| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 54959 = | 158 (1.230) | coding (2151/2355 nt) | lptD | LPS assembly OM complex LptDE, beta‑barrel component | |||||
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Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
AAGCAGCGTTTTCCAGTTCTTCATACTTTTTCCATTTCAATTAACCGCACTGCGGATTACGTGGTAAATCAACAAATCACAAAGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTG‑TATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGCCCCAACAATGGACCAACGATCGGCAATTGGCCAGCTGGCGACAGCACCTACCTGCGAAATACCATTCTTATATTGCTCAGCAGTGGAATAGTACTTAGGCAGCGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCATCCCGACGGTATTCAATGCTGGAGTTACTGGTCGCTACGTTATCCAGACGTGTATCGTACTGAATCCCG > NC_000913/54679‑55238 | tCCCGTTCTTCATACTTTTTCCCTTTCAATTAACCCCACTGCGGATTACGTGGTAAATCAGCAAATCCCAAATTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGGACGCCTCATCTCTTGCGTACCCAGGCCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAACGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTG‑TATTGCACACCTAACATAGAGt < 2:621157/280‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |