| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 3470143 = | 103 (0.880) | 3 (0.030) +GCCGATAACATTTGACGCAATGCGCACT |
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| ? | NC_000913 | = 4177184 | 120 (1.020) | intergenic (+56/‑174) | tufB/secE | translation elongation factor EF‑Tu 2/preprotein translocase membrane subunit | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
CGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTACGGCCGCCTTCACGGATTGCGAAACGCAGACCGTCGTCCATCGCGATCGGGTGGATCAGGGTAACAACCATTTTGATGTTGTCGCCCGGCATTACCATCTCTACGCCTTCCGGCAGTTCGATGGTACCAGTCACGTCAGTAGTACGGAAGTAGAACTGCGGACGGTAGCCTTTGAAGAACGGAGTATGACGGCCGCCTTCATCTTTGGACAGAATGTACACTTCAGATTCG > NC_000913/3469869‑3470415 | tAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATCTTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCACAAAGTGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAACACTATTTAACGTGTaa > 2:1089749/1‑274 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |