| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3288017 = | 236 (0.980) | 4 (0.020) | 4/474 | 19.9 | 1.7% | intergenic (+7/‑73) | yraH/yraI | putative fimbrial‑like adhesin protein/putative periplasmic pilin chaperone |
| ? | NC_000913 | 3288049 = | 229 (1.010) | intergenic (+39/‑41) | yraH/yraI | putative fimbrial‑like adhesin protein/putative periplasmic pilin chaperone | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
ATGGCACCGTCCCTAACTTCCCTAATCTGGCAAAAGTAGGCTCTTTTGCTGGCATAGCGGCAACAGGTGTGGGTATCCGTATTGACGATGCGGAAAGCGGAAACATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCTCGTTGTATCAGGTTGAAAAATAACTATGTCAAAACGAACATTCGCGGTGATATTAACCTTGTTGTGTAGCTTCTGTATTGGCCAGGCGCTTGCAGGAGGAATCGTTTTACAGCGAACGCGAGTGATCTATGATGCCAGCCGCAAAGAGGCTGCGTTACCTGTCGCAAACAAAGGCGCAGAAACGCCTTATTTACTGCAATCATGGGTAGATAATATAGATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTT > NC_000913/3287733‑3288305 | tcacTAACTTCCCTAATCTGGCAAAAGTAGGCTCTTTTGCTGGCATAGCGGCAACAGGTGTGGGTATCCGTATTGACGATGCGGAAAGCGGAAACATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACATCATCGCTTACTACGTAACAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGTAAGCAGATGATAACGTTAACGTAACGCTGGATTACCCTTAATACGGTatg > 2:1205717/4‑276 (MQ=255) cccTAACTTCCCTAATCTGGCAAAAGTAGGCTCTTTTGCTGGCATAGCGGCAACAGGTTTGGGTATCCGTATTGACGATGCGGAAAGCGGAAACATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGAc < 1:80945/289‑1 (MQ=255) cccTAATCTGGCAAAAGTAGGCTCTTTTGCTGGCATAGCGGCAACAGGTGTGGGTATCCGTATTGACGATGCGGAAAGCGGAAACATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTATCGCTGGATTGCCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGAt > 1:340833/1‑289 (MQ=255) cccTAATCTGGCAAAAGTAGGCTCTTTTGCTGGCATAGCGGCAACAGGTGTGGGTATCCGTATTGACGATGCGGAAAGCGGAAACATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAAAGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGAt > 1:2210321/1‑289 (MQ=255) aaTCTGGCAAAAGTAGGCCCGTTTGCTGGCAAGGCGGCAACAGGTGTGGGGATCCGTATTGACGATGCGGAAAGCGGAAACATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACg < 2:933564/289‑1 (MQ=255) aTCTGGCAAAAGTAGGCTCTTTTGCTGGCATAGCGGCAACAGGTGTGGGTATCCGTATTGACGATGCGGAAAGCGGAAACATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACg > 1:521787/1‑288 (MQ=255) aGGCTCTTTGGCTGGCATAGCGGCAACAGGGGTGGGTATCCTGATTGACGATGCGGAAAGCGGAAACATTATGCCACGGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTtccttcct < 2:1902032/289‑1 (MQ=255) gCTCTTTTGCTGGCATAGCGGCAACAGGTGTGGGTATCCGTATTGACGATGCGGAAAGCGGAAACATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTc < 1:2152956/265‑1 (MQ=255) ttGCTGGCATAGCGGCAACAGGTGTGGGTATCCGTATTGACGATGCGGAAAGCGGAAACATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCTCg < 1:214285/289‑1 (MQ=255) ggTATCCGTATTGACGATGCGGAAAGCGGAAACATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCTCg < 2:1550757/263‑1 (MQ=255) ggTATCCGTATTGACGATGCGGAAAGCGGAAACATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCTCg > 1:1550757/1‑263 (MQ=255) aTCCGTATTGACGATGCGGAAAGCGGAAACATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGAc < 2:653104/225‑1 (MQ=255) aTCCGTATTGACGATGCGGAAAGCGGAAACATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGAc > 1:653104/1‑225 (MQ=255) ccGTATTGACGATGCGGAAAGCGGAAACATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCTCg > 2:896022/1‑258 (MQ=255) cGTATTGACGATGCGGAAAGCGGAAACATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCTCGTTGTATCAGGTTGAAAAATAACTATGTCaaa > 1:2014641/1‑288 (MQ=255) gcggaaagcggaaaCATTATGCCACTTAATGCCATTGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTGGACCTCGTCGCGTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCTCGTTGTATCAGGTTGAAAAATAACTATGTCAAAACGAACATTcgcg < 2:1744117/289‑1 (MQ=255) gcggaaagcggaaaCATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCTCGTTGTATCAGGTTGAAAAATAACTATGTCAAAACGAACATTcgcg < 2:1788690/289‑1 (MQ=255) gcggaaagcggaaaCATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCTCGTTGTATCAGGTTGAAAAATAACTATGTCAAAACGAACATTcgcg > 2:1988847/1‑289 (MQ=255) gcggaaagcggaaaCATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCCCGTTGTATCCGGTTGAAAAATAAATATGTCAAAACGAACATTcccg > 2:2178262/1‑289 (MQ=255) ggaaagcggaaaCATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCTCGTTGTATCAGGTTGAAAAATAACTATGTCAAAACGAACATTCGCgg < 1:1405107/288‑1 (MQ=255) ggaaagcggaaaCATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCTCGTTGTATCAGGTTGAAAAATAACTATGTCAAAACGAACATTCGCgg < 1:2311560/288‑1 (MQ=255) gaaagcggaaaCATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCTCGTTGTATCAGGTTGAAAAATAACTATGTCAAAACGAACATTCGCGGt < 1:2055617/288‑1 (MQ=255) agcggaaaCATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCACGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTCGGGAGTTATATGACCTGGCAGATAACGACCTTTTCCTTCATCTTTCTCGTTTTATCAGGTCGACAAATAAATANATCAAAACGCACATTCCGGGTgtca > 2:1375165/1‑286 (MQ=255) cggaaaCATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCTCGTTGTATCAGGTTGAAAAATAACTATGTCAAAACGAACATTCGCGGTGatat < 1:602052/288‑1 (MQ=255) ccACTGAAGGCTATGGTCAATGATAACTCGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGGTGGCCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAAGGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCTCGTTGTATCAGGTTGAAAAATAACTATGTCAAAACGAACATTCGCGGTGATATTAACCTTGTTgtgt < 2:620042/289‑1 (MQ=255) 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cccGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTACCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCTCGTTGTATCAGGTTGAAAAATAACTATGTCAAAACGAACATTCGCGGTGATATTAACCTTGTTGTGTAGCTTCTGTATTGGCCAGGCGCTTGCAGGAGGAATCGtttt > 2:1480010/1‑289 (MQ=255) gcggAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCCCGTTGTATCCGGTTGAAAAATAACTATGTCAAAACGTACATTAGCGGTGATATTAACCTTGGTGTGTTGCTTCTGAATTTGCCAGGCGCTTACAGGAGGGATCGTTTTACAg > 2:1222218/1‑289 (MQ=255) cggAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATC‑ACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCTCGTTGTATCAGGTTGAAAAATAACTATGTCAAAACGAACATTCGCGGTGATATTAACCTTGTTgtgt < 2:1153920/243‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |