| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 389927 | 85 (0.840) | 9 (0.100) | 7/270 | 12.3 | 10.8% | intergenic (+53/‑35) | yaiT/yaiV | pseudogene, autotransporter family;putative structure; Not classified; interrupted by IS3; putative flagellin structural protein/putative transcriptional regulator |
| ? | CP009273 | = 389931 | 72 (0.780) | intergenic (+57/‑31) | yaiT/yaiV | pseudogene, autotransporter family;putative structure; Not classified; interrupted by IS3; putative flagellin structural protein/putative transcriptional regulator | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTCAGCGCCTATACCGATGCTAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAGTTATATTTTCCAGTGAT > CP009273/389785‑390075 | ttCAGCGCCTATACCGATGCTAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTACTCTAAATAATGCCCGTCAAGGAttt < 2:828422/149‑1 (MQ=255)ttCAGCGCCTATACCGATGCTAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGGttt > 2:568465/1‑149 (MQ=255)ttCAGCGCCTATACCGATGCTAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGAttt > 2:57224/1‑149 (MQ=255)tgcatcgcCTATACCGATGCTAACTACCTCGGTGGGTGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTTGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGAttt < 1:235807/144‑1 (MQ=255) tCAGCGCCTATACCGATGCTAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTg > 2:637155/1‑149 (MQ=255) accgcCTATGCCGATGCTAACTACCTCGGTGTGGGTGACGTAGATCAAGACTGGGCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGAc < 1:1610358/147‑1 (MQ=255) gcgcCTATACCGATGCTAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACg < 2:1013021/149‑1 (MQ=255) cgcCTATACCGATGCTAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACgg < 2:1331866/149‑1 (MQ=255) gcCTATACCGTTGCTAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACggg < 2:1547804/149‑1 (MQ=255) gcCTATACCGATGCTAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACggg < 2:1402982/149‑1 (MQ=255) gcCTATACCGATGCTAACGACCTCGGCGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACggg < 2:1532079/149‑1 (MQ=255) cTATACCGATGCTAACTGCCTCGGTGGTGGTGACGTAGAGCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCa < 1:1330066/149‑1 (MQ=255) ccGGTGTTAACTACCTCGGGGGTGGCGACGTAGATCAAGACTGGTCCCCGAACGTGGGTGTTAAATATAACTGGTAATATTCTTCTCGCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATCATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACt < 1:625854/149‑1 (MQ=255) cGATGCTAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTg < 2:1282054/149‑1 (MQ=255) aggCTAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCa < 1:1559894/147‑1 (MQ=255) aTGCTAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCa < 1:623180/149‑1 (MQ=255) gCTAACTACCTGGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAAGATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCaaa < 1:5901/149‑1 (MQ=255) gCTAACTACCTCGGTGGTTGTGACCTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAACAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCaaa < 2:887138/149‑1 (MQ=255) gCTAACTACCTCGGTGGTGGGGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCaaa < 2:949314/149‑1 (MQ=255) gCTAACTACCCCGGTGGTGGGGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCaaa < 2:495874/149‑1 (MQ=255) aaCTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGa < 1:1401578/149‑1 (MQ=255) aaCTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGa > 2:564217/1‑149 (MQ=255) cTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCa > 2:284762/1‑149 (MQ=255) ggtggtgggGAGGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACCTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGTCGGGCATTACTGCAAGGGACGCGCAAAt < 1:818186/149‑1 (MQ=255) tggtggtgACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTACAAAGGACGCGCAAATGt > 1:121133/1‑149 (MQ=255) ggtgACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATc > 2:524259/1‑149 (MQ=255) gctgACGTAGATCAAGCATGGTCCGCTAACGTGGCTGTTAAATATACCTGTTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATc < 2:1261129/147‑1 (MQ=255) gACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGt < 1:877524/149‑1 (MQ=255) actcaaaTCAACACTGGCCAGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAACATTCTTCACGCCGTAGAAATACTAGTAATTTTATCTAAATAATGCCCGTCAATGATTTGACGGTCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTa < 1:326978/143‑1 (MQ=255) aCGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTa < 2:1277774/149‑1 (MQ=255) gTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGt > 1:132088/1‑149 (MQ=255) gATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTGATCTGTAGTTaa > 2:819440/1‑149 (MQ=255) aTCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTaaa < 2:943879/149‑1 (MQ=255) cAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAAcc > 2:1053539/1‑149 (MQ=255) aCTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCtt > 2:670204/1‑149 (MQ=255) tGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCa < 2:316623/149‑1 (MQ=255) gTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAATCTCTTCAgg > 1:1614327/1‑149 (MQ=255) gcgAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAAtt > 1:1599336/1‑149 (MQ=255) gcgAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCAAAATAATGCCCGTCAAGGATCTGCCGGGCATTACTTAAAAGGACCCGGAAAAGTTGTCGGGAGCTAAACCACTTCAGGaact > 1:348450/1‑147 (MQ=255) cgacggTGGGTGTTAAAAATACTTTGTAATTTTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAAttt < 2:708197/144‑1 (MQ=255) gAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTg < 2:120075/149‑1 (MQ=255) gAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTg < 2:1420764/149‑1 (MQ=255) gAACGGGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTg < 1:378319/149‑1 (MQ=255) ccGTGGGTGTTAAATATACCTGCTACTATTCCTCACCCCGAAGAAATACTGGTAATTGAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGt < 1:1119258/148‑1 (MQ=255) tGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAg > 2:741512/1‑149 (MQ=255) ttAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTCGTTAAAACTCATCATGATTTTGGTAAGCTCggt > 2:447854/1‑147 (MQ=255) ttAAATAAACCTGGTAAGATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGTAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGAt < 2:568411/149‑1 (MQ=255) tAAATATACCTGGTAATATTCTTCACCCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTAATGCAACGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATa < 2:55203/149‑1 (MQ=255) aaaTATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATaa > 1:1223787/1‑149 (MQ=255) tataCCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTATGTTCGATAGATg > 2:295743/1‑149 (MQ=255) aCCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGGAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGttt < 1:57224/149‑1 (MQ=255) aCCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAACCCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGttt < 1:991841/149‑1 (MQ=255) ggTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTcc < 1:649224/149‑1 (MQ=255) tAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAg < 1:637155/149‑1 (MQ=255) aaTATTCTGCACTCCGAAGAAATACTGGCAATTTAATCTAAAACACGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGa < 2:93326/149‑1 (MQ=255) cttcACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGt > 2:557561/1‑149 (MQ=255) cttcACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATAAGGt > 1:1043987/1‑149 (MQ=255) cACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTaaa < 2:1400880/98‑1 (MQ=255) cACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTaaa > 1:1400880/1‑98 (MQ=255) tgcggataaatggtGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACgcgc > 1:237125/14‑149 (MQ=255) cGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCtt < 2:529976/149‑1 (MQ=255) gaagaaATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCATCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTc > 1:302489/1‑149 (MQ=255) agaaATACTGTTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGa < 2:545845/149‑1 (MQ=255) aaaTACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGt > 2:929803/1‑149 (MQ=255) ggTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTtaataa > 2:498657/1‑149 (MQ=255) 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aTTTAATCTAAGTATTGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATCACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTACTTAAACCCATTCAGTAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGaa < 1:507016/149‑1 (MQ=255) ttAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGaaaa < 2:1271776/149‑1 (MQ=255) aaTCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGc < 1:284762/149‑1 (MQ=255) tCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAGGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAACTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCaa > 1:1090227/1‑149 (MQ=255) gcTAAACAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATCACTCCAAAGGACGCGCAAACGTTAGTTGAAGTTCAACCGCACCTGGCACTTGGCAGGCGCGTTAAAGGTCTGTAGAGATACGGTCCGCGCTTCGAGGGTAATAATGAAAAGcga > 1:617836/2‑147 (MQ=255) cTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAg < 2:132088/149‑1 (MQ=255) cTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAg > 2:936255/1‑149 (MQ=255) taatGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAGTtata < 2:264168/149‑1 (MQ=255) taatGCCCGTCAAGGATCCGACGGGAATTACTGTGAAGGATGCGCAAATGGTATCTGTAGGTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTACTAATGAAAAGCAAGTtata < 2:1055193/149‑1 (MQ=255) tGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGCAAAGAAAGTTATAttt > 1:1147085/1‑149 (MQ=255) cccGGCAAGGATTTGACGGGCATTACGGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTCGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAGTTATATTTTc < 2:294841/149‑1 (MQ=255) ccGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGTAAAGCAAGTTATATTTTcc > 2:1190311/1‑149 (MQ=255) ccGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAGAAGCAAGTTATATTTTcc > 1:1033041/1‑149 (MQ=255) aGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAGTTATATTTTCCAGTGAt < 2:1599336/149‑1 (MQ=255) | TTCAGCGCCTATACCGATGCTAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAGTTATATTTTCCAGTGAT > CP009273/389785‑390075 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |