| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 4,037,226 | C→G | 8.6% | intergenic (+9/‑34) | ileT → / → alaT | tRNA‑Ile/tRNA‑Ala |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,037,226 | 0 | C | G | 8.6% | 274.8 / 26.9 | 117 | intergenic (+9/‑34) | ileT/alaT | tRNA‑Ile/tRNA‑Ala |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (48/57); new base G (3/7); total (53/64) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.08e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.25e-01 | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
AGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCATCTCTGTAGTGATTAAATAAAAAATACTTCAGAGTGTACCTGCAAAGGTTCACTGCGAAGTTTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTTTCGCAACACGATGATGAATCGAAAGAAACAT > NC_000913/4036948‑4037505 | cgTGGGTTGCAAAAGGAGTAGGTAGCTTAACCGTCGGGAGGGGGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTTGGGTGAAGTCGGAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCCCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGGAGTGCTCACACAGATTGTCTGAAGAAAATGAGCAGAAAAACCTCTACAGGCTTGTACCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTTGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACgg < 2:815273/280‑1 (MQ=11) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |