| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | CP009273 | 3,676,860 | (GGTACCTGCGG)1→2 | intergenic (‑53/+130) | dctA ← / ← yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3676847 | 1 (0.020) | 98 (1.730) +GGGGTACCTGC |
76/244 | 0.0 | 99.0% | intergenic (‑40/+143) | dctA/yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| ? | CP009273 | 3676848 = | 1 (0.020) | intergenic (‑41/+142) | dctA/yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase | |||||
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ATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACT > CP009273/3676707‑3676994 | tatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcggg > 1:358307‑M2/142‑144 (MQ=255) atttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcggggtacct < 2:720325‑M2/9‑1 (MQ=255) tcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcggggtacctgcg < 2:800316‑M2/12‑1 (MQ=255) gCCTATTTCAGGCTAGAAATAACCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGGCAGGACCTGAAAGTGAAGGCTTATAAACAGAGAGGTTTGCATAGGGGGTCCTTTAGTCAAACCACATGTCTTGTTCGGTTAAGGGCTACCTGc > 1:650148/1‑144 (MQ=255) atagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCtt < 2:445853‑M2/17‑1 (MQ=255) atagaaatggacaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaaggaaaggcttttaaacagagaggggttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCtt < 2:93262‑M2/17‑1 (MQ=255) gaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGcc < 1:489448‑M2/15‑1 (MQ=255) atggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcGGGGTCCCTGCGGCCTTAAAGTa > 2:827239‑M2/127‑149 (MQ=255) tggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacaaagaggttttcatagggtgtcatttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttgtggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTaa > 1:461018‑M2/126‑144 (MQ=255) gccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAaca > 2:579519‑M2/124‑149 (MQ=255) gccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagacgttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTaaaa > 1:387700‑M2/124‑144 (MQ=255) ggagaatacccatggctaacgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAaca < 1:201702‑M2/26‑1 (MQ=255) aataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCa < 1:149338‑M2/30‑1 (MQ=255) aataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatatcttgaaaagttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACAACCa > 1:257866‑M2/115‑144 (MQ=255) 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caatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATca > 2:552302‑M2/110‑149 (MQ=255) aatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATcac > 2:492410‑M2/109‑149 (MQ=255) atggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATcaca < 2:9400‑M2/42‑1 (MQ=255) ctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATaac > 1:652598‑M2/104‑144 (MQ=255) ctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGaaa < 2:216209‑M2/46‑1 (MQ=255) tatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagagtttttcatagggtgtcctttagtaaaacctcatgtcttgtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAAt < 2:25443‑M2/47‑1 (MQ=255) tatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATACCACCCAGACAACATcaca > 1:794657‑M2/103‑144 (MQ=255) tatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATcaca > 1:794830‑M2/103‑144 (MQ=255) tatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAAt > 2:188647‑M2/103‑149 (MQ=255) atcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgccctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATg < 2:614972‑M2/48‑1 (MQ=255) acctcacgcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAg > 1:352744‑M2/102‑144 (MQ=255) gctgtcaggacctaaaggaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAAt < 1:148805‑M2/47‑1 (MQ=255) tcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagggaggttttcatagggtgtccattagtaaaaacacctgtctagtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTCAAAACAACACCCAATCAACAGCACAGCAATGTAACTgg > 2:808099‑M2/95‑149 (MQ=255) tcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACCTCACAGAAATGTa > 1:885904‑M2/95‑144 (MQ=255) tcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacatgtcttgtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTa < 1:639763‑M2/50‑1 (MQ=255) 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tcttgtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGtttt < 2:863109‑M2/124‑1 (MQ=255) cttgtaaggttagggggtacctgcGGGGTACCGGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGTTGTCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTg < 2:512683‑M2/125‑1 (MQ=255) tgtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGtt > 1:45187‑M2/23‑144 (MQ=255) gtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTaa < 2:473678‑M2/128‑1 (MQ=255) gtaaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGCTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGGACTTTTTAAAGttt > 1:30226‑M2/22‑144 (MQ=255) taaggttatgggggacccgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATAAAAATAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGtttt < 1:172569‑M2/124‑1 (MQ=255) aaggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTCTTGTAATc < 2:761582‑M2/130‑1 (MQ=255) aggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGCCAACATCACAGTAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCa > 2:976172‑M2/19‑149 (MQ=255) aggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGt > 1:910392‑M2/19‑144 (MQ=255) aggttatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCa < 2:930492‑M2/131‑1 (MQ=255) aggttatggggtacctgcGGGCTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTCTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCa < 2:723380‑M2/131‑1 (MQ=255) gttatggggtacctgcGTTGTACCTGCGTCCTTAAAATAACACCTAGGCAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTAGAGCTGGCTCATACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTaa > 1:430368‑M2/17‑144 (MQ=255) tatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAATTTTTGTAATCAGttt > 2:419591‑M2/15‑149 (MQ=255) tatggggtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCAAAAAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATc > 1:822388‑M2/15‑144 (MQ=255) gtacctgcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAgttta > 1:326153‑M2/9‑143 (MQ=255) gcGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACt > 2:483802‑M2/3‑149 (MQ=255) | ATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACT > CP009273/3676707‑3676994 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |