New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 78327 | 66 (0.910) | 6 (0.090) | 5/286 | 10.3 | 8.3% | coding (119/1092 nt) | leuB | 3‑isopropylmalate dehydrogenase, NAD(+)‑dependent |
? | CP009273 | = 78363 | 69 (0.980) | coding (83/1092 nt) | leuB | 3‑isopropylmalate dehydrogenase, NAD(+)‑dependent | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TGGTCTGGTGGTAAATGTTCCCACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCTTGTTGTTTTCGTTGT > CP009273/78183‑78473 | tggtctggtGGTAAATGTTCCCACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCCACATCGTAATGCCTggtggt > 2:839238/1‑149 (MQ=255) gtgtggtggTAAATGTTCCCACTTCGAGCCCCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGa < 1:703215/146‑1 (MQ=255) tctggtGGTAAATGTTCCCACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGAt > 2:593874/1‑149 (MQ=255) gtggtAAATGTTCCCACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATgcgc > 1:745770/1‑149 (MQ=255) tggtAAATGTTCCCACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGACTAGCACCTAAGGGCCGGTGGCGagtcccg > 2:1137967/1‑143 (MQ=255) gtAAATGTTCCCACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCGTACATGGTACTGGCTGGTGGTTATGGGGATc > 1:90589/1‑149 (MQ=255) gtAAATGTTCCCACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATc > 2:838688/1‑149 (MQ=255) tAAATGTTCCCACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCg < 1:554361/149‑1 (MQ=255) aaTGTTCCCACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGTCCGGGGTTATCATTGGCTGCGCCGCCTACATCCGAATGCCTGGAGGTGATGCGCATCGcc > 2:1047936/1‑148 (MQ=255) cccTTCGGGCCGCCCACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGtt < 2:880530/147‑1 (MQ=255) cACTTCGGGCCGCCTACCGGGCCAAGCAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCACCCGTCGCAAGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCCACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGtt < 1:671496/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTTCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGGGGTTGCCCGTGGGTATCAATGGCCGCGCCGCCTACATCCTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACg < 1:229442/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCGTCAACCGTCGCAGGCGGGAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACg < 2:208953/149‑1 (MQ=255) cccaCCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTCGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATc < 1:233340/146‑1 (MQ=255) ccTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCCACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATc < 1:781613/149‑1 (MQ=255) ccTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATc < 1:343610/149‑1 (MQ=255) cgcgggCCAAACAGCGGGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAg < 2:643683/144‑1 (MQ=255) aCCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTTATGGGCCTCGCACAGCGGTTGCGCACAGCATCAAg > 2:609772/1‑149 (MQ=255) cGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCGGTGGTTATCTATGGCTGCGCCGCCTACAGCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCa < 2:444715/149‑1 (MQ=255) cGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCCTCCAGCa > 1:128940/1‑149 (MQ=255) cGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCa < 1:457459/149‑1 (MQ=255) aaaCAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCa > 1:982515/1‑149 (MQ=255) cACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCt < 2:23510/149‑1 (MQ=255) cACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCt > 1:93195/1‑149 (MQ=255) cGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTgg < 2:330763/149‑1 (MQ=255) ggCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGGGATGCGCATTGCAAAGCGTTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTggg < 2:1120718/149‑1 (MQ=255) cGGCTTGCTCACCACCTTCTGCCGGCGCCGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACGTTCAGCGCCTGGGtcatc < 2:157326/149‑1 (MQ=255) gCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTGATCAc > 1:353191/1‑149 (MQ=255) ttGCTCACAACCTTCAGCCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTTCATCGTTGTGTCTGGGTGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACtt < 2:677546/149‑1 (MQ=255) ttGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAACCGGTTGCGCCCGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACtt > 2:590533/1‑149 (MQ=255) ttGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGACGCGCATCGCAAAGCGGTTGCCCACGGCATCCAGCACTCTCAGCGCCTGGCTCATCACtc > 1:419563/1‑148 (MQ=255) cgcacaACCTTCAACCGTTGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCg < 1:929622/147‑1 (MQ=255) tCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCgg > 1:1084846/1‑149 (MQ=255) tCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCgg < 1:1067925/149‑1 (MQ=255) acaACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGAc > 2:26204/1‑149 (MQ=255) acaACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGAc > 2:848574/1‑149 (MQ=255) ccaCCTTCCACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGAcc < 2:480795/147‑1 (MQ=255) cTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCGTGGGTCATCACTTCCGGACCAATa > 2:525820/1‑149 (MQ=255) ttCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGGTGCGCGCGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATAc > 1:1176844/1‑149 (MQ=255) tCAACCGACGCAGGCGGCAGTGGCTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCAGCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATAcc < 1:65606/149‑1 (MQ=255) gcaaccagaacgcggcAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCCTCACTTCCGGACCAATACCGt > 2:514427/12‑149 (MQ=255) cGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTccc > 2:986435/1‑149 (MQ=255) cAGGCTGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACACCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCcggc < 2:1028831/149‑1 (MQ=255) cAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCTTCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCcggc > 2:392736/1‑149 (MQ=255) cAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCcggc > 1:506152/1‑149 (MQ=255) cAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGACTGGTGGGGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACTAATACCGTCCCCcggcaatacgg > 2:702403/1‑149 (MQ=255) ggTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAAAACCGTCCCCcggcaatacggcaat < 1:917479/149‑1 (MQ=255) ttGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCcggcaatacggccatcg > 2:138882/1‑147 (MQ=255) tGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAAtt < 2:1100966/149‑1 (MQ=255) ttATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAGTACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAAttctt > 1:1081603/1‑149 (MQ=255) aTCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCg < 1:660840/149‑1 (MQ=255) cAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGAc > 1:440209/1‑149 (MQ=255) aTGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACAt > 1:768104/1‑149 (MQ=255) ggCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGACGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATca < 1:874426/149‑1 (MQ=255) gCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAGTACGGCAATATGGGAATACTTCGACATccc > 2:701716/1‑147 (MQ=255) cTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATcaag > 2:282895/1‑147 (MQ=255) gcgcCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACg > 2:1012750/1‑149 (MQ=255) gccTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTc > 1:942450/1‑149 (MQ=255) cTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCt < 1:794472/149‑1 (MQ=255) cATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCttgt < 1:1022604/149‑1 (MQ=255) gTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGTGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCTTgttgtt > 2:823045/1‑149 (MQ=255) aaTGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCTTGTTGtttt < 1:1231740/149‑1 (MQ=255) ggCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCTGGTTGTTTTCGt > 2:969341/1‑149 (MQ=255) gCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCGCACGGTTTCCTTGTTGTTTTCGtt < 1:626896/149‑1 (MQ=255) gCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGGTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTACTTCTTCGACATCACACGGTCTCCTTGTTGGTTTCGtt > 2:861459/1‑149 (MQ=255) tggtggTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCTTGTTGTTTTCTTtgt > 1:310535/1‑149 (MQ=255) | TGGTCTGGTGGTAAATGTTCCCACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCTTGTTGTTTTCGTTGT > CP009273/78183‑78473 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |