| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 1973060 = | 2 (0.030) | 58 (0.850) | 46/294 | 0.5 | 96.7% | intergenic (‑606/‑174) | flhD/uspC | flagellar class II regulon transcriptional activator, with FlhC/universal stress protein |
| ? | CP009273 | = 3577555 | NA (NA) | intergenic (+15/‑1) | insB1/yrhA | IS1 transposase B/pseudogene, interrupted by IS1E | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCAC > CP009273/1972913‑1973205 | tttCATTCTATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACt < 2:1083535/149‑1 (MQ=255)tttCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACt < 2:637030/149‑1 (MQ=255) gcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCtt > 2:877813‑M1/140‑149 (MQ=255) gcataacctgaatctgagacagcacctggcacgggtgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacacagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaatcagttggagacattaccCTattta > 1:1052309‑M1/140‑145 (MQ=255) aaTACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTg > 2:738297‑M1/1‑148 (MQ=255) taacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCtt < 1:493294‑M1/10‑1 (MQ=255) taacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtaattaccCTATTTTCtt < 1:151484‑M1/10‑1 (MQ=255) ctgaatctgaggcagcacctggcacggctggggcggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagcggcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTa < 2:466035‑M1/17‑1 (MQ=255) ctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATaa < 1:593526‑M1/14‑1 (MQ=255) tAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctg < 2:567226‑M1/149‑11 (MQ=255) aggctATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTACATACAAAGAAAGACAACAATCACCTTAAAGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGCGAATCAGTACACTATTTTCTggtgacgc > 1:14227‑M1/3‑138 (MQ=255) aaGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgc > 1:463922‑M1/1‑138 (MQ=255) aGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgcc < 2:625914‑M1/149‑13 (MQ=255) aGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTAAATATATTACCCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTCCACTATTTTCTggtgatgct > 1:90082‑M1/1‑137 (MQ=255) cagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATta < 2:146238‑M1/29‑1 (MQ=255) tAACCAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaactta < 1:949710‑M1/146‑19 (MQ=255) agcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcctcgggcattatttgaacataaaacactatcaataagttggaggcattgccCTATTTTCTTTTAATTACATTTGAAAt < 1:1040858‑M1/27‑1 (MQ=255) gcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTCCATTTGAAATtata < 2:862241‑M1/31‑1 (MQ=255) gcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctacatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATtata < 2:609686‑M1/31‑1 (MQ=255) acacTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgattt < 1:758162‑M1/146‑26 (MQ=255) tgacggctgggacggaagtcgctggcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGAt > 1:451841‑M1/112‑146 (MQ=255) ccGCACAACAAGCTGATGAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat < 1:816598‑M1/146‑33 (MQ=255) cGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatg > 2:565743‑M1/1‑113 (MQ=255) gCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 1:139310‑M1/146‑35 (MQ=255) gCACAACAAACTAATTAAATACAAAAAAGGGCAACAATCAACTTAATATTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatgg > 2:644256‑M1/1‑112 (MQ=255) gacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGt < 1:244663‑M1/45‑1 (MQ=255) gacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcagtaccCTATTTTCTTATAATGACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGt < 1:572199‑M1/45‑1 (MQ=255) aacaaACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggt > 1:911908‑M1/1‑108 (MQ=255) aacaaACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgatgccaacttactgatttagtgtatgatggt > 1:57175‑M1/1‑108 (MQ=255) gaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGtgatt < 1:721173‑M1/49‑1 (MQ=255) aagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACTGGGAGTgattgatt < 2:21180‑M1/53‑1 (MQ=255) aaaCTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttttt > 2:1033196‑M1/1‑105 (MQ=255) cTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgag < 2:1087213‑M1/149‑48 (MQ=255) cTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGAACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgag < 2:764257‑M1/149‑48 (MQ=255) aTTAAGTACTAAGAATGGCAACAATTAACTTAATGTTAATGAAAGGTTTTACATATATTAACCACTTGGTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgag < 1:35118‑M1/146‑48 (MQ=255) aTTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtg > 2:15053‑M1/1‑99 (MQ=255) tcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCtt > 2:329437‑M1/88‑149 (MQ=255) aaaTACAAAGAAAGACAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATCTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgcttttgaggtgctc < 2:810218‑M1/149‑54 (MQ=255) ttctcaaaatcggtggagctgcatgtcaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATAACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTAc > 2:698562‑M1/85‑149 (MQ=255) aCAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagt < 2:320856‑M1/149‑58 (MQ=255) aaagaaagGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACCTATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtgg < 2:954049‑M1/149‑60 (MQ=255) agaaagGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggct > 2:1046328‑M1/1‑88 (MQ=255) aaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACta < 1:146062‑M1/67‑1 (MQ=255) gaaagGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtgg < 1:594529‑M1/146‑60 (MQ=255) aaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACtaa > 1:919427‑M1/79‑146 (MQ=255) aaagGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACCCGGGTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttc < 2:1122068‑M1/149‑64 (MQ=255) gtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAgag < 2:226930‑M1/77‑2 (MQ=255) caacaaTCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgttt > 2:283351‑M1/1‑81 (MQ=255) aacaaTCAACTTAATGGTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttc < 2:914521‑M1/149‑70 (MQ=255) gagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGAc < 1:538034‑M1/77‑1 (MQ=255) cgatcAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaactttctgatttagtgtatgatggtgtgtttgaggtgctccagtggcttctgttt < 1:446039‑M1/144‑69 (MQ=255) ttcAACTTAATGGTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTtgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttct < 1:91088‑M1/145‑71 (MQ=255) aTCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttct < 1:868878‑M1/146‑71 (MQ=255) ctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAatat < 2:886993‑M1/83‑1 (MQ=255) gcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaaccctatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAACTTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTaatt < 1:359426‑M1/82‑2 (MQ=255) aCTTGATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACGTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagct < 2:180182‑M1/149‑78 (MQ=255) cTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcag < 1:239117‑M1/146‑76 (MQ=255) caaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGt > 2:718433‑M1/59‑149 (MQ=255) caaagtcagcgggcatgatctgaacataaaacactagcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTCATAATCAGACTAATATTTACCTGt > 2:578804‑M1/59‑149 (MQ=255) aagtcatcgggcatgatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGttt > 2:166449‑M1/57‑149 (MQ=255) ttaatgAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccc > 1:875311‑M1/1‑64 (MQ=255) gtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggatgcattaccCTATTTTCTTATAATTACTGTTGTAGTTATATGATGACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGtt > 1:681446‑M1/55‑146 (MQ=255) gtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGa < 2:340667‑M1/95‑1 (MQ=255) aatgAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctg < 2:205363‑M1/149‑88 (MQ=255) aatgAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctc < 1:830935‑M1/146‑85 (MQ=255) aatgAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggctactgtttctatcagctgtccctcctg < 2:576479‑M1/149‑88 (MQ=255) aatgAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagcgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctc < 1:669204‑M1/146‑85 (MQ=255) atcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGa < 1:297656‑M1/95‑1 (MQ=255) cgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggggtcagtacgCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAAtgagactaatatttatcgtttttacaggg < 2:115997‑M1/100‑15 (MQ=255) aaaTGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagatgcaccagtggcttctgttactatgagctgtccctcctgt > 1:530672‑M1/1‑58 (MQ=255) gggtcttatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAACATTTACCTGTTTGACCGAGt > 2:931967‑M1/49‑149 (MQ=255) aTGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttc < 1:790526‑M1/146‑91 (MQ=255) aTGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcctctgtttatatcagctgtccttcctgttc > 1:580868‑M1/1‑56 (MQ=255) cattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTATTTGACCGagg < 1:49288‑M1/101‑2 (MQ=255) tggacataaaacactatctataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAGTTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGcg > 2:812150‑M1/39‑149 (MQ=255) tatatTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggg < 2:390313‑M1/149‑104 (MQ=255) atatTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacg < 1:104387‑M1/146‑102 (MQ=255) aacacaaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAACTACAGTTGAAATTATATGATCACCGGTAGTGATTGATTAATTATCGTTACGAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGc > 1:311425‑M1/37‑146 (MQ=255) ataaaacactatcagtaagttggagtcattaccCTACTTTCTCATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCCTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTTGGATTGCGTCGtt > 2:809980‑M1/34‑149 (MQ=255) ataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGtt < 2:104282‑M1/116‑1 (MQ=255) agaaaacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGcgtc > 1:108513‑M1/34‑146 (MQ=255) tAACCACGTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggt > 1:710202‑M1/1‑41 (MQ=255) aaaacacgatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGcgtcgt > 1:871529‑M1/32‑146 (MQ=255) aacactatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGttt < 1:544099‑M1/117‑1 (MQ=255) tatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTa > 2:508232‑M1/25‑149 (MQ=255) tatcaataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTa > 2:898329‑M1/25‑149 (MQ=255) ttAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggca > 2:427921‑M1/1‑30 (MQ=255) tAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcggaccggcaa > 2:241995‑M1/1‑29 (MQ=255) tAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTagtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacgg < 1:580374‑M1/146‑118 (MQ=255) aataagttggagtcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAg < 2:581347‑M1/129‑1 (MQ=255) aaTGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTggcgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctttcagctgtccctcctgttctgctactgacggggtggtgcgtaccggc > 1:498168‑M1/1‑28 (MQ=255) ggAGAATCAGTACTCTATTTTCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaag < 1:949559‑M1/146‑124 (MQ=255) tcattaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGTTTGCGTCGTTTTTCCATTAGGGGTAAACCttt < 1:241518‑M1/138‑1 (MQ=255) attaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCCCCCGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGGTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGt > 2:793565‑M1/7‑149 (MQ=255) attaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGt < 2:965763‑M1/143‑1 (MQ=255) ttaccCTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAAt < 1:497723‑M1/141‑1 (MQ=255) ttaccCTAGTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAAt > 1:132647‑M1/6‑146 (MQ=255) tACACTATTGTCTggtgaggctgccaacttacttatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccgga < 1:139298‑M1/146‑134 (MQ=255) cTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCAc > 1:764360/1‑146 (MQ=255) cTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCAc > 1:441888/1‑146 (MQ=255) | TTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCAC > CP009273/1972913‑1973205 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |