New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 468264 | 99 (0.770) | 4 (0.030) | 4/470 | 11.5 | 4.2% | intergenic (+34/‑119) | cof/ybaO | thiamine pyrimidine pyrophosphate hydrolase; HMP‑PP phosphatase/putative DNA‑binding transcriptional regulator |
? | NC_000913 | = 468246 | 89 (0.740) | intergenic (+16/‑137) | cof/ybaO | thiamine pyrimidine pyrophosphate hydrolase; HMP‑PP phosphatase/putative DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ACGGTGCTGACCCAACATTTAGGTTTATCGTTGCGCGATTGCATGGCCTTTGGTGATGCGATGAACGATCGCGAAATGTTAGTCAGCGTCGGTAGCGGATTTATTATGGGCAATGCGATGCCGCAACTGCGCGCGGAGCTCCCGCATTTACCGGTGATTGGACATTGCCGAAATCAGGCTGTCTCTCACTATTTGACGCACTGGCTGGACTATCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGG‑TTTTTTTTGCGTTGAATTTGTCATTTTGTGCCGTGGTGTTTAAACCGCACAGAATAAATTGTCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATAAAATTGACCGTAAGCTGCTGGCCTTACTGCAGCAGGATTGCACCCTCTCTTTGCAGGCACTGGCTGAAGCCGTTAATCTGACAACCACCCCTTGCTGGAAGCGCCTGAAACGGCTGGAGGACGACGGTATCCTTATCG > NC_000913/467991‑468530 | aCGGTGCTGACCCAACATTTAGGTTTATCGTTGCGCGATTGCATGGCCTTTGGTGATGCGATGAACGATCGCGAAATGTTAGTCAGCGTCGGTAGCGGATTTATTATGGGCAATGCGATGCCGCAACTGCGCGCGGAGCTCCCGCATTTACCGGTGATTGGACATTGCCGAAATCAGGCTGTCTCTCACTATTTGACGCACTGGCTGGACT‑TCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGG‑TTTTTTTTg > 1:1108877/1‑281 (MQ=255) aCATTTAGGTTTATCGTTGCGCGATTGCATGGCCTTTGGTGATGCGATGAACGATCGCGAAATGTTAGTCAGCGTCGGTAGCGGATTTATTATGGGCAATGCGATGCCGCACCTGCGCGCGGAGCTCCCGCATTAACCGGTGATTGGACATTGCCGAAATCAGGCTGTCTCCCACTATTTGAAGCACTGGCTGGACTATCCACACCTACCTTATTGCCCCGTATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGACCGG‑ATTTTTGTGGGTTGAATTTGTc > 1:1249712/1‑281 (MQ=255) aCATTTAGGTTTATCGTTGCGCGATTGCATGGCCTTTGGTGATGCGATGAACGATCGCGAAATGTTAGTCAGCGTCGGTAGCGGATTTATTATGGGCAATGCGATGCCGCAACTGCGCGCGGAGCTCCCGCATTTACCGGTGATTGGACATTGCCGAAATCAGGCTGTCTCCCACTATTTGACGCACTGGCTGGACTATCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTTCCCGG‑TTTTTTTTGCGTTGACttttg > 2:179716/1‑278 (MQ=255) gTTTATCTTTGCGCGTTTTCTTGGCCTTTGTTAGTGCGATGAACGTACGCGAAATGTTAGTCAGCGGCGGTAGCGTATTTATTATGGGCAATGGGATGCCGCAACTGCGCGCGGAGCGCCCGCATTTACCGGTGATTGGACATTGCCGAAATCAGGCTGTCTCTCACTATTTGACGCACTGGCTGGACTATCCACAGCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGG‑TTTTTTTTGCGTTGAATTTGTCATTTtgtg < 2:1008648/281‑1 (MQ=255) tATCGTTGCGCGATTGCATGGCCTTTGGTGATGCGATGAACGATCGCGAAATGTTAGTCAGCGTCGGTAGCGGATTTATTATGGGCAATGCGATGCCGCAACTGCGCGCGGAGCTCCCGAATTTACCGGGGATTGGGCATTGCCGAAATAAGGCTGTCTCGCACTATTTGACGCAATGGCTGGACGAGCAACATCTACCTTATTCCCCCGAATAAAGAGATCCCTTCAAGCACCCGGCAATTGCCCGG‑GTGTGTTTGCGTGGAATGTGTCCTTTTGTGCCg > 2:209132/1‑281 (MQ=255) tATCGTTGCGCGATTGCATGGCCTTTGGTGATGCGATGAACGATCGCGAAATGTTAGTCAGCGTCGGTAGCGGATTGATTATGGGCAATGCGATGCCGCAACTGCGCGCGGAGCTCCCGCATGTAACGGTGATTGGCCATTGCCGAAATCAGGCTGTCTCTCACTATTTGACGCACTGCCTGGACTATCCACATCTACCTTATTCCCCCCAATAACGAGCCCCCTTCACGCACCGGGCAATTGCCCGG‑TTTGTTTTGTGTTGTATTTGCTAtttgaggcgg > 2:243044/1‑274 (MQ=255) ttCGTTGCGGTGTTTCATTGCCTTTGGTGATGCGATGAACTATCGCGAAATGTTAGTCAGCGTCGGTAGCGGATTTATTATGGGCAATGCGATGCCGCAACTGCGCGCGGAGCTCCCGCATTTACCGGTGATTGGACATTGCCGAAATCAGGCTGTCTCTCACTATTTGACGCACTGGCTGGACTATCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGG‑TTTTTTTTGCGTTGAATTTGTCATTTTGTGCCgt < 2:492604/280‑1 (MQ=255) ctCGTTGCGCGATTTCATGGCCTTTGGTGATGCGATTAACGATCGCGAAATGTTAGTCAGCGTCGGTAGCGGATTTATTATGGGCAATGCGATGCCGCAACTGCGCGCGGAGCTCCCGCATTTACCGGTGATTGGACATTGCCGAAATCAGGCTGTCTCTCACTATTTGACGCACTGGCTGGACTATCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGG‑TTTTTTTTGCGTTGAATTTGTCATTTTGTGCCgt < 2:568565/280‑1 (MQ=255) aTCGTTGCGGTATTGCATGGTCTTTCGTGGTGCGATGAAAGGTCGGGGAATGGTACGCAGCGTCGGTAGCAGATTTATTATGGGCAGTGCGATGCCGCAACGCGGCGCGGAGCTCCCGCATTTACCGGTGATTGGACGTTGCCGAAGTCAGGCGGTGTCTAACTAATTGACGCTGTGGCTGGACTATCCAAATTTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGG‑GTTTTTTTGCGTTGAATTTGTCATTTTGTGCCgt < 2:86789/281‑1 (MQ=255) aTCGTTGCGCGATTGCATGGCCTTTGGTGGTGCGGTGAACGCTCGCGAAATGTTAGTCAGCGTCGGTCGCGGATTTATTATGGGCAATGCGATGCCGCAACTGCGCGCGGAGCTCCCGCATTTACCGGTGATTGGACATTGCCGAAATCAGGCTGTCTCTCACTATTTGACGCACTGGCTGGACTATCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGG‑TTTTTTTTGCGTTGAATTTGTCATTTTGTGCCgt < 1:843366/281‑1 (MQ=255) aTCGTTGCGCGATTGCATGGCCTTTGGTGATGCGATGAACGATCGCGAAATGTTAGTCAGCGTCGGTAGCGGATTTATTATGGGCAATGCGATGCCGCGACTGCGCGCGGAGCTCCCGCATTTACCGGTGATTGGACATTGCCGAAATCAGGCTGTCTCTCACTATTTGACGCACTGGCTGGACTATCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGCCAATTGCCCGG‑TTTTTTTTGCGTTTAATTTGTCATTTTGTGcctt > 2:797426/1‑279 (MQ=255) aTCGTTGCGAGATTGCATGGCCTTTGGTGATGGGATGACAGATCGCGAAATGTTAGTCAGCGTTGGTAGGGGATTTATTATGGGCAATGCGATTCCGCAACTGCGCGCGGAGCTCCCGCATTTACCGGTGATTGGACATTGCCGAAATCAGGCTGTCTCTCACTATTTGACGCACTGGCTGGACTATCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGG‑TTTTTTTTGCGTTGAATTTGTCATTTTGTGCCgt < 2:1011177/281‑1 (MQ=255) ttGCGGGATTGCATGGCCTTTGGTGGTGAGATGAACGACGGCGGAAGGTTAGTCAGCGTCGGTGGCGGATTTATTATGGGCAATGCGATGCCGCAACTGCGCGCGGAGCTCCCGCATTTACCGGTGATTGGACATTGCCGAAATCAGGCTGTCTCTCACTATTTGACGCACTGGCTGGACTATCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGG‑TTTTTTTTGCGTTGAATTTGTCATTTTGTGCCgt < 2:1028068/277‑1 (MQ=255) tGCGCGATTGCATGGCCTTTGGTGATGCGATGAACGATCGCGAAATGTTAGTCAGCGTCGGTAGCGGATTTATTATGGGCAATGCGATGCCGCAACTGCGCGCGGAGCTCCCGCATTTACCGGTGATTGGACATTGCCGAAATCAGGCTGTCTCTCACTATTTGACGCACTGGCTGGACTATCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGG‑TTTTTTTTGCGTTGAATTTGTCATTTTGTGCCGTGgtgt < 2:864772/281‑1 (MQ=255) gcgcGATTGCATGGCCTTTGGTGATGCGATGAACGATCGCGAAATGTTAGTCAGCGTCGGTAGCGGATTTATTATGGGCAATGCGATGCCGCAACTGCGCGCGGAGCTCTCGCATTTACCGGTGATTGGACATTGCCGAAATCAGGCTGTCTCTCACTATTTGACGCACTGGCTGGACTATCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTACAGCACCGGGCAATTGCCCGG‑TTGTTTTTGCGTTGAATTTGTCATTTTGTGCCgtgg > 1:1028068/1‑277 (MQ=255) gcgcGATTGCATGGCCTTTGGTGATGCGATGAACGATCGCGAAATGTTAGTCAGCGTCGGTAGCGGATTTATTATGGGCAATGCGATGCCGCAACTGCGCGCGGAGCTCCCGCATTTACCGGTGATTGGACATTGCCGAAATCAGGCTGTCTCTCACTATTTGACGCACTGGCTGGACTATCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGG‑TTTTTTTTGCGTTGAATTTGTCATTTTGTGCCgt < 2:800024/275‑1 (MQ=255) gcgcGATTGCATGGCCTTTGGTGATGCGATGAACGATCGCGAAATGTTAGTCAGCGTCGGTAGCGGATTTATTATGGGCAATGCGATGCCGCAACTGCGCGCGGAGCTCCCGCATTTACCGGTGATTGGACATTGCCGAAATCAGGCTGTCTCTCACTATTTGACGCACTGGCTGGACTATCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGG‑TTTTTTTTGCGTTGAATTTGTCATTTTGTGCCgt > 1:800024/1‑275 (MQ=255) gcgcGATTGCATGGCCTTTGGTGATGCGATGAACGATCGCGAAATGTTAGTCAGCGTCGGTAGCGGATTTATTATGGGCAATGCGATGCCGCAACTGCGCGCGGAGCTCCCGCATTTACCGGTGATTGGACATTGCCGAAATCAGGCTGTCTCTCACTATTTGACGCACTGGCTGGACTATCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGG‑TTTTTTTTGCGTTGAATTTGTCATTTTGTGCCGTGgtgt > 1:506397/1‑280 (MQ=255) cgcgATTGCATGGCCTTTGGTGATGCGATGAACGATCGCGAAATGTTAGTCAGCGTCGGTAGCGGATTTATTATGGGCAATGCGATGCCGCAACTGCGCGCGGAGCTCCCGCATTTACCGGTGATTGGACATTGCCGAAATCAGGCTGTCCCTCACTATTTGACGCACTGGCTGGACTATCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCCTCCAGCCCCGGCCAATTGCCCGG‑TTTTTTTTGCGTTCAATTTGTCATTTTCTTCCGTTgtgtg > 2:1257588/1‑279 (MQ=255) gATTGCATGGCCTTTGGTGATGCGATGAACGATCGCGAAATGTTAGTCAGCGTCGGTAGCGGATTTATTATGGGCAATGCGATGCCGCAACTGCGCGCGGAGCTCCCGCATTTACCGGTGATTGGACATTGCCGAAATCAGGCTGTCTCTCACTATTTGACGCACTGGCTGGACTATCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGG‑TTTTTTTTGCGTTGAATTTGTCATTTTGTGCCGTGGTGTTTaaa < 1:664916/281‑1 (MQ=255) gCATGGCCTTTGGTGATGCGATGAACGATCGCGAAATGTTAGTCAGCGTCGGTAGCGGATTTATTATGGGCAATGCGATGCCGCAACTGCGCGCGGAGCTCCCGCATTTACCGGTGATTGGACATTGCCGAAATCAGGCTGTCTCTCACTATTTGACGCACTGGCTGGACTATCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGG‑TTTTTTTTGCGTTGAATTTGTCATTTTGTGCCGTGGTGTTTAAACCGc < 1:402412/281‑1 (MQ=255) gCATGGCCTTGGTTGAGGCGCATAACGATCGCGAAATGTTATTCGGCGTCGGTAGCGGATTTATTTTGGGCGATGCGATGCCGCAACTGCGCGCGGAGCTCCCGCATTTACCGGTGATTGGACATTGCCGAAATCAGGCTGTCTCTCACTATTTGACGCACTGGCTGGACTATCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGG‑TTTTTTTTGCGTTGAATTTGTCATTTTGTGCCGTGGTGTTTAAACCGc < 2:241001/281‑1 (MQ=255) 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tGCGATGAACGATCGCGAAATGTTAGTCAGCGTCGGTAGCGGATTTATTATGGGCAATGCGATGCCGCAACTGCGCGCGGAGCTCCCGCATTTACCGGTGATTGGACATTGCCGAAATCAGGCTGTCTCTCACTATTTGACGCACTGGCTGGACTATCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGG‑TTTTTTTTGCGTTGAATTTGTCATTTTGTGCCGTGGTGTTTAAACCGCACAGAAt > 1:1067418/1‑272 (MQ=255) cGATCGCGAAATGTTAGTCAGCGTCGGTAGCGGATTTATTATGGGCAATGCGATGCCGCAACTGCGCGCGGAGCTCCCGCATTTACCGGTGATTGGACATTGCCGAAATCAGGCTGTCTCTCACTATTTGACGCACTGGCTGGACTATCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGG‑TTTTTTTTGCGTTGAAt > 2:1020328/1‑225 (MQ=255) cGATCGCGAAATGTTAGTCAGCGTCGGTAGCGGATTTATTATGGGCAATGCGATGCCGCAACTGCGCGCGGAGCTCCCGCATTTACCGGTGATTGGACATTGCCGAAATCAGGCTGTCTCTCACTATTTGACGCACTGGCTGGACTATCCACATCTACCTTATTCCCCCGAATAACGAGATCCCTTCCAGCACCGGGCAATTGCCCGG‑TTTTTTTTGCGTTGAAt < 1:1020328/225‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |