New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 2626287 = | 189 (1.020) | 4 (0.020) | 4/458 | 15.1 | 2.1% | coding (1173/1542 nt) | ppx | exopolyphosphatase |
? | NC_000913 | 2626515 = | 187 (1.040) | coding (1401/1542 nt) | ppx | exopolyphosphatase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
CCGTCATCAGGATGTGCGTAGTCGCACCGCCAGCAGCCTCGCCAACCAGTATCACATCGACAGCGAACAGGCCCGACGGGTGCTGGATACCACTATGCAAATGTACGAACAGTGGCGGGAACAGCAACCGAAGCTGGCGCATCCGCAACTGGA‑GGCGCTACTGCGATGGGCCGCCATGCTGCA‑TGAGGTCGGGTTGAATATCAACCACAGCGGTTTGCATCGCCACTCCGCTTATATTCTGCAAAACAGTGACTTGCCGGGTTTTAATCAGGAACAGCAGCTGATGATGGCGACACTGGTGCGCTATCACCGTAAAGCGATTAAGCTCGACGATCTACCGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTGGCGTATTACTCAACAATCAACGTCAGGCAACCACCACACCGCCAACATTGACGCTGATTACTGATGACAGTCACTGGACACTGCGTTTCCCGCATGACT > NC_000913/2626041‑2626537 | cactcatcaGGATGTCCGTAGTCGAACCGCCAGCGGCCTCGCCAACAAGGAGAGCATCGAACGCGAACAGGCCCGACGGGGGCTGGATACCACTATGACAATGTACGGGCAGTGGCGGGAACAGCAAGCGAGACGGGCGCATCCGCAACTGGA‑GGCGCTACTGCGATGGGCCGCCATGGTGCA‑TGAGGTCGGGTTGAATATCAACCACAGCGGTTTGCATCGCCACTCCGCTTATATTCTGCAAAACAGTg < 1:797126/248‑1 (MQ=255) 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tcatcaGGATGTGCGTAGTCGCACCGCCAGCAGCCTCGCCAACCAGTATCACATCGACAGCGAACAGGCCCGACGGGTGCTGGATACCACTATGCAAATGTACGAACAGTGGCGGGAACAGCAACCGAAGCCGGCGCATCCGCAACTGGA‑GGGGCTACTTCGATGGGCCGCCATGCTGCA‑TGAGGTCGGGTTGAATATCAACCACAGCGGTTTGCATTGCCACTCCCCTTATATTTTGCAAAAccacgtct > 2:293218/1‑244 (MQ=255) tcatcaGGATGTGCGTAGTCGCACCGCCAGCAGCCTCGCCAACCAGTATCACATCGACAGCGAACAGGCCCGACGGGTGCTGGATACCACTATGCAAATGTACGAACAGTGGCGGGAACAGCAAACGAAGCTCGCGCATCCGCAACTGGA‑GGGGCTACCTCGATGGGGAGCACTGCTGCACTAGGGTGGGGTTGAA‑AGCAACAAAAAGGGGTTGCATTCCCAACCCGGTTATATTCGTCAAAACAGGGAcc > 1:94425/1‑250 (MQ=255) cGTAGTCGCACCGCCAGCAGCCTCGCCAACCAGTATCACATCGACAGCGAACAGGCCCGACGGGTGCTGGATACCACTATGCAAATGTACGAACAGTGGCGGGAACAGCAACAGAAGCTGGCGCATCCGCAACAGGA‑GGCGCTAGTGGGATGGGCCGCCATGCTGCA‑TGAGGTCGGGTTGAATATCAACCACAGGGGGTTGCATCGCCCCCCCGCTTATATTCTGCAAAACAGGGACTGGCCGGGTTTTaa > 1:432897/1‑251 (MQ=255) 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cAGTGACTTGCCGGGTTTTAATCAGGAACAGCAGCTGATGATGGCGACACTGGTGCGCTATCACCGTAAAGCGATTAAGCTCGACGATCTACCGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTGGCGTATTACTCAACAATCAACGTCAGGCAACCACCACACCGCCAACATTGACGCTGATTACTGATGACAGTCACTGGACACTGCGTTTACCGCATGACt > 2:585432/1‑251 (MQ=255) | CCGTCATCAGGATGTGCGTAGTCGCACCGCCAGCAGCCTCGCCAACCAGTATCACATCGACAGCGAACAGGCCCGACGGGTGCTGGATACCACTATGCAAATGTACGAACAGTGGCGGGAACAGCAACCGAAGCTGGCGCATCCGCAACTGGA‑GGCGCTACTGCGATGGGCCGCCATGCTGCA‑TGAGGTCGGGTTGAATATCAACCACAGCGGTTTGCATCGCCACTCCGCTTATATTCTGCAAAACAGTGACTTGCCGGGTTTTAATCAGGAACAGCAGCTGATGATGGCGACACTGGTGCGCTATCACCGTAAAGCGATTAAGCTCGACGATCTACCGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTGGCGTATTACTCAACAATCAACGTCAGGCAACCACCACACCGCCAACATTGACGCTGATTACTGATGACAGTCACTGGACACTGCGTTTCCCGCATGACT > NC_000913/2626041‑2626537 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |