New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4502104 | 194 (1.220) | 4 (0.030) | 4/482 | 14.8 | 2.2% | noncoding (1412/1426 nt) | IS4 | repeat region |
? | NC_000913 | = 4502108 | 175 (1.150) | noncoding (1408/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
AATCGTTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4501815‑4502104 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccagtcagttGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGACAG < NC_000913/4502108‑4501830 AATCGTTCAGATACACGGTCGGTTATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTTCCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATG < 1:836044/280‑1 TCGTTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCA > 1:405333/1‑281 GTTCCTAGACACTGTCGTTGATCCGCTAAAAAATGCCTTAAGTTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCA < 1:1518662/279‑1 GTTCATATACACTGTCGGTGATACGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTACCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCATTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCA < 1:403884/279‑1 TTCGTATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGT < 2:205389/280‑1 TTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTC > 2:1097234/1‑281 tctacgccaTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTGAATGTTGAATTCCTCTAACCCCTACCAATTAAGGGCCATAGCCGGTCACGCAACTGGCTGATTCGATCAGTCTAGTGTCTTTTGTTCCGTTGGGCTGCTGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGACGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCTTTTGAAACCAGATAATTTAACAGTCAATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGCTTCTGAAATGCCAGTCAGTT < 2:842138/272‑1 TGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTC > 1:1078206/1‑270 TGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTC < 2:1078206/270‑1 TGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGGTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGATGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGCTCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCCTGGGGACACACAAGCTCAGTCTTCTAAGTGGCAACCAGATAATTCAACAGTTGATGCTGAAAAGAAATAGGCACCTTGGTCCTGTAACTCCCGTCAGgtcacac > 2:226283/1‑272 TCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTC > 2:946838/1‑268 TCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTC < 1:946838/268‑1 CGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCA > 1:196429/1‑226 CGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCA < 2:196429/226‑1 GGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCATTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTC < 1:765907/211‑1 GGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTC > 2:765907/1‑211 AAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATATTGGTACTGTAATGCCAGTTAGTTGCTTAAATGACTGTCATTACAGAAACAAGATGCCTATGTCGTTTCAGCATCAACTGTTACATCATCTGGTTTCCAACGAGAAGACTGAGATTTTTCGTCCCCAAGACTGACCGTAAACGCCACAATCTGTGACTGTTTGACATTGTAATGCACGACGGCCACCGCATCTAAATACATTAGACTGCTTGC > 2:1424640/1‑281 AGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCA > 1:1097234/1‑279 TCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCTAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACTGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTTATATTGTCATGCCCCCAGGTCAGCGGATCTAACAACATTAGACTGATTGCATCATCCAGTTGCGTAT > 1:490822/1‑281 TAATGCCATTCAGTTGCGTAACTGACTTGCATTACAGATCCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAGATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGC < 1:1424640/281‑1 CCAGTCAGTTGCTTAACTGAATGGCATTACAGAACCAAGATGCGTATTTCGTATCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCAGGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACAGTAGACTGCGTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCAT < 1:1086499/280‑1 AGTCAGTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTT > 2:765812/1‑138 AGTCAGTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTT < 1:617758/138‑1 AGTCAGTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTT < 1:765812/138‑1 AGTCAGTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTT > 2:617758/1‑138 GTCGGTTGCTTAACTGACTGGCATTACATAACCAAGATTCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGTGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACC < 2:718902/281‑1 GTCAGTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACC < 1:1043063/281‑1 GTCAGTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACC < 1:254266/281‑1 GTTGCTTAACTTGCTTGCATTACAGAACCAAGTTGCCTATTTCGGTTCAGCATTAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGA < 2:807259/279‑1 GTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGGTGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGCCTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGCCTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGA < 1:194604/279‑1 GTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATTCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGA < 1:1115530/279‑1 GTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGA < 1:812900/279‑1 GTTCCTTAACTAACTGGCATTACAGATCCAAAATTCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGA < 2:483871/279‑1 TTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGACAG < 1:417713/281‑1 TTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGACA < 2:280954/280‑1 TTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGACA < 1:793681/280‑1 TTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGACA < 1:1541156/280‑1 TTGCGTAATTGATTGACAGTACAGTACTAAGATGTCTATGTCCTGTCAGCATCTACGGTTAGATTATCTGGTTGCCAACAAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCACTGGACTAACCGTCAACGCCACAATCTTTGGCTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTCGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGACA < 1:1255506/280‑1 TGCTTAACTGACTGTCATTACAGAACCAAGATTCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGCCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGACA < 1:1324966/279‑1 TGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGACA < 1:1315588/279‑1 TGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGACA < 1:1335223/279‑1 TGCTTAACTGAAGAGCATTACAGAACCCAGATGCCTATTTCGTTTCATCATCAACTGGTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCCAGACTGACCGTCAACACCACAATCTTTTACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGACCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCTTCACCGACA < 2:1531925/279‑1 AATCGTTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4501815‑4502104 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccagtcagttGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGACAG < NC_000913/4502108‑4501830 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |