < 2:117120/143‑1 (MQ=255) aTGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCC > 1:754684‑M2/1‑149 (MQ=255) ttGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTCGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTc > 2:642816/1‑143 (MQ=255) cttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGt < 1:173843‑M2/15‑1 (MQ=255) tGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATACGCTGTGTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataa > 1:526850‑M2/1‑145 (MQ=255) acaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTcccc > 2:667124‑M2/132‑143 (MQ=255) gAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATAGTCTGGTTTAGATGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACAGGTCACTAAACTCCATGAATGGAATTTTTTTAACGGGGGTGGTTCCCCat > 2:802356‑M2/1‑141 (MQ=255) gAAATATCACGCAAAGGTAATTCTGGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgc > 1:516119‑M2/1‑141 (MQ=255) aggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagctggttcgactcttaaggtagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGAt > 1:1773274‑M2/130‑149 (MQ=255) aggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGAt < 1:669207‑M2/20‑1 (MQ=255) aaaTATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTTCCCataagcgct < 1:512308‑M2/149‑10 (MQ=255) tggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGCCAGACCAt > 1:124495‑M2/127‑149 (MQ=255) cgcgcagctgtaattcttgGATGAACAAGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaactta > 1:908298‑M2/10‑134 (MQ=255) attcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTcac > 1:1108946‑M2/122‑149 (MQ=255) cAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaact > 2:30600‑M2/1‑130 (MQ=255) gacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGttt < 1:28861‑M2/36‑1 (MQ=255) agtatccctgacagcctacaaatcgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcggcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGa < 1:58417‑M2/39‑1 (MQ=255) tccctgaccgcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATtgttgt < 2:728789‑M2/37‑3 (MQ=255) tGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacg < 1:982227‑M2/149‑33 (MQ=255) gATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgac < 1:430428‑M2/149‑35 (MQ=255) gATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtat > 2:699659‑M2/1‑115 (MQ=255) aTGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtatt < 2:951941‑M2/143‑30 (MQ=255) aTGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtatt < 2:1588159‑M2/143‑30 (MQ=255) tGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGATAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataggcgctaacttaaggggtgtggtattacgcctg < 1:1392887‑M2/149‑37 (MQ=255) tGAATATGCTGGGTTAGAGGATTTATTTAGAGCAAGCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctg > 1:1844307‑M2/1‑113 (MQ=255) gacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGacac > 2:1497098‑M2/102‑143 (MQ=255) gAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattac > 2:1667564‑M2/1‑112 (MQ=255) cctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTGAGATCATTTCACAATGGTTTTGTCACCGTCAGGtgtg > 1:1253957‑M2/97‑149 (MQ=255) tGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatga > 1:1746973‑M2/1‑107 (MQ=255) ctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGc < 1:711980‑M2/54‑1 (MQ=255) tacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCCGATCATTTCACAAtggttttgacagacactcg > 2:48231‑M2/95‑135 (MQ=255) gCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctga < 2:320066‑M2/143‑38 (MQ=255) gtgGGTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAATAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgat > 2:467111‑M2/2‑105 (MQ=255) aaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGgttttgacacctgacggtgt < 2:1719220‑M2/52‑10 (MQ=255) ttAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgat > 2:1419813‑M2/1‑100 (MQ=255) ataggaTTTAGTTAGGGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtagtacgcctgatatgatttaacgtg > 1:1214145‑M2/3‑98 (MQ=255) caattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttgagttagcgcttatGGGAGGTTCACACGTCAGCTCATTTCGCTATGGTTTTGTCACCTTTAGGTGTGCCAAt < 2:1020794‑M2/58‑1 (MQ=255) ttgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAAc > 1:210230‑M2/83‑149 (MQ=255) aagcacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAgcgc > 2:18039‑M2/80‑143 (MQ=255) gcacgcgagtcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaactcttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACCATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCaa < 2:956892‑M2/66‑1 (MQ=255) aattagaGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGCCACCAATTTTGTTGAAAAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTTCCCataagcgctaacttgagggttgtggtagtacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaat > 1:445093‑M2/3‑89 (MQ=255) aacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAAc < 2:1745952‑M2/67‑1 (MQ=255) gcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGcc > 1:630115‑M2/74‑149 (MQ=255) agCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaat > 2:787440‑M2/1‑83 (MQ=255) gCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAAGTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctc > 1:832156‑M2/1‑82 (MQ=255) gcaccgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCgcgc < 2:468455‑M2/75‑1 (MQ=255) ttgacAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactc < 2:887320‑M2/141‑66 (MQ=255) tCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacga < 1:77546‑M2/149‑72 (MQ=255) cgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCTAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGc < 1:1000273‑M2/85‑1 (MQ=255) tcttaacgaggcatcgaggcgtggcgttcttcagatggttcgactgttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCTTCGTCAGATCATTTCACACTGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCGTCGCAACGGt > 2:1060236‑M2/63‑143 (MQ=255) aacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGc < 2:1010461‑M2/85‑1 (MQ=255) gaggcaccgaggcgtcgcatgctgcagatggttcaacccttaagttagcggttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGcc < 1:728955‑M2/94‑1 (MQ=255) cTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcccgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataact > 2:838634‑M2/1‑67 (MQ=255) aggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCa > 1:779671‑M2/55‑149 (MQ=255) ggTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattatgcctgatatgaattcagtaattgatgaattactctcacgataactggtcagca > 1:935492‑M2/1‑65 (MQ=255) gcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACaa > 2:1429619‑M2/53‑143 (MQ=255) gcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTCCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACaa < 2:1054077‑M2/91‑1 (MQ=255) aaaGCGTGACACATGGCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcag > 2:1261750‑M2/1‑61 (MQ=255) gaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATAATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGGGCCAATCAGCACAACGTCCGCGCCACGGGTAGCAAACAGGCCAACAGTca > 1:1178012‑M2/48‑149 (MQ=255) gaggcgtcgcattcttcagatggtgcaacccgtaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCaa < 2:427956‑M2/96‑1 (MQ=255) aGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctg > 1:307757‑M2/1‑59 (MQ=255) tcgccttcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGc < 1:1183256‑M2/108‑1 (MQ=255) tcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCGTTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGc > 1:1012988‑M2/42‑149 (MQ=255) tcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAACCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTca > 2:527041‑M2/42‑143 (MQ=255) acacATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccat < 1:1054655‑M2/149‑97 (MQ=255) acacATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccat < 1:19108‑M2/149‑97 (MQ=255) acacATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccat > 1:1527135‑M2/1‑53 (MQ=255) acacATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctg > 2:1281561‑M2/1‑53 (MQ=255) cgcattcgtcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTcac < 2:1629184‑M2/103‑1 (MQ=255) cacaTGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctgg > 2:848495‑M2/1‑52 (MQ=255) caactgtcaCCAAATTTAATAAAGAGAATTTTTTCAACGGGGGATGTTCCCCacaagcgctaacttaagcgttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctgg > 2:295530‑M2/5‑52 (MQ=255) caTGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatatt > 1:1536369‑M2/1‑50 (MQ=255) aTGTCACCAAAGTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggccc > 2:1533344‑M2/1‑49 (MQ=255) ttcttcagatggtccaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCTATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGCCAGGa < 1:335867‑M2/113‑1 (MQ=255) aCCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatatt < 2:1735551‑M2/143‑100 (MQ=255) ccAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacgtaaggggtgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagc < 1:1314227‑M2/149‑107 (MQ=255) gatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCCCGGTTAGCAAACAAGCCCACAGTCCCCCCGCCAGGaa > 2:448676‑M2/30‑143 (MQ=255) gatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGCCAGGaa > 2:343671‑M2/30‑143 (MQ=255) tggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGCCAGGAATc > 2:274283‑M2/28‑143 (MQ=255) ttgAATGAAGAGAATTTTTTTACCGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaa > 1:887720‑M2/1‑38 (MQ=255) ggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGCCAGGAATCg > 2:602043‑M2/27‑143 (MQ=255) tAATGAAGAGAATTTTGTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcc > 2:1627326‑M2/1‑36 (MQ=255) aacccttcagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGCCACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAATCAAGCCAACAGTCACCACGCCAGGACTCGCAttt > 2:1451497‑M2/22‑143 (MQ=255) agagAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactgga < 1:521316‑M2/149‑120 (MQ=255) taagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGCCAGGAATCGCATTTATGGCg > 2:1349285‑M2/16‑143 (MQ=255) tttttttAACGGGGGAGGTTACCCataataaatgggttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggaccatattggtaagcccgaagaactgag < 2:1706096‑M2/143‑120 (MQ=255) ttagcgcttatGGGAGGCTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGCCAGGAATCGCATTTATGGCGtttt < 2:507302‑M2/132‑1 (MQ=255) aCGGGGGAGGTTCCTCataagcgctgacttaagggttgtggtattacgccggatatgattgaacgggccgaggaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcgg > 2:1033132‑M2/1‑16 (MQ=255) aCGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgctatgatttaacgtgccgatgggttactctcacgataactggtcagcaattctggcccagattggtaagcccgaagcactggatacctccg < 2:1491365‑M2/143‑128 (MQ=255) taggggAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGCCAGGAATCGCATTTATGGCGTTTTCCATCGCTATCggg < 1:865324/147‑1 (MQ=255) gggggAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggcacgtaat < 1:1423364‑M2/149‑136 (MQ=255) gggggAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggca > 2:548487‑M2/1‑14 (MQ=255) tGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGCCAGGAATCGCATTTATGGCGTTTTCCATCGCTATCGGGTc < 1:1618326‑M2/148‑1 (MQ=255) gggAGGTTCCCACGTAAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGAAAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGACCGCGACACGATTGGCAAACAAGCCAAACGTCACCACCCCATGAATCGCATATATGGCGTTTTCCATCGCTATc > 2:623581/1‑143 (MQ=255) | TTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGCCAGGAATCGCATTTATGGCGTTTTCCATCGCTATCGGGTCA > CP009273/3051859‑3052154 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |