| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | CP009273 | 2,160,620 | IS5 (+) +4 bp | intergenic (+110/+160) | yegQ → / ← ogrK | putative peptidase/positive regulator of P2 growth (insertion of P2 ogr gene into the chromosome) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2095230 = | NA (NA) | 111 (1.100) | 77/296 | 0.2 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | CP009273 | 2160620 = | 0 (0.000) | intergenic (+110/+163) | yegQ/ogrK | putative peptidase/positive regulator of P2 growth (insertion of P2 ogr gene into the chromosome) | |||||
| * | ? | CP009273 | = 2096424 | NA (NA) | 94 (0.930) | 70/296 | 0.4 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | CP009273 | = 2160623 | 0 (0.000) | intergenic (+113/+160) | yegQ/ogrK | putative peptidase/positive regulator of P2 growth (insertion of P2 ogr gene into the chromosome) | |||||
GGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2096279‑2096424‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAAAATAATCGAAATTAATCACTTACCGTGGGGATTACGCGTGGTTTCCC < CP009273/2160623‑2160479 GGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGCAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATCGCTCCAGATCACGAACATGATCCCATATCCGGGACTTGTCTGAACCTTCCCTA > 1:1438934/1‑149GGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTA > 2:890922/1‑149 CAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCA < 1:812470/149‑1 AGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTTTTCGCACCTTCACTAGgtga > 1:1649755/1‑145 GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTTAGTTTATGCGTTTGTGCGCATCTTACCCAGCATTT > 2:220386/1‑149 GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTT > 2:1021699/1‑149 GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATATCAAATCAGGGACTTGTTCGCAACTTACCTAGCATTT > 1:972652/1‑149 AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTT < 2:473608/149‑1 AATCTCTTTTCGGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTAT < 2:848881/149‑1 ATCTCTTCTCTGCTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTGCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATG < 2:1297528/149‑1 TCTCTTTTCTGGTCTGTCGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGG < 2:362681/149‑1 TCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGG < 2:1547375/149‑1 TCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGG < 1:50804/149‑1 CTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAGTTATCAAACGTCTAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAAACCTGTTATATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCCTTTTATGGG > 2:804884/1‑149 CTCTATTCTGGTCTGACAACCATTTCTTCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGGCTTGTTCGCACCTTCACTAGCATTTTATGGG > 1:1595722/1‑149 CTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTT > 2:1408795/1‑149 TTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGTTTATG > 2:268068/1‑149 GGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAGCATGAGCTCATATCAGGGACTTGTTCGCGCCTTCCGTTGCGTTTTTAGGGTTATGTTTT > 2:32350/1‑149 GTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTT > 2:582450/1‑149 TCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTC < 1:1003778/149‑1 TCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTC > 2:884486/1‑149 TGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTAAGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTTTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAG > 1:1139512/1‑149 CGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAAC > 2:1225755/1‑149 CGCTTACTGCTGAATTCACTGGCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAAC < 2:648712/149‑1 CTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAAACTCGTCCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTGCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGG < 2:382871/149‑1 TTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGA < 2:163644/149‑1 TGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGAT > 1:1002180/1‑149 CTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGCCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCCCCTTCCCTCGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGAGGGTAA > 2:608028/1‑149 CTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAGACGGATGATAA > 1:445190/1‑149 CTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTACTAAGGGTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAA > 2:876284/1‑149 AATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGACACGGCTGATAACCT > 1:548141/1‑149 AATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCT > 1:1474039/1‑149 AATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGAATTTTATGGGTTGTGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCT > 2:859880/1‑149 TCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAA < 2:985362/149‑1 TCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAA < 2:1285105/149‑1 ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAATATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATA > 2:1069027/1‑149 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGTCAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAAgcaa > 1:1071359/1‑145 TCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATG < 1:986207/149‑1 GGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCCCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACCGAAGATAACCTTAATAAATGCA > 1:102505/1‑149 GCGAAGGGAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAG < 2:1481577/149‑1 AGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGACTCCAGATGACAAACATGAACTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTACCTAGCATTTTATGGGTAATGTTTTTCAGCAAACCGGATGATAACCTGAAGAAAAGCAGCTtt > 1:535702/1‑147 GTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGCTGATACCCCTCATGAAAGCAGCTGcgt > 2:1143478/1‑146 GTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTAT > 1:1319184/1‑149 GTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTAT > 2:84005/1‑149 TTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAAT < 2:1507125/134‑1 TTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAAT > 1:1507125/1‑134 TGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATC < 1:268068/149‑1 TGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATgcgt > 1:315952/1‑145 GACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGACAACTTATCAGGGAATCGTACGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTT > 2:392216/1‑149 ACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGCCTTGTTCGCACCTTCCATAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGTTTACCTTAATACATGCAGCTGTTTGTGATCGGTgt > 1:368873/1‑147 TCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTCGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCT > 2:279719/1‑149 TCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCT > 2:1024196/1‑149 TCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCT < 2:1096940/149‑1 TCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATCACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGCGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCT < 2:1104524/149‑1 CATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGGTAACCTTAATAAATTGAGTTGTATTTTGTGGGTTTCTt > 1:1289688/1‑148 cggacGAACCCTATTCTATGTCTGCAGATGACAAACACGATCTCAGATCATGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTGATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAA < 1:461057/144‑1 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTCGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCGGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATCTGATCGGTTTCTAA > 1:732872/1‑149 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAA < 2:775507/149‑1 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATAACAAACAGGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCCCCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTAAGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAA > 2:1069790/1‑149 ATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAA > 1:389480/1‑149 tCCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAATCATTATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGTGTTATGTTGTTCAGCGAAACGGATAATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTT < 1:40159/148‑1 ACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTT < 1:582450/149‑1 ACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTT < 1:454543/149‑1 CTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGGTTCTAAGAATTTTCCATCCGG > 1:1530504/1‑149 GGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATCATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAA < 2:1097676/149‑1 TCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATGCGGGAAAGAT > 2:10439/1‑149 TCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAAAAT > 2:1130775/1‑149 CAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAAAATAA > 2:1299335/1‑149 GATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAAAATAATC < 2:1474039/149‑1 GATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTCTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAAAATAATg > 2:1009738/1‑148 GACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAAAATAATCGAA < 1:856290/149‑1 ACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCTATCAGGGAAGACTAAGCGAAA > 1:1345381/1‑149 ACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAAAATTTTCCATCCGGGAAAAATAATCGAAA > 1:579273/1‑149 AAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAGTTTTATTTCGCGGAAAAATAATCGAAATT > 1:1154664/1‑149 ACATGACCTCATTACAGGCACCTGTTCGCACCCTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACCGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAAAATAATCGAAATTAA < 2:544576/149‑1 CATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAAAATAATCGAAATTAATCACTTACC < 2:972652/149‑1 ATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAAAATAATCGAAATTAATCACTTACCG > 2:996897/1‑149 ATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGCGAAAAATAATCGAAATTAATCACTTACCG < 2:1002180/149‑1 TATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATGTTCCATCAGGGGAAAATAATCGAAATTAATCACTTACCGT > 2:1120559/1‑149 TCATGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGTTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAAAATAATCGAAATTAATCACTTACCGTGG < 1:1426477/149‑1 TCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAAAATAATCGAAATTAATCACTTACCGTGG > 2:48383/1‑149 AGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCAGCCGGGCAAAATCATCGAAGTTAATCACTTACCGTGGGG > 2:39861/1‑149 AGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGCTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAAAACAATCGCAATTAATCACTTACCGGGGGG < 1:805324/149‑1 GGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAAAATAATCGAAATTAATCACTTACCGTGGGGA > 1:1487911/1‑149 GACTTGTTCACACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAAAATAATCGAAATTAATCACTTACCGTGGGGATT > 2:937006/1‑149 ACTTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAAAATAATCGAAATTAATCACTTACCGTGGGGATTA > 2:238764/1‑149 TTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCATCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAAAATAATCGAAATTAATCACTTACCGTGGGGATTACG > 2:723843/1‑149 TTGTTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGACACGGATGATAAACTTAATAAATGCCGCGGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAGAATAGTCGCAATTCATCACTTACCGTCGGGAGTACa > 1:595918/1‑148 TTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAAAATAATCGAAATTAATCACTTACCGTGGGGATTACGCGT > 1:102094/1‑149 TTCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCGTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAAAATAATCGAAATTACTCACTTACCGTGGGGATTACTCGT > 2:55789/1‑149 TCGCACCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAAAATAATCGAAATTAATCACTTACCGTGGGGATTACGCGTG < 2:194312/149‑1 CCTTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCGGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAAAATAATCGAAATTAATCACTTACCGTGGGGATTACGCGTGGTTTC > 1:140443/1‑149 TTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAAAATAATCGAAATTAATCACTTACCGTGGGGATTACGCGTGGTTTCCC < 2:694491/149‑1 TTCCCTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAAAATAATCGAAATTAATCACTTACCGTGGGGATTACGCGTGGTTTCCC > 2:1530823/1‑149 GGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2096279‑2096424‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAGCATTTTATGGGTTATGTTTTTCAGCGAAACGGATGATAACCTTAATAAATGCAGCTGTATGTGATCGGTTTCTAAGAATTTTCCATCCGGGAAAAATAATCGAAATTAATCACTTACCGTGGGGATTACGCGTGGTTTCCC < CP009273/2160623‑2160479 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |