| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,608,704 | C→T | 7.6% | A35V (GCG→GTG) | nikB → | nickel transporter subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,608,704 | 0 | C | T | 7.6% | 201.6 / 2.9 | 75 | A35V (GCG→GTG) | nikB | nickel transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/30); new base T (3/3); total (42/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCCACCGAAATTCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCACCTGGTTGTGGAAGGCGCTGCATCTTGACTTTGGTATCTC > CP009273/3608557‑3608848 | gCCACCGAAATTCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGgcg > 2:534379/1‑149 (MQ=255) ttCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGACACCTTAATGTTGCGGTACGGATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGCCCCGGCGCTCGattatt > 1:52609/1‑149 (MQ=255) tCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTAttt < 1:1234457/149‑1 (MQ=255) ttCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCgt < 2:424758/149‑1 (MQ=255) aaCAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTTGGCCACGAGACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCgtctgt > 1:648919/1‑149 (MQ=255) aaCAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCgtctgt < 2:452264/149‑1 (MQ=255) aaCAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTATCTGCTGCGGGGCCTCGGTACCGGCGGACCGGCGCTCGATTATTTGCgtctgt > 1:473941/1‑149 (MQ=255) aCAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCCCGATGATTTGCgtctgtc > 1:96711/1‑149 (MQ=255) caTTAAACCGGTGAAACCTTAACTTTGCGTTACGTATTCCCCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGCTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTTATGCTGCGCCCCGCTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTaa < 2:628877/148‑1 (MQ=255) tAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGGTCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGTGCTCGGTTATTTGCGTCTGTCTAACCt > 2:312292/1‑149 (MQ=255) tAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGTGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCt > 2:312452/1‑149 (MQ=255) tAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGTGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCt > 2:362520/1‑149 (MQ=255) aaaCCGGTGAAATCTTAGTCTTGCGTTACGAATTACGCCGATTTCCGCCGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTg < 1:342031/149‑1 (MQ=255) aCCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTgcc > 2:166480/1‑149 (MQ=255) aCCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTAACGGCGACACGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGGCTAACCTgcc > 2:189487/1‑149 (MQ=255) ccGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCTCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTgccg < 1:977472/149‑1 (MQ=255) cGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTgccgc > 1:938147/1‑149 (MQ=255) ggTGAAACCTTAATGTTGCGTCACGTATTACGCCGCTTTCGGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTgccgcc < 1:93253/149‑1 (MQ=255) tGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTAGTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGTTTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGa < 1:752051/149‑1 (MQ=255) aCCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGcc > 2:253483/1‑149 (MQ=255) cTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGGTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCgg > 2:1133542/1‑149 (MQ=255) cTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCgg > 2:6859/1‑149 (MQ=255) gTTGAGTTACGTATTACACCGCTTTCTGCTGCTGATCACGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTATGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGACGCGCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGgaggttc > 2:395488/1‑145 (MQ=255) ttGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTAGGTTGCGTCGTCCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCt > 1:903286/1‑149 (MQ=255) gCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTGTCGGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTgg < 1:597459/149‑1 (MQ=255) gTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGcc < 1:614829/149‑1 (MQ=255) ttACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCct > 1:148932/1‑149 (MQ=255) ttACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCCCCGACGCCGGAGATGCTGGccc > 2:183246/1‑148 (MQ=255) ttACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCg > 1:1237212/1‑149 (MQ=255) gccgcTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCAcc > 2:494258/1‑149 (MQ=255) gccgcTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCAcc > 2:46664/1‑149 (MQ=255) gcagcTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGACGCCCCGGTGATCATTTTTCTATTGCTGCGCATAGGTACCGGAGACTCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACGTGCCGCCGACGCCGGAGCTGCTGGCCTCATCCCCCAcc > 2:196553/4‑149 (MQ=255) ctgctgATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACt < 1:1086748/149‑1 (MQ=255) gctgATCCCTATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCAGCTGCTGCGCCTCGGTACCGGCGCCCCGGCGCCCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTgg < 2:874418/149‑1 (MQ=255) gctgATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGCTGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCCCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGCCGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCCCCATGCTGGGGCTgg > 2:454599/1‑149 (MQ=255) gctgATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTgg > 2:724861/1‑149 (MQ=255) ctgATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGa < 2:52247/149‑1 (MQ=255) tgATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGCTGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGCAt > 1:935414/1‑149 (MQ=255) tgATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGAt > 2:948946/1‑149 (MQ=255) tcatcccgctgcgccTCGCCGCCTCGCTCATCATTTTTCCGATCCTGCGCCTCGGTACCGGCCACCCGGCCCTCCATTATTTGCGTCCCTCTAACCTGCCCCCGACCCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGAt < 2:617284/135‑1 (MQ=255) aTCCCGTTGGTGCTCGCCGCCTCGTTGTTCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGCCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCa < 1:381370/149‑1 (MQ=255) aTCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCAGCCGCCGGAGAAGCGGGACTCTACCTGCACCATGCTGGGACTGAATcg > 1:841036/1‑148 (MQ=255) tCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGCTGCGCGCCTCTCCCCGCCCCATGCCGGGACTGGCTCAg > 2:62215/1‑149 (MQ=255) ccGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTCTTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCCGGAGCTGGCTCAccc > 2:254480/1‑149 (MQ=255) gATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGc > 1:359430/1‑149 (MQ=255) gTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGTGCTCGATTCTTTGCGTCTCTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTa < 1:312292/149‑1 (MQ=255) gTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGTGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTa < 1:312452/149‑1 (MQ=255) gTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGTGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTa < 1:362520/149‑1 (MQ=255) tCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTc > 1:1062778/1‑149 (MQ=255) gccgccTTGGTGATCATTTTTCTGATTCTGCGCCTCTGGACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCa < 1:395488/149‑1 (MQ=255) gccgccGCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGTACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCa < 1:923906/149‑1 (MQ=255) gccTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTa < 2:712179/149‑1 (MQ=255) tCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACgg < 2:148932/149‑1 (MQ=255) ggTGATCATTTTGCTGATGCGGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTACCCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCa < 1:981587/149‑1 (MQ=255) atctgtttcCTGATGCTGCGCCTCGGTCCCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCCGGCCTCTACCCGCCCCATGCTGGGCCTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCACCTg < 1:458590/144‑1 (MQ=255) aTCATTTTTCTGTTGCTGCGCCTCGGTACCGGCGCCCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCCGTACGGCACCtt < 2:632317/149‑2 (MQ=255) aTCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCCCCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCCGTACGCCCAGTACGGCAcccg > 2:467384/1‑147 (MQ=255) cATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCACCTGGt > 1:989887/1‑149 (MQ=255) tttttCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGCTTACTTGCGCCTGTCTGACTTGGCGGCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCACCTGGTtg < 1:596150/149‑1 (MQ=255) tttttCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTCCGGCCCCTGGTtg > 1:85460/1‑149 (MQ=255) tttttCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCACCTGGTtg > 1:481402/1‑149 (MQ=255) tttttCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCACCTGGGtg > 1:27030/1‑149 (MQ=255) tttttCTGATGCGGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCACCTGGTtg < 1:263797/149‑1 (MQ=255) tttCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGAAGACGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCACCTGGTtgtg > 1:1093932/1‑149 (MQ=255) ttCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCACCTGGTTGTgg > 1:1028846/1‑149 (MQ=255) tCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGCCTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCCCCTGGTTGTGGa > 2:1182920/1‑149 (MQ=255) ctggctgcGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTCGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCACCTGGTTGTGGAAgg < 2:712595/146‑1 (MQ=255) ctgcGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCCCCTGGTTGTGGAAGGCGCt < 2:606628/149‑1 (MQ=255) cccgTACCGGCGACCTGGCGCTAGATTATTTGCTGCTGGCTACCCTGCCGCCTCCGCCGGAGACACTGGCCCCTAACCGCACCATGCCGGGACTGGTTCGGCCGCTGCACGTCCTGTACGGCACCTGGCTGTGGAAGGCGCTGCATCtt < 2:590954/146‑1 (MQ=255) cGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCATTACGGCACCTGGTTGTGGAAGGCGCTGCATCTTGACTTTg > 1:231231/1‑149 (MQ=255) cGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCACCTGGTTGTGGAAGGCGCTGCATCTTGACTTTg < 1:1039282/149‑1 (MQ=255) cGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCACCTGGTTGTGGAAGGCGCTGCATCTTGACGTTg > 2:57435/1‑149 (MQ=255) ggCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCACCTGGTTGTGGAAGGCGCTGCATCTTGACTTTgg > 1:213510/1‑149 (MQ=255) ggCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCACCTGGTTGTGGAAGGCCCTGCATCTTGACTTTgg > 2:623178/1‑149 (MQ=255) ccGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCACCTGGTTGTGGAAGGCGCTGCATCTTGACTTTGGTAtctc < 1:253483/149‑1 (MQ=255) ccGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCACCTGGTTGTGGAAGGCGCTGCATCTTGACTTTGGTAtctc < 2:956599/149‑1 (MQ=255) | GCCACCGAAATTCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCACCTGGTTGTGGAAGGCGCTGCATCTTGACTTTGGTATCTC > CP009273/3608557‑3608848 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |