Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,560,455 | 1 | . | G | 96.0% | 567.6 / 9.5 | 176 | intergenic (‑2/+1) | glpR/glpR | pseudogene, DNA‑binding transcriptional repressor;regulator; Energy metabolism, carbon: Anaerobic respiration; repressor of the glp operon/pseudogene, DNA‑binding transcriptional repressor;regulator; Energy metabolism, carbon: Anaerobic respiration; repressor of the glp operon |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.46e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
TTCTTTTACCATCAACGTGTTAGCAACGTTGAGATTGTTGGTGACAATGCGCAAATTGCTGTGATTGAGCAGTGCGTGCGCTACCGCTTCCGGCGTGGTGCCGATATCGATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCC‑ATGAT‑G‑G‑C‑CA‑GGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGTGACGTTGTGTTTGTTTCATTTATAAATCCCTGGAATTATTTTCGTTTTCGCGCATTGAGCGAATCAACAAAAGCCATCGCTAAACCCACGGCTAACCCGGCGATGTGTGCTC > NC_000913/3560208‑3560698 | tgcttTTACCATTAACGTGTTAGAAGCGTGGGGAGTGGTTGTGCCGATGCGCAGAGTGGTGAGATTGAGCAGTGCGTGAGCTACCGCTTCAGGCGTGGTACGGATATAGATGAACGGGGTCAAGCCATTGGGTATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCGTTTTCTTCGGTCTAGGTGGCCTTGCGATCGTGCCCCGGGGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAAGGCCGCACAGCC‑GTGAT‑G‑G‑cgca < 2:334223/249‑4 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |